More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0602 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0602  site-specific tyrosine recombinase XerC  100 
 
 		 324 aa  627  1e-179  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926796 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  54.78 
 
 		 313 aa  306  3e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3661  site-specific tyrosine recombinase XerC  47.13 
 
 		 311 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4114  site-specific tyrosine recombinase XerC  46.18 
 
 		 322 aa  239  5e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3960  site-specific tyrosine recombinase XerC  45.86 
 
 		 311 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3403  site-specific tyrosine recombinase XerC  47.6 
 
 		 313 aa  236  3e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2933  site-specific tyrosine recombinase XerC  45.86 
 
 		 313 aa  232  8.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.83049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1220  site-specific tyrosine recombinase XerC  48.08 
 
 		 330 aa  231  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2381  site-specific tyrosine recombinase XerC  46.06 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0942  site-specific tyrosine recombinase XerC  46.03 
 
 		 315 aa  230  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2501  site-specific tyrosine recombinase XerC  48.12 
 
 		 312 aa  228  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  0.936606 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2809  phage integrase family protein  46.18 
 
 		 311 aa  226  5.0000000000000005e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0271  site-specific tyrosine recombinase XerC  47.06 
 
 		 351 aa  225  6e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28022  normal  0.462537 
 
 
-
 
NC_004310  BR1916  site-specific tyrosine recombinase XerC  44.94 
 
 		 315 aa  224  1e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.391518  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1844  site-specific tyrosine recombinase XerC  44.94 
 
 		 315 aa  224  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.104424  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1030  site-specific tyrosine recombinase XerC  45.89 
 
 		 307 aa  225  1e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0553  site-specific tyrosine recombinase XerC  46.75 
 
 		 329 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172687  normal  0.167276 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1222  site-specific tyrosine recombinase XerC  46.84 
 
 		 306 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.120622 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0177  site-specific tyrosine recombinase XerC  46.13 
 
 		 323 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5002  hypothtical protein  44.79 
 
 		 308 aa  222  8e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0748381  hitchhiker  0.0000000255834 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0083  site-specific tyrosine recombinase XerC  41.08 
 
 		 322 aa  219  7e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0401  site-specific tyrosine recombinase XerC  44.48 
 
 		 324 aa  217  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.145415 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1457  integrase family protein  43.08 
 
 		 326 aa  217  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0563  site-specific tyrosine recombinase XerC  46.84 
 
 		 306 aa  216  5e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.792208  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2215  site-specific tyrosine recombinase XerC  46.84 
 
 		 306 aa  216  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0180  site-specific tyrosine recombinase XerC  43.45 
 
 		 324 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0666  Phage integrase, N-terminal SAM- like  36.34 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.555034  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0238  site-specific tyrosine recombinase XerC  44.73 
 
 		 306 aa  209  4e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0625179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0341  phage integrase family site specific recombinase  37.07 
 
 		 311 aa  209  5e-53  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4805  tyrosine recombinase XerC  45.37 
 
 		 367 aa  208  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104736  normal  0.146847 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3124  integrase family protein  43.71 
 
 		 323 aa  208  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4655  tyrosine recombinase XerC  45.37 
 
 		 365 aa  206  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.223284 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0536  site-specific tyrosine recombinase XerC  43.95 
 
 		 300 aa  206  6e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.538013  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4288  tyrosine recombinase XerC  45.37 
 
 		 365 aa  205  7e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.710874 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0426  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.41 
 
 		 321 aa  201  9e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0247  integrase family protein  42.94 
 
 		 322 aa  199  6e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121071  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0259  phage integrase  45.57 
 
 		 297 aa  199  6e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.389161 
 
 
-
 
NC_002978  WD0752  phage integrase family site specific recombinase  35.55 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.232674  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2064  phage integrase  43.12 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  39.87 
 
 		 317 aa  196  6e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1177  integrase family protein  43.44 
 
 		 329 aa  191  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.151473 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0163  integrase family protein  42.19 
 
 		 342 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.70922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  40.82 
 
 		 294 aa  187  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3189  integrase family protein  42.94 
 
 		 320 aa  187  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303256 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0928  integrase family protein  43.17 
 
 		 326 aa  186  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.669409 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0222  phage integrase family protein  43.04 
 
 		 308 aa  186  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  37.97 
 
 		 293 aa  185  8e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  40.13 
 
 		 332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  38.29 
 
 		 293 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0447  phage integrase family site specific recombinase  38.34 
 
 		 307 aa  182  5.0000000000000004e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  38.8 
 
 		 302 aa  181  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  36.96 
 
 		 294 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  40.76 
 
 		 294 aa  179  7e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  37.99 
 
 		 335 aa  176  4e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0273  tyrosine recombinase XerC  38.36 
 
 		 300 aa  176  5e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.007038  normal  0.809464 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  36.75 
 
 		 313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  39.06 
 
 		 312 aa  170  3e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  36.99 
 
 		 308 aa  169  5e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  31.23 
 
 		 295 aa  169  7e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.25 
 
 		 299 aa  168  9e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0967  integrase family protein  38.55 
 
 		 373 aa  168  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0611  integrase family protein  32.05 
 
 		 337 aa  168  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  34.06 
 
 		 291 aa  168  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  33.13 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.94 
 
 		 299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.94 
 
 		 299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.94 
 
 		 299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.94 
 
 		 299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.94 
 
 		 299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.94 
 
 		 299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3550  integrase family protein  38.87 
 
 		 324 aa  166  4e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1383  integrase family protein  33.65 
 
 		 299 aa  166  4e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00162011  normal  0.640047 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.94 
 
 		 299 aa  166  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.94 
 
 		 299 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  30.12 
 
 		 296 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.28 
 
 		 300 aa  165  8e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  39.13 
 
 		 301 aa  165  9e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  38.82 
 
 		 309 aa  165  9e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.16 
 
 		 301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  41.23 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6023  site-specific tyrosine recombinase XerC  40.37 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0736  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.63 
 
 		 294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3247  integrase/recombinase XerC  35.4 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  39.81 
 
 		 304 aa  163  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  36.31 
 
 		 302 aa  163  3e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  34.59 
 
 		 302 aa  163  4.0000000000000004e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  39.94 
 
 		 295 aa  163  4.0000000000000004e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69710  site-specific tyrosine recombinase XerC  40.67 
 
 		 303 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.737312  normal  0.478185 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  38.08 
 
 		 302 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  37.19 
 
 		 324 aa  162  6e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0242  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.68 
 
 		 299 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.322874  normal  0.826572 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0067  phage integrase family protein  36.84 
 
 		 328 aa  161  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1624  phage/XerD family site-specific recombinase  34.12 
 
 		 341 aa  160  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.389199 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1762  phage/XerD family site-specific recombinase  32.04 
 
 		 338 aa  160  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.91 
 
 		 300 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3062  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.36 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  35.49 
 
 		 307 aa  160  3e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  39.18 
 
 		 317 aa  160  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  33.02 
 
 		 295 aa  160  3e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  38.11 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>