More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_5043 on replicon NC_009973
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009973  Haur_5043  integrase family protein  100 
 
 		 160 aa  323  4.0000000000000003e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5165  integrase family protein  64.85 
 
 		 291 aa  209  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3109  phage integrase family protein  46.06 
 
 		 290 aa  149  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1695  phage integrase family protein  48.94 
 
 		 296 aa  134  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.363626  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1026  integrase family protein  41.14 
 
 		 283 aa  134  5e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319361  normal  0.791294 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2241  integrase family protein  48.94 
 
 		 296 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000667129 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0466  Fis family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 362 aa  132  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1137  phage integrase  46.81 
 
 		 296 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3700  integrase family protein  47.48 
 
 		 295 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2872  phage integrase family protein  48.23 
 
 		 279 aa  120  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000984905  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6957  integrase family protein  46 
 
 		 292 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2861  phage integrase family protein  45.32 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0978  phage integrase family protein  43.66 
 
 		 283 aa  118  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7462  integrase family protein  45.33 
 
 		 292 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7619  integrase family protein  45.33 
 
 		 292 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6605  integrase family protein  45.33 
 
 		 292 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3661  integrase family protein  46.76 
 
 		 290 aa  117  9e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.311976  decreased coverage  0.00000149049 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3629  integrase family protein  46.76 
 
 		 290 aa  117  9e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2047  site-specific recombinase XerD-like  67.9 
 
 		 81 aa  114  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.214691  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8452  integrase family protein  46.15 
 
 		 286 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.032039  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4806  phage integrase  44.9 
 
 		 291 aa  112  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0858  phage integrase  44.76 
 
 		 289 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00230  putative tyrosine recombinase  42.25 
 
 		 265 aa  108  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.9402  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4502  integrase family protein  42.57 
 
 		 290 aa  106  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  40.51 
 
 		 301 aa  106  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2048  integrase domain-containing protein  78.69 
 
 		 187 aa  103  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.212868  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3470  phage integrase family protein  38.75 
 
 		 302 aa  103  8e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.229271  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0262  integrase family protein  44.76 
 
 		 291 aa  103  9e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0068  phage integrase  39.38 
 
 		 302 aa  100  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  42.18 
 
 		 295 aa  100  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1196  phage integrase  42.66 
 
 		 291 aa  99  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1683  phage integrase family protein  39.16 
 
 		 287 aa  98.6  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1077  integrase family protein  44.14 
 
 		 291 aa  98.6  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6657  integrase family protein  44.14 
 
 		 291 aa  98.6  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.358251 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3066  integrase family protein  37.86 
 
 		 390 aa  97.8  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0221886  normal  0.652565 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0822  putative phage integrase  43.45 
 
 		 291 aa  97.8  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.341397 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4832  phage integrase  42.95 
 
 		 291 aa  97.4  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1145  putative transcriptional regulator, TetR family  33.89 
 
 		 408 aa  97.1  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.239655 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2036  phage integrase family site specific recombinase  38.46 
 
 		 287 aa  95.5  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2528  phage integrase family site specific recombinase  38.46 
 
 		 287 aa  95.9  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1162  integrase family protein  38.46 
 
 		 287 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2013  integrase family protein  38.46 
 
 		 287 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000617639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1189  integrase family protein  38.46 
 
 		 287 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00933678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2736  integrase family protein  38.46 
 
 		 287 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0269003  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2164  phage integrase family site specific recombinase  38.46 
 
 		 287 aa  95.5  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2211  phage integrase family site specific recombinase  38.46 
 
 		 287 aa  95.5  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1723  integrase family protein  38.46 
 
 		 210 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0273744  normal  0.126779 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  37.67 
 
 		 299 aa  95.1  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  37.24 
 
 		 295 aa  94  7e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1585  phage integrase  44.44 
 
 		 286 aa  93.6  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.791115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03940  site-specific recombinase  35.39 
 
 		 291 aa  93.6  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.781769  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0602  site-specific tyrosine recombinase XerC  43.84 
 
 		 324 aa  92.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926796 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  37.41 
 
 		 313 aa  91.3  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  32.43 
 
 		 290 aa  91.3  5e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0977  integron integrase  34.81 
 
 		 329 aa  90.9  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0826  putative phage integrase  43.48 
 
 		 266 aa  90.9  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.225694 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10100  site-specific recombinase XerD  37.09 
 
 		 332 aa  90.5  8e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  37.84 
 
 		 307 aa  89.7  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1844  DNA integrase  31.07 
 
 		 335 aa  90.1  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1377  site-specific recombinase XerD  28.88 
 
 		 333 aa  90.1  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000056918  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  37.84 
 
 		 307 aa  89.7  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  36.73 
 
 		 302 aa  90.1  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  33.78 
 
 		 282 aa  89.4  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2703  integron integrase  33.88 
 
 		 323 aa  89.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  34.72 
 
 		 298 aa  89.4  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  31.51 
 
 		 301 aa  89  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3583  phage integrase  38.78 
 
 		 385 aa  89.4  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1799  integron integrase  31.91 
 
 		 462 aa  89.7  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.174616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1355  phage integrase family site specific recombinase  28.27 
 
 		 318 aa  89  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0410  integron integrase  33.15 
 
 		 334 aa  89  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.761535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0083  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.9 
 
 		 322 aa  88.6  3e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  35.66 
 
 		 295 aa  88.6  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1468  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.36 
 
 		 298 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.208903 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4253  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.36 
 
 		 298 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0517  integrase family protein  34.64 
 
 		 335 aa  88.2  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  38.73 
 
 		 299 aa  88.2  4e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3366  integron integrase  32.77 
 
 		 332 aa  88.2  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.341619 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2714  integron integrase  32.77 
 
 		 332 aa  88.2  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1001  integrase family protein  43.36 
 
 		 333 aa  88.2  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5342  integrase/recombinase  33.71 
 
 		 337 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0143  integrase IntI1 for transposon Tn21  34.27 
 
 		 337 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2249  putative transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 325 aa  87.8  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0120  integrase/recombinase  34.27 
 
 		 337 aa  87.4  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.400978 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  33.09 
 
 		 284 aa  87.4  7e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0067  integrase/recombinase  34.27 
 
 		 337 aa  87.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.325485 
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  35.62 
 
 		 308 aa  87  8e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  35.62 
 
 		 320 aa  87.4  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05531  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.97 
 
 		 347 aa  87  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  37.16 
 
 		 307 aa  87  9e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1073  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.36 
 
 		 298 aa  87  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4151  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.19 
 
 		 298 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  37.58 
 
 		 324 aa  86.7  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02003  integrase  33.33 
 
 		 318 aa  85.5  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.86 
 
 		 299 aa  86.3  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  35.14 
 
 		 294 aa  85.9  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2869  integron integrase  30.73 
 
 		 452 aa  86.3  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000684574  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1159  integrase family protein  36.91 
 
 		 344 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.226555 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1412  integrase family protein  32.67 
 
 		 323 aa  85.9  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  34.46 
 
 		 307 aa  85.9  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.81 
 
 		 314 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>