More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1704 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008147  Mmcs_5577  phage integrase  99.71 
 
 
344 aa  702    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5980  phage integrase family protein  100 
 
 
364 aa  743    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.409193 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1704  phage integrase family protein  100 
 
 
364 aa  743    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20700  site-specific recombinase, integrase family  70.47 
 
 
395 aa  535  1e-151  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06590  site-specific recombinase, integrase family  69.28 
 
 
312 aa  451  1e-125  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0527476  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3734  phage integrase-like SAM-like  69.28 
 
 
323 aa  448  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.654981 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2147  phage integrase family protein  54.9 
 
 
367 aa  385  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4150  integrase family protein  42.03 
 
 
373 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.333103 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4540  transposase A  37.65 
 
 
361 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0043  phage integrase family protein  37.94 
 
 
361 aa  226  4e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1751  phage integrase family protein  37.94 
 
 
361 aa  226  4e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.252007  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1224  Tn554, transposase A  37.94 
 
 
361 aa  226  4e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0995985  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1347  Tn554, transposase A  37.94 
 
 
361 aa  226  4e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.444384  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2506  transposase A  37.94 
 
 
361 aa  226  4e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0043  phage integrase family protein  37.94 
 
 
361 aa  226  4e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1717  phage integrase family protein  37.94 
 
 
361 aa  226  4e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3147  Tn554-related, transposase A  33.61 
 
 
372 aa  209  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.85236  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1466  Tn554-related, transposase A  30.66 
 
 
370 aa  205  9e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000354684  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0986  Tn554-related, transposase A  32.39 
 
 
384 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.061254  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3970  phage integrase family protein  35.23 
 
 
388 aa  176  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1934  phage integrase  35.23 
 
 
388 aa  176  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3803  phage integrase family protein  35.23 
 
 
388 aa  176  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.704516  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2053  phage integrase-like SAM-like  63.24 
 
 
141 aa  168  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.227287  normal  0.287411 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5418  phage integrase family protein  35.4 
 
 
399 aa  159  6e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5398  phage integrase family protein  35.4 
 
 
399 aa  159  6e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.525123 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0512  phage integrase family protein  35.4 
 
 
399 aa  159  6e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0242  Tn554-related, transposase A  31.38 
 
 
519 aa  158  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1426  phage integrase family protein  33.51 
 
 
401 aa  156  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3896  phage integrase family protein  35.71 
 
 
393 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.466642 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5935  phage integrase family protein  35.71 
 
 
393 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0478  phage integrase family protein  35.71 
 
 
393 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3904  phage integrase family protein  35.71 
 
 
393 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156918  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3585  integrase family protein  33.86 
 
 
393 aa  139  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0961554  normal  0.0104097 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3044  integrase family protein  33.86 
 
 
393 aa  139  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00169579  hitchhiker  0.00511814 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3603  integrase family protein  33.86 
 
 
393 aa  139  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00185249  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3469  integrase family protein  33.86 
 
 
393 aa  139  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00208728  normal  0.0117425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3698  integrase family protein  33.86 
 
 
393 aa  139  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0843425  normal  0.150744 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3740  integrase family protein  33.86 
 
 
393 aa  139  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1215  integrase family protein  33.86 
 
 
393 aa  139  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0266422  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3706  integrase family protein  30.54 
 
 
334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000354013  normal  0.710204 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2522  integrase family protein  30.54 
 
 
334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000359584  hitchhiker  0.00166754 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1237  integrase family protein  30.54 
 
 
334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.212345 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2585  integrase family protein  31.49 
 
 
324 aa  116  6.9999999999999995e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4728  integrase family protein  31.49 
 
 
324 aa  116  6.9999999999999995e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2670  integrase family protein  31.49 
 
 
324 aa  116  6.9999999999999995e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  25.52 
 
 
295 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5285  phage integrase family protein  30.75 
 
 
388 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2147  phage integrase  30.9 
 
 
411 aa  107  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3532  phage integrase  30.9 
 
 
411 aa  107  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.346968  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4645  phage integrase family protein  30.64 
 
 
360 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  31.52 
 
 
295 aa  103  5e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1113  phage integrase family protein  27.14 
 
 
364 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0671879  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  29.31 
 
 
302 aa  102  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  28.36 
 
 
300 aa  99  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4792  phage integrase family protein  27.17 
 
 
411 aa  99  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2265  phage integrase family protein  27.17 
 
 
411 aa  99  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2972  phage integrase family protein  27.17 
 
 
411 aa  99  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  36.04 
 
 
286 aa  98.6  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1762  phage/XerD family site-specific recombinase  27.92 
 
 
338 aa  96.7  6e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  27.35 
 
 
302 aa  96.7  6e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  28.96 
 
 
290 aa  96.3  8e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  26.59 
 
 
302 aa  95.9  9e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  29.91 
 
 
302 aa  95.5  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  26.95 
 
 
302 aa  95.5  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  26.3 
 
 
302 aa  94.7  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  28.28 
 
 
295 aa  95.1  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  27.88 
 
 
282 aa  94.7  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  29.38 
 
 
320 aa  95.1  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  26.79 
 
 
292 aa  94  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  26.28 
 
 
298 aa  93.6  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  26.28 
 
 
298 aa  93.6  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  24.63 
 
 
299 aa  93.2  6e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  27.73 
 
 
314 aa  92.8  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  27.08 
 
 
292 aa  92  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0386  phage integrase family site specific recombinase  28.49 
 
 
400 aa  92  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  26.39 
 
 
296 aa  92  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1189  integrase family protein  24.34 
 
 
297 aa  91.7  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203109  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1934  phage integrase family protein  24.92 
 
 
297 aa  91.7  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  25.72 
 
 
307 aa  90.9  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1821  integrase family protein  22.51 
 
 
307 aa  90.9  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0364742  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  27.48 
 
 
305 aa  90.5  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  29.61 
 
 
297 aa  90.5  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.95 
 
 
299 aa  90.5  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  24.85 
 
 
296 aa  89.7  6e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  27.64 
 
 
296 aa  89.7  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  28.7 
 
 
297 aa  89.7  6e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  25.68 
 
 
313 aa  90.1  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  26.91 
 
 
295 aa  89.7  7e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  28.53 
 
 
291 aa  89.7  8e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  27.27 
 
 
302 aa  89.4  8e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  27.54 
 
 
309 aa  89  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3589  phage integrase family protein  29.23 
 
 
349 aa  89  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0127182 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  27.33 
 
 
298 aa  89  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5497  phage integrase family protein  29.23 
 
 
349 aa  89  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.052501 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0455  phage integrase family protein  29.23 
 
 
349 aa  89  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  29.67 
 
 
301 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  25.62 
 
 
277 aa  88.2  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  27.98 
 
 
309 aa  87.4  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3108  integrase family protein  25.55 
 
 
292 aa  87.8  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512092  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  24.72 
 
 
307 aa  87.8  3e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>