More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1720 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3360  integron integrase  98.43 
 
 		 319 aa  657    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1682  integron integrase  99.06 
 
 		 319 aa  659    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1720  integron integrase  100 
 
 		 319 aa  666    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.945826  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2037  phage integrase family site specific recombinase  91.85 
 
 		 319 aa  619  1e-176  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2132  integron integrase  88.71 
 
 		 319 aa  598  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290373 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4307  integron integrase  63.64 
 
 		 319 aa  442  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1355  phage integrase family site specific recombinase  63.49 
 
 		 318 aa  425  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1633  phage integrase family site specific recombinase  69.12 
 
 		 304 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180477  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3204  integron integrase  48.26 
 
 		 322 aa  304  1.0000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0410  integron integrase  46.71 
 
 		 334 aa  286  4e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.761535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2703  integron integrase  47.92 
 
 		 323 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0257  integron integrase  46.67 
 
 		 338 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0364142  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0977  integron integrase  42.64 
 
 		 329 aa  281  1e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3366  integron integrase  45.03 
 
 		 332 aa  279  4e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.341619 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0120  integrase/recombinase  45.54 
 
 		 337 aa  278  7e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.400978 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0067  integrase/recombinase  45.54 
 
 		 337 aa  278  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.325485 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0425  XerC/CodV family integrase/recombinase  43.27 
 
 		 373 aa  278  1e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2714  integron integrase  44.72 
 
 		 332 aa  276  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3427  integron integrase  47 
 
 		 327 aa  277  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0143  integrase IntI1 for transposon Tn21  45.54 
 
 		 337 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5342  integrase/recombinase  45.54 
 
 		 337 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1215  integron integrase  45.62 
 
 		 326 aa  276  3e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003169  integron integrase IntI4  45.31 
 
 		 320 aa  276  5e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0938  site-specific recombinase IntI4  45 
 
 		 320 aa  273  2.0000000000000002e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000827497  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1799  integron integrase  45.4 
 
 		 462 aa  272  4.0000000000000004e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.174616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3006  integron integrase  44.65 
 
 		 334 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.976928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2249  putative transcriptional regulator, TetR family  43.12 
 
 		 325 aa  264  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1393  integron integrase  47.19 
 
 		 324 aa  263  2e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.597371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1377  site-specific recombinase XerD  43.67 
 
 		 333 aa  262  4.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000056918  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02003  integrase  44.59 
 
 		 318 aa  261  8e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1131  integron integrase  44.59 
 
 		 319 aa  258  8e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0542  integrase  43.99 
 
 		 330 aa  258  9e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4643  integron integrase  44.27 
 
 		 319 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2645  integron integrase  43.85 
 
 		 319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.400636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1145  putative transcriptional regulator, TetR family  41.64 
 
 		 408 aa  251  8.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.239655 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0779  integron integrase  41.07 
 
 		 320 aa  251  1e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000312296  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0534  site-specific recombinase IntIA  40.13 
 
 		 327 aa  247  1e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0696  phage integrase  44.3 
 
 		 338 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03738  putative integrase  40.31 
 
 		 322 aa  236  3e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4396  integron integrase  43.25 
 
 		 318 aa  236  3e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.970236  normal  0.0224938 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03940  site-specific recombinase  46.13 
 
 		 291 aa  235  8e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.781769  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1844  DNA integrase  40.82 
 
 		 335 aa  232  8.000000000000001e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2803  integron integrase  42.54 
 
 		 449 aa  227  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000270824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2616  integron integrase  42.68 
 
 		 468 aa  227  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2869  integron integrase  41.53 
 
 		 452 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000684574  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2576  integron integrase  41.85 
 
 		 453 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00600674  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0840  integron integrase  43 
 
 		 319 aa  213  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.623931  hitchhiker  0.00150822 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2467  bifunctional hypothetical protein/integrase  40.63 
 
 		 457 aa  211  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2866  integron integrase  41.2 
 
 		 276 aa  206  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1786  phage integrase family site specific recombinase  59.33 
 
 		 150 aa  179  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3075  integron integrase  43.89 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1843  integron integrase  37.5 
 
 		 279 aa  170  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0383  integron integrase  48.04 
 
 		 694 aa  155  6e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241301 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6957  integrase family protein  30.38 
 
 		 292 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7462  integrase family protein  29.11 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7619  integrase family protein  29.11 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6605  integrase family protein  29.11 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2872  phage integrase family protein  31.53 
 
 		 279 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000984905  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4502  integrase family protein  32.39 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0039  integrase/recombinase  46.71 
 
 		 159 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4806  phage integrase  30.63 
 
 		 291 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  30.84 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3066  integrase family protein  29.52 
 
 		 390 aa  132  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0221886  normal  0.652565 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1026  integrase family protein  30.53 
 
 		 283 aa  132  6e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319361  normal  0.791294 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3470  phage integrase family protein  31.45 
 
 		 302 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.229271  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3629  integrase family protein  30.79 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3661  integrase family protein  30.79 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.311976  decreased coverage  0.00000149049 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0068  phage integrase  29.43 
 
 		 302 aa  123  5e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0822  putative phage integrase  29.43 
 
 		 291 aa  122  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.341397 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  30.7 
 
 		 295 aa  122  7e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3700  integrase family protein  29.06 
 
 		 295 aa  121  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  31.4 
 
 		 270 aa  122  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  31.68 
 
 		 295 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8452  integrase family protein  30.96 
 
 		 286 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.032039  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6657  integrase family protein  29.11 
 
 		 291 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.358251 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1077  integrase family protein  29.11 
 
 		 291 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4142  integron integrase  43.45 
 
 		 156 aa  119  9e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1196  phage integrase  28.62 
 
 		 291 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0858  phage integrase  28.04 
 
 		 289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0978  phage integrase family protein  25.48 
 
 		 283 aa  114  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  32.12 
 
 		 298 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5165  integrase family protein  26.5 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  32.11 
 
 		 290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  30.3 
 
 		 292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  35.07 
 
 		 296 aa  109  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1585  phage integrase  28.33 
 
 		 286 aa  109  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.791115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  30.1 
 
 		 292 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  33.8 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  30.19 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.37 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  29.13 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.37 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.37 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  29.7 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1432  tyrosine recombinase XerD  36.67 
 
 		 321 aa  106  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0895087  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  34.91 
 
 		 295 aa  105  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  31.9 
 
 		 296 aa  105  9e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  29.61 
 
 		 311 aa  105  9e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  31 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  33.65 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>