More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2861 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2861  phage integrase family protein  100 
 
 		 153 aa  315  2e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1695  phage integrase family protein  42.31 
 
 		 296 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.363626  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1137  phage integrase  41.03 
 
 		 296 aa  120  5e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5043  integrase family protein  45.32 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2241  integrase family protein  43.75 
 
 		 296 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000667129 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  41.56 
 
 		 295 aa  110  5e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5165  integrase family protein  42.47 
 
 		 291 aa  110  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  38.73 
 
 		 299 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  42.14 
 
 		 292 aa  108  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3109  phage integrase family protein  38.65 
 
 		 290 aa  108  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2872  phage integrase family protein  40 
 
 		 279 aa  105  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000984905  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  36.77 
 
 		 295 aa  105  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3891  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.71 
 
 		 317 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.125291  decreased coverage  0.00274094 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1412  integrase family protein  36.18 
 
 		 323 aa  104  5e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  41.01 
 
 		 306 aa  104  5e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3598  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.71 
 
 		 317 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  36.36 
 
 		 316 aa  104  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0068  phage integrase  37.25 
 
 		 302 aa  103  9e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  40.85 
 
 		 302 aa  103  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  38.51 
 
 		 305 aa  102  3e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2484  phage integrase  34.67 
 
 		 304 aa  101  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.72317  normal  0.0269236 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  41.73 
 
 		 298 aa  101  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  36.6 
 
 		 301 aa  101  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  38.46 
 
 		 307 aa  101  4e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  38.16 
 
 		 301 aa  100  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1428  phage integrase  36.24 
 
 		 317 aa  100  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.473602  normal  0.0585003 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3275  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.33 
 
 		 298 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3661  integrase family protein  36.67 
 
 		 290 aa  100  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.311976  decreased coverage  0.00000149049 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3629  integrase family protein  36.67 
 
 		 290 aa  100  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02726  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.33 
 
 		 298 aa  100  8e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0798  tyrosine recombinase XerD  39.33 
 
 		 298 aa  100  8e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.966972  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3380  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.33 
 
 		 298 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.33 
 
 		 298 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3027  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.33 
 
 		 298 aa  100  8e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4185  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.33 
 
 		 298 aa  100  8e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3314  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.33 
 
 		 298 aa  100  8e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3053  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.33 
 
 		 298 aa  100  8e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02689  hypothetical protein  39.33 
 
 		 298 aa  100  8e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.364794  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3220  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.33 
 
 		 298 aa  100  8e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3278  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.33 
 
 		 298 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3200  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.33 
 
 		 298 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0815  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.33 
 
 		 298 aa  100  9e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.624778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  38.03 
 
 		 296 aa  99.8  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1468  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.77 
 
 		 298 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.208903 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4253  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.77 
 
 		 298 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3312  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.67 
 
 		 298 aa  99.4  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3892  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.09 
 
 		 299 aa  100  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  38.03 
 
 		 299 aa  99.8  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2739  integrase/recombinase XerD  38.03 
 
 		 321 aa  99.8  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2194  integrase family protein  37.76 
 
 		 317 aa  99.4  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  36.42 
 
 		 292 aa  98.6  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0893  tyrosine recombinase XerD  35.76 
 
 		 304 aa  99.4  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0105661 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  38.73 
 
 		 320 aa  99  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1906  integrase family protein  35.17 
 
 		 295 aa  99.4  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.713326  normal  0.217947 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1432  tyrosine recombinase XerD  37.14 
 
 		 321 aa  99  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0895087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0920  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.42 
 
 		 299 aa  98.6  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0359  tyrosine recombinase XerD  38.46 
 
 		 290 aa  98.2  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00723526 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3470  phage integrase family protein  36.6 
 
 		 302 aa  98.2  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.229271  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  36.18 
 
 		 319 aa  98.6  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3700  integrase family protein  39.13 
 
 		 295 aa  98.6  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3847  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.42 
 
 		 299 aa  98.6  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.349121 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0747  tyrosine recombinase XerD  38.26 
 
 		 303 aa  98.2  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000635712  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  35.06 
 
 		 297 aa  98.6  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0879  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.42 
 
 		 299 aa  98.6  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.201006  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0626  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.48 
 
 		 315 aa  98.2  4e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2567  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.46 
 
 		 313 aa  98.2  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2276  tyrosine recombinase XerD  36.62 
 
 		 301 aa  97.8  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235275  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1073  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.77 
 
 		 298 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  34.97 
 
 		 302 aa  98.2  4e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  38.67 
 
 		 310 aa  97.8  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  38.03 
 
 		 298 aa  97.8  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  36.91 
 
 		 295 aa  97.8  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  34.97 
 
 		 301 aa  97.4  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3714  tyrosine recombinase XerD  37.14 
 
 		 301 aa  97.4  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1026  integrase family protein  33.12 
 
 		 283 aa  97.4  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319361  normal  0.791294 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4151  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.77 
 
 		 298 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.8 
 
 		 298 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0530  tyrosine recombinase XerD  37.66 
 
 		 320 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.931339  normal  0.0955198 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  38.03 
 
 		 302 aa  97.4  7e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  33.75 
 
 		 295 aa  97.4  7e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.77 
 
 		 298 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  37.32 
 
 		 302 aa  96.7  9e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  35.21 
 
 		 313 aa  97.1  9e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.55 
 
 		 299 aa  96.7  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0466  Fis family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 362 aa  96.7  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  34.87 
 
 		 292 aa  96.7  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0861  site-specific tyrosine recombinase XerD  34 
 
 		 299 aa  96.7  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  32.26 
 
 		 308 aa  95.9  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.36 
 
 		 296 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  31.69 
 
 		 303 aa  95.9  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.36 
 
 		 296 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  35.86 
 
 		 298 aa  95.5  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.36 
 
 		 296 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  36.62 
 
 		 302 aa  95.5  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3300  tyrosine recombinase XerD  34.67 
 
 		 299 aa  95.9  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.36 
 
 		 296 aa  95.5  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.36 
 
 		 296 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0488  tyrosine recombinase XerD  35.06 
 
 		 319 aa  95.5  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1283  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.9 
 
 		 297 aa  95.9  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.36 
 
 		 296 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>