More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0257 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0257  integron integrase  100 
 
 		 338 aa  702    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0364142  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3427  integron integrase  58.1 
 
 		 327 aa  395  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3006  integron integrase  58.99 
 
 		 334 aa  382  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.976928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0410  integron integrase  56.52 
 
 		 334 aa  381  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.761535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2703  integron integrase  58.1 
 
 		 323 aa  371  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2249  putative transcriptional regulator, TetR family  56.78 
 
 		 325 aa  373  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1844  DNA integrase  53.5 
 
 		 335 aa  366  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2714  integron integrase  53.96 
 
 		 332 aa  366  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3366  integron integrase  53.96 
 
 		 332 aa  364  1e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.341619 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1215  integron integrase  57.05 
 
 		 326 aa  360  2e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1377  site-specific recombinase XerD  50.3 
 
 		 333 aa  348  6e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000056918  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0542  integrase  53.31 
 
 		 330 aa  345  8e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1799  integron integrase  50.79 
 
 		 462 aa  330  2e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.174616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0696  phage integrase  54.57 
 
 		 338 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1145  putative transcriptional regulator, TetR family  51.31 
 
 		 408 aa  325  6e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.239655 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0977  integron integrase  48.41 
 
 		 329 aa  310  2e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4396  integron integrase  54.95 
 
 		 318 aa  310  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.970236  normal  0.0224938 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0143  integrase IntI1 for transposon Tn21  51.9 
 
 		 337 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5342  integrase/recombinase  52.22 
 
 		 337 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0067  integrase/recombinase  51.9 
 
 		 337 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.325485 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0120  integrase/recombinase  51.9 
 
 		 337 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.400978 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0779  integron integrase  45.89 
 
 		 320 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000312296  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1355  phage integrase family site specific recombinase  48.91 
 
 		 318 aa  296  3e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03940  site-specific recombinase  57.93 
 
 		 291 aa  296  3e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.781769  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0938  site-specific recombinase IntI4  48.55 
 
 		 320 aa  296  4e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000827497  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2037  phage integrase family site specific recombinase  47.94 
 
 		 319 aa  294  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2616  integron integrase  47.45 
 
 		 468 aa  293  2e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2132  integron integrase  47.94 
 
 		 319 aa  292  7e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290373 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2576  integron integrase  45.22 
 
 		 453 aa  291  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00600674  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2866  integron integrase  53.18 
 
 		 276 aa  290  3e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0425  XerC/CodV family integrase/recombinase  44.27 
 
 		 373 aa  290  4e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1682  integron integrase  47.3 
 
 		 319 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2803  integron integrase  46.41 
 
 		 449 aa  287  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000270824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3360  integron integrase  47.3 
 
 		 319 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1720  integron integrase  46.67 
 
 		 319 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.945826  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2467  bifunctional hypothetical protein/integrase  46.41 
 
 		 457 aa  281  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3204  integron integrase  43.81 
 
 		 322 aa  280  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1131  integron integrase  44.44 
 
 		 319 aa  280  3e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2869  integron integrase  45.86 
 
 		 452 aa  280  3e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000684574  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2645  integron integrase  44.59 
 
 		 319 aa  276  4e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.400636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4643  integron integrase  44.13 
 
 		 319 aa  276  5e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4307  integron integrase  44.44 
 
 		 319 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003169  integron integrase IntI4  44.69 
 
 		 320 aa  271  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02003  integrase  45.95 
 
 		 318 aa  263  4.999999999999999e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3075  integron integrase  57.87 
 
 		 232 aa  259  7e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1393  integron integrase  44.3 
 
 		 324 aa  253  2.0000000000000002e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.597371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0840  integron integrase  47.33 
 
 		 319 aa  251  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.623931  hitchhiker  0.00150822 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0534  site-specific recombinase IntIA  39.81 
 
 		 327 aa  249  5e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03738  putative integrase  41.64 
 
 		 322 aa  249  7e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1633  phage integrase family site specific recombinase  43.38 
 
 		 304 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180477  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1843  integron integrase  40.61 
 
 		 279 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0383  integron integrase  50.53 
 
 		 694 aa  199  5e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241301 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4142  integron integrase  56.74 
 
 		 156 aa  161  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0039  integrase/recombinase  55.92 
 
 		 159 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2872  phage integrase family protein  33.22 
 
 		 279 aa  143  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000984905  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3066  integrase family protein  29.71 
 
 		 390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0221886  normal  0.652565 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4832  phage integrase  33.96 
 
 		 291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1026  integrase family protein  30.65 
 
 		 283 aa  135  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319361  normal  0.791294 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3470  phage integrase family protein  34.62 
 
 		 302 aa  134  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.229271  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  34.9 
 
 		 270 aa  133  5e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4806  phage integrase  33.02 
 
 		 291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5165  integrase family protein  31.89 
 
 		 291 aa  130  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0858  phage integrase  31.72 
 
 		 289 aa  129  8.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3629  integrase family protein  33.03 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3661  integrase family protein  33.03 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.311976  decreased coverage  0.00000149049 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1196  phage integrase  31.94 
 
 		 291 aa  125  7e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8452  integrase family protein  33.44 
 
 		 286 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.032039  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1585  phage integrase  32.44 
 
 		 286 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.791115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  33.97 
 
 		 301 aa  124  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0068  phage integrase  32.92 
 
 		 302 aa  124  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1786  phage integrase family site specific recombinase  41.67 
 
 		 150 aa  123  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4502  integrase family protein  32.58 
 
 		 290 aa  122  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6957  integrase family protein  30 
 
 		 292 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3700  integrase family protein  30.35 
 
 		 295 aa  119  9e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1565  phage integrase  53.77 
 
 		 114 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7462  integrase family protein  29.03 
 
 		 292 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6605  integrase family protein  29.03 
 
 		 292 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7619  integrase family protein  29.03 
 
 		 292 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00230  putative tyrosine recombinase  30.1 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.9402  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0822  putative phage integrase  31.63 
 
 		 291 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.341397 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0262  integrase family protein  32.15 
 
 		 291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  27.15 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1189  integrase family protein  27.91 
 
 		 287 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00933678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1162  integrase family protein  27.91 
 
 		 287 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1077  integrase family protein  29.9 
 
 		 291 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6657  integrase family protein  29.9 
 
 		 291 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.358251 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1137  phage integrase  28.52 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2736  integrase family protein  27.57 
 
 		 287 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0269003  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2013  integrase family protein  27.57 
 
 		 287 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000617639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  29.26 
 
 		 292 aa  103  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1683  phage integrase family protein  27.57 
 
 		 287 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1023  integrase family protein  31.55 
 
 		 297 aa  103  6e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0854512  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3109  phage integrase family protein  28.9 
 
 		 290 aa  103  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  30.45 
 
 		 282 aa  100  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1695  phage integrase family protein  27.97 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.363626  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2036  phage integrase family site specific recombinase  28.24 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.3 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.3 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.3 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0978  phage integrase family protein  27.24 
 
 		 283 aa  100  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>