33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2797 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2797  phage integrase-like SAM-like  100 
 
 		 74 aa  152  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.554398  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3244  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  73.44 
 
 		 78 aa  103  6e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.042229  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0262  integrase family protein  49.3 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0373  integrase domain protein SAM domain protein  49.3 
 
 		 259 aa  78.6  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0822  putative phage integrase  47.95 
 
 		 291 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.341397 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1196  phage integrase  52.31 
 
 		 291 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6657  integrase family protein  46.58 
 
 		 291 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.358251 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1077  integrase family protein  46.58 
 
 		 291 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0826  putative phage integrase  46.58 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.225694 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0858  phage integrase  49.25 
 
 		 289 aa  71.6  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3348  integrase domain protein SAM domain protein  57.38 
 
 		 121 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4806  phage integrase  46.58 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8452  integrase family protein  50.82 
 
 		 286 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.032039  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4502  integrase family protein  43.66 
 
 		 290 aa  67  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3700  integrase family protein  44.26 
 
 		 295 aa  67  0.00000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6957  integrase family protein  50.91 
 
 		 292 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7619  integrase family protein  49.09 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7462  integrase family protein  49.09 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6605  integrase family protein  49.09 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4832  phage integrase  48.21 
 
 		 291 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  45.59 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3470  phage integrase family protein  43.55 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.229271  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0068  phage integrase  41.67 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3629  integrase family protein  41.94 
 
 		 290 aa  58.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3661  integrase family protein  41.94 
 
 		 290 aa  58.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.311976  decreased coverage  0.00000149049 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2872  phage integrase family protein  46.43 
 
 		 279 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000984905  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5049  integrase domain-containing protein  45.45 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0978  phage integrase family protein  40.91 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5165  integrase family protein  44.44 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2048  integrase domain-containing protein  50 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.212868  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1787  phage integrase family protein  36.36 
 
 		 283 aa  53.9  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2959  phage integrase family protein  36.36 
 
 		 283 aa  53.5  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.164424 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1585  phage integrase  35.09 
 
 		 286 aa  47  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.791115  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>