More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3360 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1720  integron integrase  98.43 
 
 		 319 aa  657    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.945826  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3360  integron integrase  100 
 
 		 319 aa  667    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1682  integron integrase  98.75 
 
 		 319 aa  659    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2037  phage integrase family site specific recombinase  91.85 
 
 		 319 aa  622  1e-177  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2132  integron integrase  88.71 
 
 		 319 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290373 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4307  integron integrase  63.95 
 
 		 319 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1355  phage integrase family site specific recombinase  63.81 
 
 		 318 aa  427  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1633  phage integrase family site specific recombinase  69.49 
 
 		 304 aa  403  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180477  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3204  integron integrase  48.9 
 
 		 322 aa  308  6.999999999999999e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0410  integron integrase  47.34 
 
 		 334 aa  290  2e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.761535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2703  integron integrase  48.56 
 
 		 323 aa  287  2e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0257  integron integrase  47.3 
 
 		 338 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0364142  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0977  integron integrase  43.25 
 
 		 329 aa  286  2.9999999999999996e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0425  XerC/CodV family integrase/recombinase  43.91 
 
 		 373 aa  283  3.0000000000000004e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0120  integrase/recombinase  46.18 
 
 		 337 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.400978 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0067  integrase/recombinase  46.18 
 
 		 337 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.325485 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3366  integron integrase  45.65 
 
 		 332 aa  282  5.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.341619 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5342  integrase/recombinase  46.18 
 
 		 337 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0143  integrase IntI1 for transposon Tn21  46.18 
 
 		 337 aa  281  9e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3427  integron integrase  47.63 
 
 		 327 aa  281  9e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1799  integron integrase  46.35 
 
 		 462 aa  281  1e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.174616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003169  integron integrase IntI4  45.94 
 
 		 320 aa  280  3e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2714  integron integrase  45.34 
 
 		 332 aa  279  3e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3006  integron integrase  45.28 
 
 		 334 aa  278  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.976928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0938  site-specific recombinase IntI4  45.62 
 
 		 320 aa  278  1e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000827497  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1215  integron integrase  45.94 
 
 		 326 aa  277  2e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1393  integron integrase  47.37 
 
 		 324 aa  269  4e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.597371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2249  putative transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 325 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02003  integrase  44.59 
 
 		 318 aa  265  8e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1377  site-specific recombinase XerD  43.04 
 
 		 333 aa  263  3e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000056918  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1131  integron integrase  44.9 
 
 		 319 aa  263  3e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4643  integron integrase  44.59 
 
 		 319 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0542  integrase  44.62 
 
 		 330 aa  261  8.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2645  integron integrase  43.22 
 
 		 319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.400636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0779  integron integrase  41.07 
 
 		 320 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000312296  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1145  putative transcriptional regulator, TetR family  41.64 
 
 		 408 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.239655 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0534  site-specific recombinase IntIA  40.76 
 
 		 327 aa  250  2e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03940  site-specific recombinase  46.49 
 
 		 291 aa  241  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.781769  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0696  phage integrase  44.3 
 
 		 338 aa  239  5e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4396  integron integrase  43.6 
 
 		 318 aa  239  5.999999999999999e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.970236  normal  0.0224938 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03738  putative integrase  40.31 
 
 		 322 aa  238  6.999999999999999e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1844  DNA integrase  40.82 
 
 		 335 aa  235  8e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2616  integron integrase  42.99 
 
 		 468 aa  229  6e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2803  integron integrase  42.86 
 
 		 449 aa  228  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000270824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2869  integron integrase  41.85 
 
 		 452 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000684574  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2576  integron integrase  41.85 
 
 		 453 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00600674  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2467  bifunctional hypothetical protein/integrase  41.27 
 
 		 457 aa  215  8e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0840  integron integrase  43.05 
 
 		 319 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.623931  hitchhiker  0.00150822 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2866  integron integrase  41.2 
 
 		 276 aa  206  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1786  phage integrase family site specific recombinase  59.33 
 
 		 150 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1843  integron integrase  38.28 
 
 		 279 aa  177  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3075  integron integrase  43.64 
 
 		 232 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0383  integron integrase  49.16 
 
 		 694 aa  160  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241301 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6957  integrase family protein  30.38 
 
 		 292 aa  150  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7619  integrase family protein  29.75 
 
 		 292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6605  integrase family protein  29.75 
 
 		 292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7462  integrase family protein  29.75 
 
 		 292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2872  phage integrase family protein  31.86 
 
 		 279 aa  143  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000984905  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4502  integrase family protein  32.7 
 
 		 290 aa  139  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4806  phage integrase  30.94 
 
 		 291 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3066  integrase family protein  29.84 
 
 		 390 aa  136  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0221886  normal  0.652565 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  31.17 
 
 		 301 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0039  integrase/recombinase  46.71 
 
 		 159 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3470  phage integrase family protein  31.76 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.229271  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1026  integrase family protein  30.22 
 
 		 283 aa  132  5e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319361  normal  0.791294 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3661  integrase family protein  30.48 
 
 		 290 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.311976  decreased coverage  0.00000149049 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3629  integrase family protein  30.48 
 
 		 290 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  31.33 
 
 		 295 aa  127  3e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0822  putative phage integrase  29.75 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.341397 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0068  phage integrase  29.75 
 
 		 302 aa  125  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  32.01 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3700  integrase family protein  28.75 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  31.4 
 
 		 270 aa  123  4e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8452  integrase family protein  31.27 
 
 		 286 aa  122  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.032039  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4142  integron integrase  44.83 
 
 		 156 aa  122  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1077  integrase family protein  29.43 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6657  integrase family protein  29.43 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.358251 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0858  phage integrase  28.35 
 
 		 289 aa  119  7.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1196  phage integrase  29.25 
 
 		 291 aa  119  9e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0978  phage integrase family protein  25.8 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  32.48 
 
 		 298 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  30.64 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5165  integrase family protein  26.35 
 
 		 291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  36.97 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  34.74 
 
 		 297 aa  113  5e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  32.11 
 
 		 290 aa  113  6e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.58 
 
 		 318 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.58 
 
 		 318 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  30.43 
 
 		 292 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  30.52 
 
 		 306 aa  112  9e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.58 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  29.7 
 
 		 302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  35.38 
 
 		 295 aa  109  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  34.6 
 
 		 295 aa  109  7.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2692  tyrosine recombinase XerD  29.33 
 
 		 295 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.457784  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  29.67 
 
 		 295 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  35.21 
 
 		 302 aa  109  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  31.37 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1585  phage integrase  28.67 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.791115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1432  tyrosine recombinase XerD  36.67 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0895087  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>