More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_5165 on replicon NC_009973
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009973  Haur_5165  integrase family protein  100 
 
 		 291 aa  596  1e-169  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2872  phage integrase family protein  43.94 
 
 		 279 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000984905  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3109  phage integrase family protein  41.64 
 
 		 290 aa  236  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2048  integrase domain-containing protein  56.99 
 
 		 187 aa  221  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.212868  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5043  integrase family protein  64.85 
 
 		 160 aa  209  4e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6605  integrase family protein  41.95 
 
 		 292 aa  201  8e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7619  integrase family protein  41.95 
 
 		 292 aa  201  8e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7462  integrase family protein  41.95 
 
 		 292 aa  201  8e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6957  integrase family protein  42.32 
 
 		 292 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3700  integrase family protein  40.96 
 
 		 295 aa  198  7.999999999999999e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1695  phage integrase family protein  38.11 
 
 		 296 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.363626  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0466  Fis family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2241  integrase family protein  39.41 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000667129 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4806  phage integrase  40.79 
 
 		 291 aa  192  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1137  phage integrase  39.18 
 
 		 296 aa  192  4e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4502  integrase family protein  41.45 
 
 		 290 aa  192  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0978  phage integrase family protein  39.18 
 
 		 283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1196  phage integrase  40.29 
 
 		 291 aa  183  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3661  integrase family protein  38.15 
 
 		 290 aa  181  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.311976  decreased coverage  0.00000149049 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3629  integrase family protein  38.15 
 
 		 290 aa  181  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0262  integrase family protein  40.22 
 
 		 291 aa  179  5.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3470  phage integrase family protein  37.82 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.229271  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4832  phage integrase  38.13 
 
 		 291 aa  175  6e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0858  phage integrase  38.1 
 
 		 289 aa  175  7e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8452  integrase family protein  38.32 
 
 		 286 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.032039  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1077  integrase family protein  38.97 
 
 		 291 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6657  integrase family protein  38.97 
 
 		 291 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.358251 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  36.93 
 
 		 301 aa  170  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0068  phage integrase  36.09 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1683  phage integrase family protein  35.45 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0822  putative phage integrase  38.41 
 
 		 291 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.341397 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2528  phage integrase family site specific recombinase  34.7 
 
 		 287 aa  166  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2036  phage integrase family site specific recombinase  34.7 
 
 		 287 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1162  integrase family protein  34.7 
 
 		 287 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1189  integrase family protein  34.7 
 
 		 287 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00933678  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2164  phage integrase family site specific recombinase  34.7 
 
 		 287 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2211  phage integrase family site specific recombinase  34.7 
 
 		 287 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2013  integrase family protein  34.7 
 
 		 287 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000617639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2736  integrase family protein  34.7 
 
 		 287 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0269003  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0826  putative phage integrase  38.93 
 
 		 266 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.225694 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1026  integrase family protein  32.53 
 
 		 283 aa  162  6e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319361  normal  0.791294 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1585  phage integrase  37.73 
 
 		 286 aa  162  9e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.791115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1624  phage integrase family protein  35.12 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3066  integrase family protein  34.87 
 
 		 390 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0221886  normal  0.652565 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1145  putative transcriptional regulator, TetR family  33.99 
 
 		 408 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.239655 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5049  integrase domain-containing protein  58.06 
 
 		 125 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0373  integrase domain protein SAM domain protein  38.4 
 
 		 259 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2869  integron integrase  33.22 
 
 		 452 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000684574  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1799  integron integrase  33.66 
 
 		 462 aa  144  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.174616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1787  phage integrase family protein  31.84 
 
 		 283 aa  143  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2959  phage integrase family protein  31.84 
 
 		 283 aa  142  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.164424 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2249  putative transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 325 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3427  integron integrase  34.24 
 
 		 327 aa  140  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2616  integron integrase  32.78 
 
 		 468 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2576  integron integrase  32.01 
 
 		 453 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00600674  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2467  bifunctional hypothetical protein/integrase  32.12 
 
 		 457 aa  137  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2803  integron integrase  30.98 
 
 		 449 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000270824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2703  integron integrase  33.23 
 
 		 323 aa  133  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0938  site-specific recombinase IntI4  30.49 
 
 		 320 aa  133  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000827497  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0410  integron integrase  31.1 
 
 		 334 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.761535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2714  integron integrase  33.44 
 
 		 332 aa  132  9e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1377  site-specific recombinase XerD  30.13 
 
 		 333 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000056918  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3366  integron integrase  33.44 
 
 		 332 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.341619 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  30.26 
 
 		 295 aa  130  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0257  integron integrase  31.89 
 
 		 338 aa  130  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0364142  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1215  integron integrase  33.55 
 
 		 326 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02003  integrase  32.1 
 
 		 318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0534  site-specific recombinase IntIA  29.74 
 
 		 327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  31.64 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3006  integron integrase  33.01 
 
 		 334 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.976928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5342  integrase/recombinase  33.55 
 
 		 337 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1355  phage integrase family site specific recombinase  30.16 
 
 		 318 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  31.11 
 
 		 270 aa  124  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4307  integron integrase  28.12 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0143  integrase IntI1 for transposon Tn21  32.9 
 
 		 337 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0067  integrase/recombinase  32.9 
 
 		 337 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.325485 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0120  integrase/recombinase  32.9 
 
 		 337 aa  123  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.400978 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  32.11 
 
 		 320 aa  122  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00230  putative tyrosine recombinase  38.58 
 
 		 265 aa  122  9e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.9402  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0977  integron integrase  29.77 
 
 		 329 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0542  integrase  30.13 
 
 		 330 aa  120  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  28.24 
 
 		 284 aa  119  3.9999999999999996e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03738  putative integrase  28.8 
 
 		 322 aa  119  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003169  integron integrase IntI4  28.86 
 
 		 320 aa  119  7.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03940  site-specific recombinase  33.71 
 
 		 291 aa  118  9e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.781769  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2047  site-specific recombinase XerD-like  71.6 
 
 		 81 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.214691  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1393  integron integrase  28.8 
 
 		 324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.597371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2132  integron integrase  27.04 
 
 		 319 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290373 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.73 
 
 		 298 aa  116  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3360  integron integrase  26.35 
 
 		 319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  31.14 
 
 		 316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  33.09 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  30.48 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3204  integron integrase  30.49 
 
 		 322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  32.12 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  32.85 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  25.81 
 
 		 290 aa  113  3e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2037  phage integrase family site specific recombinase  26.75 
 
 		 319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  31.73 
 
 		 299 aa  112  5e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0425  XerC/CodV family integrase/recombinase  29.1 
 
 		 373 aa  112  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607346  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>