More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0092 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  100 
 
 		 270 aa  548  1e-155  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1026  integrase family protein  38.66 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319361  normal  0.791294 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3470  phage integrase family protein  34.49 
 
 		 302 aa  150  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.229271  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6605  integrase family protein  33.21 
 
 		 292 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7619  integrase family protein  33.21 
 
 		 292 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7462  integrase family protein  33.21 
 
 		 292 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6957  integrase family protein  33.58 
 
 		 292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  37.78 
 
 		 284 aa  145  9e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2714  integron integrase  35.2 
 
 		 332 aa  143  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  34.33 
 
 		 301 aa  143  4e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3366  integron integrase  35.2 
 
 		 332 aa  142  6e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.341619 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2249  putative transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 325 aa  141  9e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1377  site-specific recombinase XerD  32.5 
 
 		 333 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000056918  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  38.68 
 
 		 304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1799  integron integrase  37.07 
 
 		 462 aa  140  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.174616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4806  phage integrase  35.56 
 
 		 291 aa  138  7.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3700  integrase family protein  33.97 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  37.66 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  33.46 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3006  integron integrase  35.43 
 
 		 334 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.976928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0262  integrase family protein  33.96 
 
 		 291 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8452  integrase family protein  33.59 
 
 		 286 aa  135  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.032039  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  36.05 
 
 		 295 aa  135  9e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4502  integrase family protein  35.56 
 
 		 290 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0542  integrase  32.4 
 
 		 330 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  35.56 
 
 		 297 aa  134  9.999999999999999e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0858  phage integrase  33.7 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1215  integron integrase  35.16 
 
 		 326 aa  133  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0068  phage integrase  32.46 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  37.44 
 
 		 295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0410  integron integrase  33.96 
 
 		 334 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.761535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3066  integrase family protein  34.75 
 
 		 390 aa  132  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0221886  normal  0.652565 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0257  integron integrase  34.9 
 
 		 338 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0364142  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3427  integron integrase  33.22 
 
 		 327 aa  132  6e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1585  phage integrase  33.33 
 
 		 286 aa  132  7.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.791115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  41.08 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0120  integrase/recombinase  32.91 
 
 		 337 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.400978 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  35.02 
 
 		 292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  32.29 
 
 		 320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0067  integrase/recombinase  32.91 
 
 		 337 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.325485 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2703  integron integrase  33.33 
 
 		 323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  36.61 
 
 		 296 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5342  integrase/recombinase  32.81 
 
 		 337 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1196  phage integrase  32.84 
 
 		 291 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  34.18 
 
 		 298 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2616  integron integrase  35.22 
 
 		 468 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  35.42 
 
 		 297 aa  129  6e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00230  putative tyrosine recombinase  44.89 
 
 		 265 aa  129  6e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.9402  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0143  integrase IntI1 for transposon Tn21  33.23 
 
 		 337 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2645  integron integrase  33.22 
 
 		 319 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.400636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.82 
 
 		 296 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3661  integrase family protein  32.97 
 
 		 290 aa  128  8.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.311976  decreased coverage  0.00000149049 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3629  integrase family protein  32.97 
 
 		 290 aa  128  8.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  35.48 
 
 		 292 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.82 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.82 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.82 
 
 		 296 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.82 
 
 		 296 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.82 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.82 
 
 		 296 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.82 
 
 		 296 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  35.87 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  39.89 
 
 		 346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0938  site-specific recombinase IntI4  32.44 
 
 		 320 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000827497  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.38 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.38 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1687  tyrosine recombinase XerD subunit  35.04 
 
 		 314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4832  phage integrase  30.97 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  34.07 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.38 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  32.58 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  34.48 
 
 		 291 aa  126  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  35.48 
 
 		 295 aa  127  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1844  DNA integrase  30.92 
 
 		 335 aa  126  3e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0478  tyrosine recombinase XerD  36.46 
 
 		 319 aa  126  3e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03738  putative integrase  32.7 
 
 		 322 aa  126  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0696  phage integrase  33.11 
 
 		 338 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  32.46 
 
 		 299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2872  phage integrase family protein  32.34 
 
 		 279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000984905  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1145  putative transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 408 aa  126  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.239655 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0779  integron integrase  30.1 
 
 		 320 aa  126  5e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000312296  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  39.59 
 
 		 362 aa  126  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  34.76 
 
 		 295 aa  125  6e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  36.17 
 
 		 295 aa  125  6e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.11 
 
 		 300 aa  125  7e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  32.74 
 
 		 294 aa  125  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  34.19 
 
 		 302 aa  125  7e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  34.06 
 
 		 297 aa  125  7e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  35.16 
 
 		 300 aa  125  8.000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0977  integron integrase  33.12 
 
 		 329 aa  125  8.000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  37.84 
 
 		 310 aa  125  9e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  36.41 
 
 		 316 aa  125  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5165  integrase family protein  31.11 
 
 		 291 aa  124  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0927  tyrosine recombinase XerD  32.36 
 
 		 304 aa  125  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2467  bifunctional hypothetical protein/integrase  32.48 
 
 		 457 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2169  tyrosine recombinase XerD  35.04 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  33.49 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1131  integron integrase  31.25 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  33.93 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>