More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2866 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2866  integron integrase  100 
 
 		 276 aa  566  1e-160  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3427  integron integrase  58.8 
 
 		 327 aa  315  7e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0410  integron integrase  58.05 
 
 		 334 aa  308  5e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.761535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2249  putative transcriptional regulator, TetR family  56.93 
 
 		 325 aa  308  9e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1215  integron integrase  59.55 
 
 		 326 aa  298  4e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0257  integron integrase  53.18 
 
 		 338 aa  298  5e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0364142  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3006  integron integrase  55.43 
 
 		 334 aa  297  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.976928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0542  integrase  54.48 
 
 		 330 aa  295  7e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1377  site-specific recombinase XerD  53.36 
 
 		 333 aa  292  4e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000056918  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2714  integron integrase  54.68 
 
 		 332 aa  291  6e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3366  integron integrase  54.31 
 
 		 332 aa  289  3e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.341619 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2703  integron integrase  55.06 
 
 		 323 aa  285  4e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4396  integron integrase  59.02 
 
 		 318 aa  283  3.0000000000000004e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.970236  normal  0.0224938 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1844  DNA integrase  47.01 
 
 		 335 aa  265  8e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0696  phage integrase  55.39 
 
 		 338 aa  264  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0977  integron integrase  47.57 
 
 		 329 aa  258  6e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1799  integron integrase  47.94 
 
 		 462 aa  256  4e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.174616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0779  integron integrase  45.52 
 
 		 320 aa  249  5e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000312296  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5342  integrase/recombinase  48.31 
 
 		 337 aa  244  8e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0067  integrase/recombinase  47.94 
 
 		 337 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.325485 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0120  integrase/recombinase  47.94 
 
 		 337 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.400978 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1145  putative transcriptional regulator, TetR family  44.15 
 
 		 408 aa  242  3.9999999999999997e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.239655 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0143  integrase IntI1 for transposon Tn21  47.57 
 
 		 337 aa  242  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3075  integron integrase  54.35 
 
 		 232 aa  236  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0938  site-specific recombinase IntI4  45.08 
 
 		 320 aa  236  3e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000827497  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3204  integron integrase  42.32 
 
 		 322 aa  232  5e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0840  integron integrase  50.94 
 
 		 319 aa  229  4e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.623931  hitchhiker  0.00150822 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1131  integron integrase  43.28 
 
 		 319 aa  225  8e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1355  phage integrase family site specific recombinase  44.19 
 
 		 318 aa  223  4e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4643  integron integrase  42.91 
 
 		 319 aa  221  7e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1843  integron integrase  42.52 
 
 		 279 aa  221  9e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02003  integrase  40.91 
 
 		 318 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0425  XerC/CodV family integrase/recombinase  39.7 
 
 		 373 aa  220  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607346  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2037  phage integrase family site specific recombinase  41.2 
 
 		 319 aa  217  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3360  integron integrase  41.2 
 
 		 319 aa  215  5e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1720  integron integrase  41.2 
 
 		 319 aa  215  7e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.945826  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1682  integron integrase  41.2 
 
 		 319 aa  215  7e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4307  integron integrase  39.7 
 
 		 319 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003169  integron integrase IntI4  40.91 
 
 		 320 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2132  integron integrase  40.07 
 
 		 319 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290373 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0534  site-specific recombinase IntIA  38.95 
 
 		 327 aa  207  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03940  site-specific recombinase  52.91 
 
 		 291 aa  207  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.781769  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1633  phage integrase family site specific recombinase  41.2 
 
 		 304 aa  206  4e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180477  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2803  integron integrase  41.57 
 
 		 449 aa  205  7e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000270824  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2467  bifunctional hypothetical protein/integrase  41.2 
 
 		 457 aa  204  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2645  integron integrase  39.85 
 
 		 319 aa  203  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.400636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1393  integron integrase  40.67 
 
 		 324 aa  201  8e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.597371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0383  integron integrase  53.01 
 
 		 694 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241301 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03738  putative integrase  39.68 
 
 		 322 aa  196  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2576  integron integrase  39.33 
 
 		 453 aa  194  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00600674  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2869  integron integrase  39.7 
 
 		 452 aa  190  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000684574  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2616  integron integrase  40.54 
 
 		 468 aa  187  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4142  integron integrase  52.11 
 
 		 156 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1565  phage integrase  59.26 
 
 		 114 aa  125  6e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1786  phage integrase family site specific recombinase  42.76 
 
 		 150 aa  123  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0039  integrase/recombinase  48.08 
 
 		 159 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6957  integrase family protein  27.72 
 
 		 292 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2872  phage integrase family protein  28.68 
 
 		 279 aa  87.8  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000984905  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4832  phage integrase  28.74 
 
 		 291 aa  86.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  28.15 
 
 		 270 aa  86.7  4e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00520  site-specific recombinase  51.25 
 
 		 120 aa  85.5  9e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7619  integrase family protein  27.67 
 
 		 292 aa  85.5  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7462  integrase family protein  27.67 
 
 		 292 aa  85.5  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6605  integrase family protein  27.67 
 
 		 292 aa  85.5  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0031  hypothetical protein  64.18 
 
 		 92 aa  84.7  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568245 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5165  integrase family protein  29.02 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1585  phage integrase  30.95 
 
 		 286 aa  79.3  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.791115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  28.69 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  25.37 
 
 		 284 aa  78.2  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1624  phage integrase family protein  24.91 
 
 		 235 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1026  integrase family protein  24.26 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319361  normal  0.791294 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0978  phage integrase family protein  23.86 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1196  phage integrase  27.24 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3066  integrase family protein  25.98 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0221886  normal  0.652565 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  26.59 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1787  phage integrase family protein  31.06 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3470  phage integrase family protein  27.17 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.229271  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  25.75 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4806  phage integrase  29 
 
 		 291 aa  72  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2959  phage integrase family protein  30 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.164424 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0466  Fis family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 362 aa  69.7  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  25.75 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0068  phage integrase  28.74 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2036  phage integrase family site specific recombinase  24.91 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2164  phage integrase family site specific recombinase  24.91 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2211  phage integrase family site specific recombinase  24.91 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2528  phage integrase family site specific recombinase  24.91 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1023  integrase family protein  29.7 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0854512  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  24.62 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3661  integrase family protein  26.77 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.311976  decreased coverage  0.00000149049 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3109  phage integrase family protein  27.06 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3629  integrase family protein  26.77 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0373  integrase domain protein SAM domain protein  27.44 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1683  phage integrase family protein  24.91 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1162  integrase family protein  24.91 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1189  integrase family protein  24.91 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00933678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4502  integrase family protein  28.46 
 
 		 290 aa  67  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2736  integrase family protein  24.16 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0269003  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2048  integrase domain-containing protein  27.5 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.212868  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3735  integrase  36.59 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>