More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2048 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2048  integrase domain-containing protein  100 
 
 		 187 aa  378  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.212868  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5165  integrase family protein  56.99 
 
 		 291 aa  221  6e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2872  phage integrase family protein  46.37 
 
 		 279 aa  159  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000984905  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3109  phage integrase family protein  39.25 
 
 		 290 aa  149  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5049  integrase domain-containing protein  54.84 
 
 		 125 aa  134  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6957  integrase family protein  40.76 
 
 		 292 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0978  phage integrase family protein  40.45 
 
 		 283 aa  129  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7619  integrase family protein  39.67 
 
 		 292 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6605  integrase family protein  39.67 
 
 		 292 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7462  integrase family protein  39.67 
 
 		 292 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4806  phage integrase  40.33 
 
 		 291 aa  121  7e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1787  phage integrase family protein  35.75 
 
 		 283 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8452  integrase family protein  38.46 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.032039  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2959  phage integrase family protein  35.75 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.164424 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0822  putative phage integrase  40.32 
 
 		 291 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.341397 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1137  phage integrase  37.14 
 
 		 296 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0466  Fis family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 362 aa  118  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1196  phage integrase  38.04 
 
 		 291 aa  117  7e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1695  phage integrase family protein  38.29 
 
 		 296 aa  117  9e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.363626  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6657  integrase family protein  38.59 
 
 		 291 aa  117  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.358251 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1077  integrase family protein  38.59 
 
 		 291 aa  117  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2241  integrase family protein  38.29 
 
 		 296 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000667129 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3470  phage integrase family protein  36.31 
 
 		 302 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.229271  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0826  putative phage integrase  38.59 
 
 		 266 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.225694 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0262  integrase family protein  37.5 
 
 		 291 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0373  integrase domain protein SAM domain protein  37.5 
 
 		 259 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3700  integrase family protein  38.04 
 
 		 295 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1624  phage integrase family protein  35.68 
 
 		 235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  37.64 
 
 		 301 aa  112  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2736  integrase family protein  35.14 
 
 		 287 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0269003  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2013  integrase family protein  35.14 
 
 		 287 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000617639  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2528  phage integrase family site specific recombinase  35.14 
 
 		 287 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2036  phage integrase family site specific recombinase  35.14 
 
 		 287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2164  phage integrase family site specific recombinase  35.14 
 
 		 287 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2211  phage integrase family site specific recombinase  35.14 
 
 		 287 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0068  phage integrase  34.97 
 
 		 302 aa  109  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1683  phage integrase family protein  34.59 
 
 		 287 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1189  integrase family protein  34.59 
 
 		 287 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00933678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4832  phage integrase  38.17 
 
 		 291 aa  105  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1162  integrase family protein  34.59 
 
 		 287 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4502  integrase family protein  35.52 
 
 		 290 aa  103  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5043  integrase family protein  78.69 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0858  phage integrase  34.78 
 
 		 289 aa  103  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1585  phage integrase  35.33 
 
 		 286 aa  100  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.791115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3629  integrase family protein  37.63 
 
 		 290 aa  97.8  9e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3661  integrase family protein  37.63 
 
 		 290 aa  97.8  9e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.311976  decreased coverage  0.00000149049 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1145  putative transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 408 aa  97.1  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.239655 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0977  integron integrase  32.77 
 
 		 329 aa  94  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2869  integron integrase  34.81 
 
 		 452 aa  92.8  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000684574  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0067  integrase/recombinase  36.08 
 
 		 337 aa  92  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.325485 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0120  integrase/recombinase  36.08 
 
 		 337 aa  92  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.400978 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5342  integrase/recombinase  36.08 
 
 		 337 aa  92  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0143  integrase IntI1 for transposon Tn21  36.08 
 
 		 337 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1799  integron integrase  32.22 
 
 		 462 aa  90.9  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.174616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4307  integron integrase  33.53 
 
 		 319 aa  90.1  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3360  integron integrase  34.59 
 
 		 319 aa  89.4  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3075  integron integrase  38.73 
 
 		 232 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2249  putative transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 325 aa  88.6  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1682  integron integrase  33.96 
 
 		 319 aa  87.8  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2132  integron integrase  32.92 
 
 		 319 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290373 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1720  integron integrase  33.96 
 
 		 319 aa  85.9  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.945826  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2714  integron integrase  34.18 
 
 		 332 aa  85.5  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1355  phage integrase family site specific recombinase  33.53 
 
 		 318 aa  85.5  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3366  integron integrase  34.18 
 
 		 332 aa  85.1  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.341619 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0534  site-specific recombinase IntIA  31.71 
 
 		 327 aa  84.7  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1633  phage integrase family site specific recombinase  33.33 
 
 		 304 aa  85.1  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180477  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2037  phage integrase family site specific recombinase  32.3 
 
 		 319 aa  84.7  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  31.03 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2616  integron integrase  35.36 
 
 		 468 aa  84  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1844  DNA integrase  29.34 
 
 		 335 aa  83.6  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1215  integron integrase  33.33 
 
 		 326 aa  82.8  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0257  integron integrase  33.92 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0364142  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2803  integron integrase  33.71 
 
 		 449 aa  82  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000270824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03738  putative integrase  31.49 
 
 		 322 aa  81.3  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3204  integron integrase  29.81 
 
 		 322 aa  81.3  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2576  integron integrase  31.87 
 
 		 453 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00600674  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1026  integrase family protein  26.98 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319361  normal  0.791294 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03940  site-specific recombinase  40.91 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.781769  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2703  integron integrase  32.74 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2467  bifunctional hypothetical protein/integrase  31.98 
 
 		 457 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3066  integrase family protein  32.48 
 
 		 390 aa  76.3  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0221886  normal  0.652565 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0410  integron integrase  30.41 
 
 		 334 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.761535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1377  site-specific recombinase XerD  30.43 
 
 		 333 aa  74.7  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000056918  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0938  site-specific recombinase IntI4  34.78 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000827497  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4643  integron integrase  31.14 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5312  integrase/recombinase  37.61 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.169843 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0383  integron integrase  32.91 
 
 		 694 aa  72  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241301 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0425  XerC/CodV family integrase/recombinase  30.77 
 
 		 373 aa  72  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1131  integron integrase  30.54 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  26.74 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3427  integron integrase  32.65 
 
 		 327 aa  69.7  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02003  integrase  30.25 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003169  integron integrase IntI4  31.48 
 
 		 320 aa  68.9  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  32.97 
 
 		 305 aa  68.9  0.00000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0542  integrase  30.43 
 
 		 330 aa  68.6  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2645  integron integrase  28.93 
 
 		 319 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.400636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3006  integron integrase  30.99 
 
 		 334 aa  67.8  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.976928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0779  integron integrase  24.56 
 
 		 320 aa  67.8  0.00000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000312296  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4142  integron integrase  34.48 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1843  integron integrase  32.48 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>