More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2616 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2576  integron integrase  70.94 
 
 
453 aa  681    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00600674  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2616  integron integrase  100 
 
 
468 aa  972    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2869  integron integrase  72.22 
 
 
452 aa  686    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000684574  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2803  integron integrase  68.71 
 
 
449 aa  656    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000270824  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2467  bifunctional hypothetical protein/integrase  66.03 
 
 
457 aa  627  1e-179  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0257  integron integrase  47.45 
 
 
338 aa  293  3e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0364142  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1215  integron integrase  45.4 
 
 
326 aa  266  5.999999999999999e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1145  putative transcriptional regulator, TetR family  42.95 
 
 
408 aa  265  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.239655 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0779  integron integrase  43.85 
 
 
320 aa  261  1e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000312296  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2249  putative transcriptional regulator, TetR family  42.77 
 
 
325 aa  260  3e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0542  integrase  43.32 
 
 
330 aa  260  3e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3006  integron integrase  43.12 
 
 
334 aa  258  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.976928  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3427  integron integrase  42.41 
 
 
327 aa  258  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0410  integron integrase  43.79 
 
 
334 aa  257  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.761535  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1799  integron integrase  43.17 
 
 
462 aa  257  3e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.174616  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1377  site-specific recombinase XerD  42.02 
 
 
333 aa  251  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000056918  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2703  integron integrase  44.55 
 
 
323 aa  251  2e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2714  integron integrase  43.31 
 
 
332 aa  247  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3366  integron integrase  43.31 
 
 
332 aa  246  6e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.341619 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1844  DNA integrase  40.85 
 
 
335 aa  246  9e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0938  site-specific recombinase IntI4  43.88 
 
 
320 aa  239  5.999999999999999e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000827497  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0696  phage integrase  44.13 
 
 
338 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0143  integrase IntI1 for transposon Tn21  42.04 
 
 
337 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0120  integrase/recombinase  41.72 
 
 
337 aa  231  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.400978 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0067  integrase/recombinase  41.72 
 
 
337 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.325485 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1682  integron integrase  42.99 
 
 
319 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3360  integron integrase  42.99 
 
 
319 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5342  integrase/recombinase  41.72 
 
 
337 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1720  integron integrase  42.68 
 
 
319 aa  227  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.945826  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2645  integron integrase  43 
 
 
319 aa  226  6e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.400636  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2037  phage integrase family site specific recombinase  41.74 
 
 
319 aa  224  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003169  integron integrase IntI4  40.07 
 
 
320 aa  224  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0977  integron integrase  41.37 
 
 
329 aa  225  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02003  integrase  39.46 
 
 
318 aa  223  4.9999999999999996e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1131  integron integrase  42.52 
 
 
319 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1355  phage integrase family site specific recombinase  42.67 
 
 
318 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4643  integron integrase  42.05 
 
 
319 aa  219  7e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0534  site-specific recombinase IntIA  38.76 
 
 
327 aa  218  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4396  integron integrase  43.06 
 
 
318 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.970236  normal  0.0224938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2132  integron integrase  40.91 
 
 
319 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000290373 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4307  integron integrase  40.87 
 
 
319 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3204  integron integrase  38.82 
 
 
322 aa  213  7.999999999999999e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1393  integron integrase  39.94 
 
 
324 aa  209  8e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.597371  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03738  putative integrase  38.05 
 
 
322 aa  207  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0425  XerC/CodV family integrase/recombinase  38.85 
 
 
373 aa  206  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607346  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03940  site-specific recombinase  44.07 
 
 
291 aa  197  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.781769  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2866  integron integrase  39.7 
 
 
276 aa  179  9e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0840  integron integrase  38.83 
 
 
319 aa  169  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.623931  hitchhiker  0.00150822 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1633  phage integrase family site specific recombinase  38.06 
 
 
304 aa  166  9e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180477  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1843  integron integrase  35.16 
 
 
279 aa  162  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3075  integron integrase  43.13 
 
 
232 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5165  integrase family protein  32.78 
 
 
291 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0383  integron integrase  42.6 
 
 
694 aa  134  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.241301 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  35.22 
 
 
270 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1026  integrase family protein  30.63 
 
 
283 aa  127  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319361  normal  0.791294 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2872  phage integrase family protein  29.22 
 
 
279 aa  125  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000984905  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0039  integrase/recombinase  46 
 
 
159 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3470  phage integrase family protein  31.82 
 
 
302 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.229271  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3629  integrase family protein  32.28 
 
 
290 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4502  integrase family protein  32.48 
 
 
290 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3661  integrase family protein  32.28 
 
 
290 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.311976  decreased coverage  0.00000149049 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4806  phage integrase  31.31 
 
 
291 aa  117  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  30.13 
 
 
295 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6957  integrase family protein  29.81 
 
 
292 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7619  integrase family protein  29.49 
 
 
292 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.192826  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7462  integrase family protein  29.49 
 
 
292 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105755  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6605  integrase family protein  29.49 
 
 
292 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1196  phage integrase  30.67 
 
 
291 aa  113  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.46 
 
 
301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8452  integrase family protein  31.41 
 
 
286 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.032039  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3066  integrase family protein  31.72 
 
 
390 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0221886  normal  0.652565 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0068  phage integrase  31.46 
 
 
302 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.8 
 
 
299 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.8 
 
 
299 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3700  integrase family protein  28.93 
 
 
295 aa  110  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.47 
 
 
299 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.47 
 
 
299 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.47 
 
 
299 aa  109  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.47 
 
 
299 aa  109  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.47 
 
 
299 aa  109  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0858  phage integrase  30.45 
 
 
289 aa  109  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4142  integron integrase  41.61 
 
 
156 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3109  phage integrase family protein  33.33 
 
 
290 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.47 
 
 
299 aa  108  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  29.28 
 
 
292 aa  107  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0822  putative phage integrase  32.72 
 
 
291 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.341397 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  29.49 
 
 
297 aa  107  5e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0262  integrase family protein  32.06 
 
 
291 aa  107  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  30.91 
 
 
301 aa  107  6e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  29.21 
 
 
320 aa  107  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.43 
 
 
299 aa  106  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6657  integrase family protein  31.51 
 
 
291 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.358251 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1077  integrase family protein  31.51 
 
 
291 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  27.52 
 
 
307 aa  105  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  27.02 
 
 
290 aa  104  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  29.32 
 
 
282 aa  104  3e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.48 
 
 
299 aa  104  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  29.84 
 
 
292 aa  104  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0747  tyrosine recombinase XerD  30.03 
 
 
303 aa  104  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000635712  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0950  integrase/recombinase XerD  29.33 
 
 
300 aa  103  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>