More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4396 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4396  integron integrase  100 
 
 		 318 aa  642    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.970236  normal  0.0224938 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2249  putative transcriptional regulator, TetR family  56.38 
 
 		 325 aa  350  2e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0410  integron integrase  57.29 
 
 		 334 aa  350  3e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.761535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3427  integron integrase  57.43 
 
 		 327 aa  342  7e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0257  integron integrase  54.95 
 
 		 338 aa  332  7.000000000000001e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0364142  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3006  integron integrase  55.33 
 
 		 334 aa  330  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.976928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1215  integron integrase  58.76 
 
 		 326 aa  329  3e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2714  integron integrase  56.31 
 
 		 332 aa  324  9e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3366  integron integrase  56.51 
 
 		 332 aa  324  1e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.341619 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1377  site-specific recombinase XerD  52.76 
 
 		 333 aa  316  3e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000056918  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0542  integrase  52.41 
 
 		 330 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2703  integron integrase  55.17 
 
 		 323 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2866  integron integrase  59.02 
 
 		 276 aa  294  2e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0696  phage integrase  57.24 
 
 		 338 aa  291  9e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0779  integron integrase  42.47 
 
 		 320 aa  277  2e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000312296  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1844  DNA integrase  46.02 
 
 		 335 aa  275  6e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1799  integron integrase  47.93 
 
 		 462 aa  274  2.0000000000000002e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.174616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0938  site-specific recombinase IntI4  45.52 
 
 		 320 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000827497  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1145  putative transcriptional regulator, TetR family  48.75 
 
 		 408 aa  268  5.9999999999999995e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.239655 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1355  phage integrase family site specific recombinase  48.46 
 
 		 318 aa  268  1e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0977  integron integrase  46.02 
 
 		 329 aa  264  1e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2037  phage integrase family site specific recombinase  44.64 
 
 		 319 aa  262  4e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1682  integron integrase  43.6 
 
 		 319 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0143  integrase IntI1 for transposon Tn21  48.79 
 
 		 337 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5342  integrase/recombinase  48.33 
 
 		 337 aa  259  4e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0120  integrase/recombinase  48.79 
 
 		 337 aa  259  4e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.400978 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0067  integrase/recombinase  48.79 
 
 		 337 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.325485 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3360  integron integrase  43.6 
 
 		 319 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2132  integron integrase  44.29 
 
 		 319 aa  257  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290373 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02003  integrase  42.81 
 
 		 318 aa  256  4e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1720  integron integrase  43.25 
 
 		 319 aa  256  4e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.945826  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0425  XerC/CodV family integrase/recombinase  41.78 
 
 		 373 aa  255  6e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1131  integron integrase  43.75 
 
 		 319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4307  integron integrase  42.21 
 
 		 319 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3204  integron integrase  44.1 
 
 		 322 aa  253  3e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2645  integron integrase  42.86 
 
 		 319 aa  251  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.400636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003169  integron integrase IntI4  42.07 
 
 		 320 aa  251  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4643  integron integrase  43.4 
 
 		 319 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03940  site-specific recombinase  56.73 
 
 		 291 aa  248  7e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.781769  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0840  integron integrase  51.55 
 
 		 319 aa  245  6e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.623931  hitchhiker  0.00150822 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3075  integron integrase  55.17 
 
 		 232 aa  237  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0534  site-specific recombinase IntIA  39.45 
 
 		 327 aa  233  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2616  integron integrase  43.06 
 
 		 468 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2803  integron integrase  42.01 
 
 		 449 aa  229  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000270824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1393  integron integrase  41.87 
 
 		 324 aa  225  6e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.597371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2869  integron integrase  40.97 
 
 		 452 aa  225  8e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000684574  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2467  bifunctional hypothetical protein/integrase  40.97 
 
 		 457 aa  225  9e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03738  putative integrase  40.65 
 
 		 322 aa  223  3e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2576  integron integrase  39.93 
 
 		 453 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00600674  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1633  phage integrase family site specific recombinase  41.42 
 
 		 304 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180477  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1843  integron integrase  41.92 
 
 		 279 aa  204  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0383  integron integrase  47.58 
 
 		 694 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241301 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4142  integron integrase  56.03 
 
 		 156 aa  145  7.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1786  phage integrase family site specific recombinase  44.87 
 
 		 150 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1026  integrase family protein  29.69 
 
 		 283 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319361  normal  0.791294 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5165  integrase family protein  31.97 
 
 		 291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2872  phage integrase family protein  30.8 
 
 		 279 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000984905  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1565  phage integrase  50.93 
 
 		 114 aa  107  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  30.58 
 
 		 270 aa  105  8e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6957  integrase family protein  30.04 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0039  integrase/recombinase  45.24 
 
 		 159 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7619  integrase family protein  29.96 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7462  integrase family protein  29.96 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6605  integrase family protein  29.96 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0978  phage integrase family protein  28.72 
 
 		 283 aa  99  9e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4502  integrase family protein  32.53 
 
 		 290 aa  98.6  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4806  phage integrase  31.19 
 
 		 291 aa  98.2  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4832  phage integrase  31.52 
 
 		 291 aa  98.2  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3066  integrase family protein  27.59 
 
 		 390 aa  95.1  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0221886  normal  0.652565 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0822  putative phage integrase  31.56 
 
 		 291 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.341397 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0262  integrase family protein  32.99 
 
 		 291 aa  94  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3470  phage integrase family protein  32.08 
 
 		 302 aa  93.6  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.229271  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1585  phage integrase  27.95 
 
 		 286 aa  92.8  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.791115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1137  phage integrase  31.03 
 
 		 296 aa  92.4  9e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  32.73 
 
 		 301 aa  90.1  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1077  integrase family protein  30.6 
 
 		 291 aa  89  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6657  integrase family protein  30.6 
 
 		 291 aa  89  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.358251 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1196  phage integrase  29.79 
 
 		 291 aa  89  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  28.52 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0826  putative phage integrase  30.36 
 
 		 266 aa  86.7  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.225694 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0068  phage integrase  31.58 
 
 		 302 aa  85.9  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1787  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 283 aa  85.1  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00520  site-specific recombinase  50 
 
 		 120 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2959  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.164424 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  24.67 
 
 		 284 aa  84  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2241  integrase family protein  32.14 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000667129 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  27.96 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1162  integrase family protein  28.62 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  33.46 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1189  integrase family protein  28.62 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00933678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  28.94 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  28.57 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1695  phage integrase family protein  31.25 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.363626  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3700  integrase family protein  28 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  28.14 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3661  integrase family protein  29.67 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.311976  decreased coverage  0.00000149049 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3629  integrase family protein  29.67 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  28.68 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2736  integrase family protein  28.28 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0269003  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2013  integrase family protein  28.28 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000617639  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>