More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0373 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0373  integrase domain protein SAM domain protein  100 
 
 
259 aa  528  1e-149  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0262  integrase family protein  98.74 
 
 
291 aa  483  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1196  phage integrase  74.9 
 
 
291 aa  378  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4806  phage integrase  73.22 
 
 
291 aa  365  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0822  putative phage integrase  74.06 
 
 
291 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.341397 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6657  integrase family protein  75.86 
 
 
291 aa  348  7e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.358251 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1077  integrase family protein  75.86 
 
 
291 aa  348  7e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0826  putative phage integrase  75.43 
 
 
266 aa  345  4e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.225694 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4502  integrase family protein  71.73 
 
 
290 aa  342  2.9999999999999997e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0858  phage integrase  55.98 
 
 
289 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  55.98 
 
 
301 aa  252  4.0000000000000004e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8452  integrase family protein  56.47 
 
 
286 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.032039  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3700  integrase family protein  52.14 
 
 
295 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3470  phage integrase family protein  51.06 
 
 
302 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.229271  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0068  phage integrase  51.07 
 
 
302 aa  224  7e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3629  integrase family protein  47.44 
 
 
290 aa  211  9e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3661  integrase family protein  47.44 
 
 
290 aa  211  9e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.311976  decreased coverage  0.00000149049 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7619  integrase family protein  44.21 
 
 
292 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.192826  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6605  integrase family protein  44.21 
 
 
292 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7462  integrase family protein  44.21 
 
 
292 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105755  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6957  integrase family protein  44.21 
 
 
292 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4832  phage integrase  43.64 
 
 
291 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5165  integrase family protein  38.4 
 
 
291 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1585  phage integrase  38.72 
 
 
286 aa  142  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.791115  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0978  phage integrase family protein  34.62 
 
 
283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2872  phage integrase family protein  37.18 
 
 
279 aa  133  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000984905  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1026  integrase family protein  33.62 
 
 
283 aa  133  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319361  normal  0.791294 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1624  phage integrase family protein  34.04 
 
 
235 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1683  phage integrase family protein  35.32 
 
 
287 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1189  integrase family protein  35.32 
 
 
287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00933678  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1162  integrase family protein  35.32 
 
 
287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2036  phage integrase family site specific recombinase  34.04 
 
 
287 aa  122  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2164  phage integrase family site specific recombinase  34.04 
 
 
287 aa  122  6e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2211  phage integrase family site specific recombinase  34.04 
 
 
287 aa  122  6e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2528  phage integrase family site specific recombinase  34.04 
 
 
287 aa  122  6e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2013  integrase family protein  34.04 
 
 
287 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000617639  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2736  integrase family protein  34.04 
 
 
287 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0269003  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0466  Fis family transcriptional regulator  32.43 
 
 
362 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5312  integrase/recombinase  50.41 
 
 
137 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.169843 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2048  integrase domain-containing protein  37.5 
 
 
187 aa  115  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.212868  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1787  phage integrase family protein  31.28 
 
 
283 aa  115  8.999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2959  phage integrase family protein  31.28 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.164424 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2241  integrase family protein  34.62 
 
 
296 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000667129 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1695  phage integrase family protein  34.19 
 
 
296 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.363626  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3124  putative integrase/recombinase  49.07 
 
 
185 aa  109  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505394  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3109  phage integrase family protein  32.08 
 
 
290 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  34.7 
 
 
295 aa  103  4e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1137  phage integrase  30.9 
 
 
296 aa  101  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3066  integrase family protein  33.02 
 
 
390 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0221886  normal  0.652565 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  30.4 
 
 
270 aa  99.8  4e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00230  putative tyrosine recombinase  34.67 
 
 
265 aa  96.3  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.9402  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3204  integron integrase  28.36 
 
 
322 aa  94.7  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3427  integron integrase  30.51 
 
 
327 aa  93.6  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1799  integron integrase  31.91 
 
 
462 aa  92.8  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.174616  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0067  integrase/recombinase  30.88 
 
 
337 aa  92.4  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.325485 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0120  integrase/recombinase  30.88 
 
 
337 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.400978 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0143  integrase IntI1 for transposon Tn21  30.88 
 
 
337 aa  92  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0977  integron integrase  30.66 
 
 
329 aa  92  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5342  integrase/recombinase  30.88 
 
 
337 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2703  integron integrase  31.5 
 
 
323 aa  90.9  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0534  site-specific recombinase IntIA  26.8 
 
 
327 aa  90.9  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1723  integrase family protein  39.29 
 
 
210 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0273744  normal  0.126779 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  29.26 
 
 
284 aa  89.4  5e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1145  putative transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 
408 aa  89  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.239655 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3348  integrase domain protein SAM domain protein  47.17 
 
 
121 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0938  site-specific recombinase IntI4  28.46 
 
 
320 aa  86.7  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000827497  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  28.75 
 
 
290 aa  84.7  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0410  integron integrase  29.39 
 
 
334 aa  84  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.761535  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0805  tyrosine recombinase XerD  30.71 
 
 
300 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  26.29 
 
 
282 aa  82  0.000000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2714  integron integrase  30.28 
 
 
332 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3366  integron integrase  30.28 
 
 
332 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.341619 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02003  integrase  28.68 
 
 
318 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  31.06 
 
 
298 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0383  integron integrase  33.71 
 
 
694 aa  79.7  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.241301 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1355  phage integrase family site specific recombinase  28.1 
 
 
318 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2249  putative transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 
325 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2797  phage integrase-like SAM-like  49.3 
 
 
74 aa  79  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.554398  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2132  integron integrase  26.09 
 
 
319 aa  79  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000290373 
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  29.82 
 
 
308 aa  78.6  0.00000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0425  XerC/CodV family integrase/recombinase  28.16 
 
 
373 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607346  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  27.78 
 
 
299 aa  78.2  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003169  integron integrase IntI4  28.68 
 
 
320 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  35.17 
 
 
292 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0257  integron integrase  28.46 
 
 
338 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0364142  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0696  phage integrase  30.77 
 
 
338 aa  77.4  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  30.12 
 
 
301 aa  76.6  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  30.08 
 
 
295 aa  75.9  0.0000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  29.8 
 
 
283 aa  75.5  0.0000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  28.09 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3244  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  41.89 
 
 
78 aa  75.1  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.042229  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3075  integron integrase  31.55 
 
 
232 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  30.54 
 
 
294 aa  74.3  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0779  integron integrase  25.76 
 
 
320 aa  73.9  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000312296  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  30.51 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5043  integrase family protein  43.12 
 
 
160 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3714  tyrosine recombinase XerD  29.22 
 
 
301 aa  73.6  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  28.15 
 
 
305 aa  72.8  0.000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4307  integron integrase  23.62 
 
 
319 aa  72  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1431  phage integrase  28.63 
 
 
309 aa  72  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.145363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>