More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0977 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0977  integron integrase  100 
 
 		 329 aa  679    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3427  integron integrase  52.98 
 
 		 327 aa  352  4e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0425  XerC/CodV family integrase/recombinase  53.37 
 
 		 373 aa  352  5e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2703  integron integrase  53.92 
 
 		 323 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0410  integron integrase  53.46 
 
 		 334 aa  349  5e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.761535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3006  integron integrase  52.81 
 
 		 334 aa  347  2e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.976928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0534  site-specific recombinase IntIA  50.46 
 
 		 327 aa  346  4e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2714  integron integrase  52.32 
 
 		 332 aa  339  4e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3366  integron integrase  52.32 
 
 		 332 aa  338  7e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.341619 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1215  integron integrase  52.5 
 
 		 326 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2249  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 325 aa  328  8e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0120  integrase/recombinase  52.32 
 
 		 337 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.400978 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0067  integrase/recombinase  52.32 
 
 		 337 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.325485 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0143  integrase IntI1 for transposon Tn21  52.32 
 
 		 337 aa  326  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0696  phage integrase  53.02 
 
 		 338 aa  323  2e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5342  integrase/recombinase  51.7 
 
 		 337 aa  322  5e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0542  integrase  51.11 
 
 		 330 aa  317  1e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1377  site-specific recombinase XerD  49.21 
 
 		 333 aa  315  5e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000056918  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0257  integron integrase  48.41 
 
 		 338 aa  310  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0364142  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1799  integron integrase  51.32 
 
 		 462 aa  305  9.000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.174616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1355  phage integrase family site specific recombinase  47.44 
 
 		 318 aa  299  4e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3204  integron integrase  45.51 
 
 		 322 aa  298  9e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4307  integron integrase  44.3 
 
 		 319 aa  292  5e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2037  phage integrase family site specific recombinase  44.87 
 
 		 319 aa  291  7e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2132  integron integrase  44.55 
 
 		 319 aa  291  1e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290373 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0779  integron integrase  44.62 
 
 		 320 aa  289  5.0000000000000004e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000312296  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1145  putative transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 408 aa  288  6e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.239655 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0938  site-specific recombinase IntI4  44.94 
 
 		 320 aa  287  1e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000827497  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3360  integron integrase  43.25 
 
 		 319 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1682  integron integrase  43.25 
 
 		 319 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1844  DNA integrase  43.95 
 
 		 335 aa  284  2.0000000000000002e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1720  integron integrase  42.64 
 
 		 319 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.945826  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1131  integron integrase  43.13 
 
 		 319 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003169  integron integrase IntI4  42.54 
 
 		 320 aa  266  4e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4643  integron integrase  42.81 
 
 		 319 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1393  integron integrase  42.86 
 
 		 324 aa  265  8.999999999999999e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.597371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02003  integrase  44.55 
 
 		 318 aa  265  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2645  integron integrase  42.17 
 
 		 319 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.400636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03940  site-specific recombinase  52.04 
 
 		 291 aa  259  6e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.781769  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4396  integron integrase  46.02 
 
 		 318 aa  248  7e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.970236  normal  0.0224938 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2866  integron integrase  47.57 
 
 		 276 aa  247  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03738  putative integrase  40.38 
 
 		 322 aa  246  4.9999999999999997e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0840  integron integrase  45.82 
 
 		 319 aa  245  6e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.623931  hitchhiker  0.00150822 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1633  phage integrase family site specific recombinase  43.45 
 
 		 304 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180477  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3075  integron integrase  52.56 
 
 		 232 aa  231  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2869  integron integrase  40 
 
 		 452 aa  224  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000684574  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2616  integron integrase  41.37 
 
 		 468 aa  225  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2803  integron integrase  40.07 
 
 		 449 aa  224  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000270824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2576  integron integrase  40 
 
 		 453 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00600674  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2467  bifunctional hypothetical protein/integrase  39.06 
 
 		 457 aa  212  9e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1843  integron integrase  42.64 
 
 		 279 aa  206  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0383  integron integrase  51.41 
 
 		 694 aa  179  4.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241301 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0039  integrase/recombinase  54 
 
 		 159 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1786  phage integrase family site specific recombinase  44.9 
 
 		 150 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2872  phage integrase family protein  31.88 
 
 		 279 aa  140  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000984905  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1026  integrase family protein  30.96 
 
 		 283 aa  139  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319361  normal  0.791294 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3066  integrase family protein  31.82 
 
 		 390 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0221886  normal  0.652565 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0822  putative phage integrase  32.2 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.341397 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6957  integrase family protein  30 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6605  integrase family protein  30.32 
 
 		 292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7619  integrase family protein  30.32 
 
 		 292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7462  integrase family protein  30.32 
 
 		 292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  30.91 
 
 		 295 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4142  integron integrase  47.89 
 
 		 156 aa  130  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0978  phage integrase family protein  27.21 
 
 		 283 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4806  phage integrase  31.61 
 
 		 291 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  33.12 
 
 		 270 aa  125  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0262  integrase family protein  32.83 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  30.43 
 
 		 301 aa  123  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4832  phage integrase  30.23 
 
 		 291 aa  122  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1077  integrase family protein  31.06 
 
 		 291 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6657  integrase family protein  31.06 
 
 		 291 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.358251 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0068  phage integrase  31.46 
 
 		 302 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5165  integrase family protein  29.77 
 
 		 291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1137  phage integrase  30.92 
 
 		 296 aa  119  7e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2241  integrase family protein  30.53 
 
 		 296 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000667129 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1695  phage integrase family protein  30.19 
 
 		 296 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.363626  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0858  phage integrase  29.91 
 
 		 289 aa  117  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3700  integrase family protein  29.49 
 
 		 295 aa  116  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00230  putative tyrosine recombinase  31.02 
 
 		 265 aa  115  7.999999999999999e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.9402  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3629  integrase family protein  30.43 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3661  integrase family protein  30.43 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.311976  decreased coverage  0.00000149049 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4502  integrase family protein  31.08 
 
 		 290 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  29.28 
 
 		 284 aa  114  3e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3109  phage integrase family protein  29.51 
 
 		 290 aa  113  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1585  phage integrase  29.84 
 
 		 286 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.791115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0826  putative phage integrase  30.79 
 
 		 266 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.225694 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3470  phage integrase family protein  29.94 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.229271  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1565  phage integrase  51.4 
 
 		 114 aa  110  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1196  phage integrase  29.6 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2959  phage integrase family protein  27.49 
 
 		 283 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.164424 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1787  phage integrase family protein  26.96 
 
 		 283 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  29.02 
 
 		 292 aa  105  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  28.66 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  26.8 
 
 		 295 aa  102  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  31.07 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  29.41 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8452  integrase family protein  28.75 
 
 		 286 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.032039  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  27.97 
 
 		 290 aa  99.4  8e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  27.19 
 
 		 282 aa  99  9e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>