More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1647 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_1647  phage integrase family protein  100 
 
 		 322 aa  651    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0765801  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1508  phage integrase family protein  78.57 
 
 		 322 aa  537  9.999999999999999e-153  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000321752 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1634  phage integrase family protein  65.22 
 
 		 322 aa  437  9.999999999999999e-123  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00686439  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0135  integrase family protein  56.21 
 
 		 322 aa  389  1e-107  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0689406  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0418  integrase family protein  54.88 
 
 		 328 aa  370  1e-101  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0307048  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0436  integrase family protein  52.98 
 
 		 323 aa  351  7e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.788545  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1842  integrase family protein  52.6 
 
 		 340 aa  333  3e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00549349  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0060  phage integrase family protein  52.6 
 
 		 340 aa  333  3e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.106477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0262  phage integrase family protein  51.53 
 
 		 326 aa  332  4e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0110  integrase family protein  52.62 
 
 		 324 aa  330  2e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126491  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0036  integrase family protein  50.15 
 
 		 324 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.95657  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0021  phage integrase family protein  49.54 
 
 		 324 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.135699  hitchhiker  0.00129232 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0634  phage integrase family protein  47.98 
 
 		 321 aa  299  4e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.650036  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1225  phage integrase family protein  45.29 
 
 		 324 aa  279  6e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0633  phage integrase family protein  43.12 
 
 		 333 aa  250  2e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.191689  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0630  phage integrase family protein  38.1 
 
 		 347 aa  191  1e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.7962  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1179  phage integrase family protein  36.73 
 
 		 398 aa  178  1e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0294292  n/a   
 
 
-
 
NC_009136  MmarC5_1846  putative integrase/recombinase  36.27 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1484  phage integrase family protein  33.53 
 
 		 341 aa  161  1e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.269781  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2132  integron integrase  27.15 
 
 		 319 aa  95.9  9e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290373 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2037  phage integrase family site specific recombinase  26.55 
 
 		 319 aa  93.6  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3360  integron integrase  26.9 
 
 		 319 aa  93.2  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1682  integron integrase  25.86 
 
 		 319 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  29.09 
 
 		 296 aa  90.9  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  29.55 
 
 		 296 aa  90.5  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  28.72 
 
 		 299 aa  89.4  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1720  integron integrase  25.86 
 
 		 319 aa  89.4  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.945826  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4020  phage integrase family protein  34.23 
 
 		 327 aa  88.6  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  25.16 
 
 		 335 aa  87.8  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  27.08 
 
 		 295 aa  87  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0768  integrase family protein  24.46 
 
 		 337 aa  86.3  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000101801 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.5 
 
 		 299 aa  85.9  9e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5408  phage integrase family protein  24.43 
 
 		 330 aa  83.2  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.123433 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1924  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.53 
 
 		 325 aa  82.4  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.239497 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  28.67 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0775  integrase family protein  23.13 
 
 		 339 aa  81.6  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000364623 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3505  phage integrase family protein  23.64 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.431904  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  26.71 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  30.3 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  25.75 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0787  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E-like protein  25.86 
 
 		 320 aa  80.9  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00453269  unclonable  0.000000000000100471 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5348  integrase family protein  25.24 
 
 		 330 aa  80.1  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464558 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  31.98 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2228  integrase family protein  25.24 
 
 		 330 aa  80.1  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.763924 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2008  integrase family protein  25.24 
 
 		 330 aa  80.1  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  22.71 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  31.98 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  33.12 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  26.19 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  32.73 
 
 		 305 aa  79  0.00000000000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  25.87 
 
 		 286 aa  79  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0370  integrase family protein  22.07 
 
 		 332 aa  78.6  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2746  tyrosine recombinase XerC  25.71 
 
 		 314 aa  79  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  28.75 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2249  putative transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 325 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1915  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.46 
 
 		 345 aa  79  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279776  hitchhiker  0.00138491 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2366  integrase family protein  25.71 
 
 		 314 aa  79  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.18523  hitchhiker  0.000000198716 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.65 
 
 		 321 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  33.14 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.43 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  26.01 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0255  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.95 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0225677  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.43 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  26.37 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0537  tyrosine recombinase XerD subunit  25.34 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2692  tyrosine recombinase XerD  26.05 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.457784  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  24.21 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2501  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.71 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  0.936606 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  35.22 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  28.68 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.43 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  25.2 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3266  phage integrase family protein  23.15 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.119927  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  31.1 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3153  tyrosine recombinase XerD  32.32 
 
 		 443 aa  76.3  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  24.32 
 
 		 324 aa  75.5  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  25.98 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  25.52 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1906  integrase family protein  26.12 
 
 		 295 aa  75.9  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.713326  normal  0.217947 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.72 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.72 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.72 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  28.09 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0238  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.67 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0625179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.72 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.72 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7458  integrase family protein  20.98 
 
 		 335 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1355  phage integrase family site specific recombinase  24.15 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  26.67 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.08 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.6 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.37 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  25.82 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10100  site-specific recombinase XerD  31.61 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3714  tyrosine recombinase XerD  27.27 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  31.69 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  26.76 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  23.2 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0478  tyrosine recombinase XerD  32.12 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0978  phage integrase family protein  25.81 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>