More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2703 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2703  integron integrase  100 
 
 		 323 aa  653    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0410  integron integrase  65.62 
 
 		 334 aa  427  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.761535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3427  integron integrase  64.58 
 
 		 327 aa  423  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3006  integron integrase  64.47 
 
 		 334 aa  424  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.976928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3366  integron integrase  62.86 
 
 		 332 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.341619 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2714  integron integrase  62.86 
 
 		 332 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1215  integron integrase  62.34 
 
 		 326 aa  391  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2249  putative transcriptional regulator, TetR family  58.86 
 
 		 325 aa  391  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0257  integron integrase  58.1 
 
 		 338 aa  371  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0364142  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0696  phage integrase  61.39 
 
 		 338 aa  370  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0977  integron integrase  53.92 
 
 		 329 aa  352  5.9999999999999994e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1799  integron integrase  54.43 
 
 		 462 aa  336  2.9999999999999997e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.174616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0120  integrase/recombinase  54.4 
 
 		 337 aa  334  1e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.400978 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0067  integrase/recombinase  54.4 
 
 		 337 aa  334  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.325485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5342  integrase/recombinase  54.4 
 
 		 337 aa  332  4e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0143  integrase IntI1 for transposon Tn21  54.09 
 
 		 337 aa  332  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0542  integrase  52.38 
 
 		 330 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1377  site-specific recombinase XerD  50.63 
 
 		 333 aa  325  9e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000056918  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1844  DNA integrase  48.73 
 
 		 335 aa  322  7e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03940  site-specific recombinase  60.37 
 
 		 291 aa  318  1e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.781769  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1145  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 408 aa  314  9.999999999999999e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.239655 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0779  integron integrase  45.91 
 
 		 320 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000312296  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1355  phage integrase family site specific recombinase  51.12 
 
 		 318 aa  301  1e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0938  site-specific recombinase IntI4  49.69 
 
 		 320 aa  300  3e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000827497  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3204  integron integrase  47.92 
 
 		 322 aa  299  4e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4396  integron integrase  55.17 
 
 		 318 aa  295  6e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.970236  normal  0.0224938 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1393  integron integrase  47.52 
 
 		 324 aa  295  8e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.597371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2132  integron integrase  48.25 
 
 		 319 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290373 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0425  XerC/CodV family integrase/recombinase  46.39 
 
 		 373 aa  287  1e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607346  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2037  phage integrase family site specific recombinase  48.24 
 
 		 319 aa  287  2e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3360  integron integrase  48.56 
 
 		 319 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1682  integron integrase  48.56 
 
 		 319 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4307  integron integrase  45.05 
 
 		 319 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1720  integron integrase  47.92 
 
 		 319 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.945826  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1131  integron integrase  44.79 
 
 		 319 aa  277  1e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0534  site-specific recombinase IntIA  43.4 
 
 		 327 aa  278  1e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4643  integron integrase  45.11 
 
 		 319 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003169  integron integrase IntI4  47.17 
 
 		 320 aa  277  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02003  integrase  48.03 
 
 		 318 aa  273  3e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2645  integron integrase  45.11 
 
 		 319 aa  272  6e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.400636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2866  integron integrase  55.06 
 
 		 276 aa  271  8.000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3075  integron integrase  57.51 
 
 		 232 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03738  putative integrase  44.69 
 
 		 322 aa  266  4e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0840  integron integrase  47.94 
 
 		 319 aa  261  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.623931  hitchhiker  0.00150822 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2616  integron integrase  44.55 
 
 		 468 aa  251  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2803  integron integrase  43.3 
 
 		 449 aa  249  6e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000270824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2576  integron integrase  43.63 
 
 		 453 aa  248  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00600674  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2869  integron integrase  43.63 
 
 		 452 aa  246  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000684574  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2467  bifunctional hypothetical protein/integrase  42.37 
 
 		 457 aa  243  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0383  integron integrase  64.44 
 
 		 694 aa  223  4e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241301 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1633  phage integrase family site specific recombinase  42.96 
 
 		 304 aa  218  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180477  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1843  integron integrase  43.3 
 
 		 279 aa  206  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4142  integron integrase  57.64 
 
 		 156 aa  170  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0039  integrase/recombinase  55.63 
 
 		 159 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2872  phage integrase family protein  35.29 
 
 		 279 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000984905  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4502  integrase family protein  35.83 
 
 		 290 aa  136  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3066  integrase family protein  34.2 
 
 		 390 aa  136  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0221886  normal  0.652565 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1026  integrase family protein  30.6 
 
 		 283 aa  135  7.000000000000001e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319361  normal  0.791294 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1565  phage integrase  61.11 
 
 		 114 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5165  integrase family protein  33.23 
 
 		 291 aa  133  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  33.33 
 
 		 270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1196  phage integrase  35.71 
 
 		 291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6957  integrase family protein  30.39 
 
 		 292 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4806  phage integrase  33.44 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3470  phage integrase family protein  34.98 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.229271  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6605  integrase family protein  30.07 
 
 		 292 aa  126  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7462  integrase family protein  30.07 
 
 		 292 aa  126  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7619  integrase family protein  30.07 
 
 		 292 aa  126  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0858  phage integrase  30.84 
 
 		 289 aa  125  9e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0262  integrase family protein  34.69 
 
 		 291 aa  123  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4832  phage integrase  33.44 
 
 		 291 aa  122  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  33.22 
 
 		 301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1786  phage integrase family site specific recombinase  42.86 
 
 		 150 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  31.37 
 
 		 295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3700  integrase family protein  31.09 
 
 		 295 aa  119  9e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1585  phage integrase  32.44 
 
 		 286 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.791115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0978  phage integrase family protein  29.93 
 
 		 283 aa  116  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00230  putative tyrosine recombinase  29.87 
 
 		 265 aa  116  6e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.9402  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0822  putative phage integrase  33.64 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.341397 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0068  phage integrase  31.38 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8452  integrase family protein  33.12 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.032039  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6657  integrase family protein  33.02 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.358251 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1077  integrase family protein  33.02 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  34.93 
 
 		 292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3661  integrase family protein  31.35 
 
 		 290 aa  109  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.311976  decreased coverage  0.00000149049 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3629  integrase family protein  31.35 
 
 		 290 aa  109  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1189  integrase family protein  30.23 
 
 		 287 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00933678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1162  integrase family protein  30.23 
 
 		 287 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1683  phage integrase family protein  30.23 
 
 		 287 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3109  phage integrase family protein  31.51 
 
 		 290 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2013  integrase family protein  29.57 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000617639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2736  integrase family protein  29.57 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0269003  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  32.88 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2036  phage integrase family site specific recombinase  29.9 
 
 		 287 aa  105  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  38.29 
 
 		 295 aa  105  7e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2528  phage integrase family site specific recombinase  29.9 
 
 		 287 aa  105  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2164  phage integrase family site specific recombinase  29.9 
 
 		 287 aa  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2211  phage integrase family site specific recombinase  29.9 
 
 		 287 aa  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  28.38 
 
 		 284 aa  105  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  29.22 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>