96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_5049 on replicon NC_009973
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009973  Haur_5049  integrase domain-containing protein  100 
 
 		 125 aa  254  3e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5165  integrase family protein  58.06 
 
 		 291 aa  147  7e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2048  integrase domain-containing protein  54.84 
 
 		 187 aa  134  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.212868  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2872  phage integrase family protein  44.44 
 
 		 279 aa  105  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000984905  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3109  phage integrase family protein  33.06 
 
 		 290 aa  85.5  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6957  integrase family protein  37.9 
 
 		 292 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6605  integrase family protein  37.1 
 
 		 292 aa  84  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7462  integrase family protein  37.1 
 
 		 292 aa  84  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7619  integrase family protein  37.1 
 
 		 292 aa  84  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1787  phage integrase family protein  35.96 
 
 		 283 aa  81.6  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2959  phage integrase family protein  35.96 
 
 		 283 aa  80.9  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.164424 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6657  integrase family protein  40.16 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.358251 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0978  phage integrase family protein  36.29 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1077  integrase family protein  40.16 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0826  putative phage integrase  40.16 
 
 		 266 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.225694 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0822  putative phage integrase  38.1 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.341397 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  37.6 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0068  phage integrase  32.81 
 
 		 302 aa  72  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1624  phage integrase family protein  36.28 
 
 		 235 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2036  phage integrase family site specific recombinase  36.28 
 
 		 287 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2528  phage integrase family site specific recombinase  36.28 
 
 		 287 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3470  phage integrase family protein  34.4 
 
 		 302 aa  70.5  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.229271  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2211  phage integrase family site specific recombinase  36.28 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2164  phage integrase family site specific recombinase  36.28 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4832  phage integrase  34.19 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2013  integrase family protein  36.28 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000617639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2736  integrase family protein  36.28 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0269003  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4502  integrase family protein  33.86 
 
 		 290 aa  68.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1683  phage integrase family protein  36.28 
 
 		 287 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4806  phage integrase  37.01 
 
 		 291 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1721  integrase domain-containing protein  40 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.27985  normal  0.124645 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0262  integrase family protein  33.86 
 
 		 291 aa  67.8  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0373  integrase domain protein SAM domain protein  33.86 
 
 		 259 aa  67.8  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1189  integrase family protein  36.28 
 
 		 287 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00933678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1196  phage integrase  34.65 
 
 		 291 aa  67  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1162  integrase family protein  36.28 
 
 		 287 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1633  phage integrase family site specific recombinase  30.63 
 
 		 304 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180477  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1585  phage integrase  32.17 
 
 		 286 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.791115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2860  hypothetical protein  33 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190155 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3700  integrase family protein  34.19 
 
 		 295 aa  58.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0858  phage integrase  34.19 
 
 		 289 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3244  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  39.47 
 
 		 78 aa  58.2  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.042229  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1720  integron integrase  30.84 
 
 		 319 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.945826  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1682  integron integrase  30.84 
 
 		 319 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2797  phage integrase-like SAM-like  45.45 
 
 		 74 aa  57.8  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.554398  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3360  integron integrase  30.84 
 
 		 319 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1137  phage integrase  30.08 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4307  integron integrase  30 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1695  phage integrase family protein  30.89 
 
 		 296 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.363626  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2241  integrase family protein  30.89 
 
 		 296 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000667129 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1355  phage integrase family site specific recombinase  31.58 
 
 		 318 aa  54.7  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3066  integrase family protein  34.74 
 
 		 390 aa  54.3  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0221886  normal  0.652565 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1786  phage integrase family site specific recombinase  29.73 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1843  integron integrase  30 
 
 		 279 aa  54.3  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03738  putative integrase  29.17 
 
 		 322 aa  53.5  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2037  phage integrase family site specific recombinase  28.97 
 
 		 319 aa  53.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8452  integrase family protein  32.54 
 
 		 286 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.032039  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2132  integron integrase  29.91 
 
 		 319 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290373 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3629  integrase family protein  32.43 
 
 		 290 aa  52.4  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3661  integrase family protein  32.43 
 
 		 290 aa  52.4  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.311976  decreased coverage  0.00000149049 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1799  integron integrase  29.17 
 
 		 462 aa  52.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.174616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0938  site-specific recombinase IntI4  27.68 
 
 		 320 aa  52  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000827497  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3075  integron integrase  30.91 
 
 		 232 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0977  integron integrase  28.16 
 
 		 329 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0383  integron integrase  33.7 
 
 		 694 aa  48.9  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241301 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2467  bifunctional hypothetical protein/integrase  34.52 
 
 		 457 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2249  putative transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 325 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1145  putative transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 408 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.239655 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1377  site-specific recombinase XerD  26.47 
 
 		 333 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000056918  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0466  Fis family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 362 aa  47.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2803  integron integrase  33.75 
 
 		 449 aa  47.8  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000270824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2714  integron integrase  30.59 
 
 		 332 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3366  integron integrase  30.59 
 
 		 332 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.341619 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2869  integron integrase  28.57 
 
 		 452 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000684574  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0257  integron integrase  28.44 
 
 		 338 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0364142  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2703  integron integrase  35.37 
 
 		 323 aa  45.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0143  integrase IntI1 for transposon Tn21  28.71 
 
 		 337 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5342  integrase/recombinase  28.71 
 
 		 337 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3348  integrase domain protein SAM domain protein  31.13 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0425  XerC/CodV family integrase/recombinase  25.47 
 
 		 373 aa  45.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2616  integron integrase  29.57 
 
 		 468 aa  45.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1215  integron integrase  27.19 
 
 		 326 aa  44.7  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0120  integrase/recombinase  28.71 
 
 		 337 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.400978 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0410  integron integrase  26.32 
 
 		 334 aa  44.7  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.761535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0067  integrase/recombinase  28.71 
 
 		 337 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.325485 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4396  integron integrase  30.39 
 
 		 318 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.970236  normal  0.0224938 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3427  integron integrase  29.07 
 
 		 327 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02003  integrase  26.67 
 
 		 318 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1565  phage integrase  30.67 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2645  integron integrase  27.78 
 
 		 319 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.400636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4142  integron integrase  28.7 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2576  integron integrase  26.45 
 
 		 453 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00600674  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03940  site-specific recombinase  31.51 
 
 		 291 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.781769  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0542  integrase  27.45 
 
 		 330 aa  40.8  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3204  integron integrase  26.8 
 
 		 322 aa  40.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0840  integron integrase  29.2 
 
 		 319 aa  40  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.623931  hitchhiker  0.00150822 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>