More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1906 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1906  integrase family protein  100 
 
 
295 aa  602  1.0000000000000001e-171  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.713326  normal  0.217947 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  43.1 
 
 
296 aa  251  1e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.47 
 
 
299 aa  237  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  40.54 
 
 
295 aa  236  5.0000000000000005e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  41.75 
 
 
302 aa  235  6e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.14 
 
 
296 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.14 
 
 
296 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.08 
 
 
296 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.08 
 
 
296 aa  231  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.08 
 
 
296 aa  231  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.08 
 
 
296 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.08 
 
 
296 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  40.74 
 
 
308 aa  229  4e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.61 
 
 
296 aa  229  4e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.28 
 
 
296 aa  229  5e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.28 
 
 
296 aa  229  5e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  40.4 
 
 
296 aa  229  6e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  42 
 
 
295 aa  229  6e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  42.03 
 
 
294 aa  228  9e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  41.08 
 
 
296 aa  228  9e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.33 
 
 
298 aa  228  9e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  39.86 
 
 
295 aa  228  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.44 
 
 
298 aa  228  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  40.21 
 
 
297 aa  227  1e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  39.86 
 
 
295 aa  228  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.28 
 
 
296 aa  227  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.15 
 
 
298 aa  227  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  41.41 
 
 
295 aa  226  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2255  tyrosine recombinase XerD  42.52 
 
 
305 aa  226  4e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000204462  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  40.14 
 
 
296 aa  226  4e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  41.08 
 
 
295 aa  226  5.0000000000000005e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  43.15 
 
 
320 aa  226  5.0000000000000005e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0537  tyrosine recombinase XerD subunit  42.03 
 
 
302 aa  225  7e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  39.24 
 
 
297 aa  224  1e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  40.6 
 
 
295 aa  223  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  42.76 
 
 
302 aa  222  6e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  39.58 
 
 
302 aa  221  1.9999999999999999e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  40.2 
 
 
295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  37.16 
 
 
294 aa  219  6e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.73 
 
 
298 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  40.54 
 
 
315 aa  217  2e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  39.53 
 
 
295 aa  216  4e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  42.03 
 
 
309 aa  216  5e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  40.07 
 
 
296 aa  216  5e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  40.34 
 
 
294 aa  216  5e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.78 
 
 
301 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.12 
 
 
299 aa  215  7e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.12 
 
 
299 aa  215  7e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16040  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.68 
 
 
298 aa  215  7e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  40.13 
 
 
295 aa  215  9e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4151  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.52 
 
 
298 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.78 
 
 
299 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1468  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.18 
 
 
298 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.208903 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.78 
 
 
299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  38.94 
 
 
302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  39.8 
 
 
303 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.78 
 
 
299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.78 
 
 
299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4253  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.18 
 
 
298 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2850  tyrosine recombinase XerD  41.78 
 
 
302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2471  tyrosine recombinase XerD  41.78 
 
 
302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.78 
 
 
299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  40.07 
 
 
302 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  38.8 
 
 
295 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  40.44 
 
 
277 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1073  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.83 
 
 
298 aa  212  7e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344511  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  41.29 
 
 
317 aa  211  7.999999999999999e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2797  tyrosine recombinase XerD  38.38 
 
 
298 aa  211  7.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2022  tyrosine recombinase XerD subunit  41.16 
 
 
309 aa  211  9e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  38.61 
 
 
302 aa  211  1e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.44 
 
 
299 aa  211  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0519  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.23 
 
 
302 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0998774  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1488  tyrosine recombinase XerD  40.55 
 
 
304 aa  211  1e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221019  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  37.37 
 
 
296 aa  210  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  38.26 
 
 
305 aa  210  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0577  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.36 
 
 
305 aa  209  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0855221  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  40.21 
 
 
309 aa  210  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  37.54 
 
 
302 aa  210  3e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.44 
 
 
299 aa  210  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  37.37 
 
 
305 aa  209  4e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3450  tyrosine recombinase XerD  36.83 
 
 
322 aa  209  4e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  39.59 
 
 
299 aa  209  4e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0057  tyrosine recombinase XerD  43.51 
 
 
312 aa  209  5e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  39.12 
 
 
299 aa  209  6e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.31 
 
 
299 aa  208  9e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  37.63 
 
 
316 aa  208  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1478  integrase/recombinase XerD  38.7 
 
 
298 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0755097  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1286  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.49 
 
 
298 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0511461  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  40.41 
 
 
301 aa  207  1e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1659  tyrosine recombinase XerD  44.49 
 
 
254 aa  207  1e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  38.64 
 
 
299 aa  207  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2739  integrase/recombinase XerD  38.83 
 
 
321 aa  208  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2127  tyrosine recombinase XerD  40.96 
 
 
308 aa  207  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  39.46 
 
 
292 aa  207  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0052  phage integrase  43.1 
 
 
312 aa  207  2e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1118  tyrosine recombinase XerD  37.5 
 
 
304 aa  207  2e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  39.06 
 
 
292 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0651  tyrosine recombinase XerD  38.91 
 
 
297 aa  206  4e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0950079  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  37.41 
 
 
290 aa  206  4e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  36.39 
 
 
304 aa  206  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>