34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3348 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3348  integrase domain protein SAM domain protein  100 
 
 		 121 aa  241  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8452  integrase family protein  80.56 
 
 		 286 aa  180  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.032039  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0858  phage integrase  47.37 
 
 		 289 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1196  phage integrase  47.66 
 
 		 291 aa  98.6  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0822  putative phage integrase  51.96 
 
 		 291 aa  96.7  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.341397 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3470  phage integrase family protein  47.57 
 
 		 302 aa  95.9  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.229271  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3700  integrase family protein  44.95 
 
 		 295 aa  95.5  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1077  integrase family protein  50.96 
 
 		 291 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6657  integrase family protein  50.96 
 
 		 291 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.358251 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4806  phage integrase  50 
 
 		 291 aa  94  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4502  integrase family protein  47.12 
 
 		 290 aa  92.8  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0826  putative phage integrase  50 
 
 		 266 aa  92  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.225694 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0262  integrase family protein  47.17 
 
 		 291 aa  88.2  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0373  integrase domain protein SAM domain protein  47.17 
 
 		 259 aa  87.4  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  46.15 
 
 		 301 aa  85.5  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0068  phage integrase  41.35 
 
 		 302 aa  84.7  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2797  phage integrase-like SAM-like  57.38 
 
 		 74 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.554398  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3629  integrase family protein  37.04 
 
 		 290 aa  67.4  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3661  integrase family protein  37.04 
 
 		 290 aa  67.4  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.311976  decreased coverage  0.00000149049 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3244  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  42.67 
 
 		 78 aa  66.6  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.042229  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3124  putative integrase/recombinase  44.3 
 
 		 185 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6605  integrase family protein  36.19 
 
 		 292 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7462  integrase family protein  36.19 
 
 		 292 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7619  integrase family protein  36.19 
 
 		 292 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6957  integrase family protein  36.79 
 
 		 292 aa  57  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5165  integrase family protein  33.65 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2872  phage integrase family protein  30.91 
 
 		 279 aa  54.3  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000984905  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4832  phage integrase  32.77 
 
 		 291 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1585  phage integrase  32.08 
 
 		 286 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.791115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2048  integrase domain-containing protein  33.65 
 
 		 187 aa  47.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.212868  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5049  integrase domain-containing protein  30.91 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1787  phage integrase family protein  31.17 
 
 		 283 aa  44.3  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2959  phage integrase family protein  31.17 
 
 		 283 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.164424 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0978  phage integrase family protein  29.25 
 
 		 283 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>