More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0262 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0262  phage integrase family protein  100 
 
 		 326 aa  665    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0060  phage integrase family protein  83.79 
 
 		 340 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.106477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1842  integrase family protein  83.79 
 
 		 340 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00549349  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0634  phage integrase family protein  69.16 
 
 		 321 aa  458  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.650036  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1634  phage integrase family protein  51.23 
 
 		 322 aa  340  2e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00686439  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1647  phage integrase family protein  51.53 
 
 		 322 aa  332  4e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0765801  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1508  phage integrase family protein  51.22 
 
 		 322 aa  332  5e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000321752 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0135  integrase family protein  50 
 
 		 322 aa  325  8.000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0689406  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0436  integrase family protein  49.23 
 
 		 323 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.788545  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0418  integrase family protein  49.1 
 
 		 328 aa  293  2e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0307048  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0110  integrase family protein  49.19 
 
 		 324 aa  290  2e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126491  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0036  integrase family protein  47.71 
 
 		 324 aa  281  1e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.95657  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0021  phage integrase family protein  47.39 
 
 		 324 aa  279  5e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.135699  hitchhiker  0.00129232 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1225  phage integrase family protein  41.52 
 
 		 324 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0633  phage integrase family protein  39.51 
 
 		 333 aa  223  3e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.191689  n/a   
 
 
-
 
NC_009136  MmarC5_1846  putative integrase/recombinase  33.65 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1179  phage integrase family protein  34.92 
 
 		 398 aa  166  5e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0294292  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0630  phage integrase family protein  35.76 
 
 		 347 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.7962  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1484  phage integrase family protein  31.82 
 
 		 341 aa  149  6e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.269781  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  28.37 
 
 		 284 aa  91.3  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  26.83 
 
 		 296 aa  89.4  9e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5348  integrase family protein  27.84 
 
 		 330 aa  87.4  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464558 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2008  integrase family protein  27.84 
 
 		 330 aa  87.4  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2228  integrase family protein  27.84 
 
 		 330 aa  87.4  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.763924 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1241  phage integrase  26.57 
 
 		 336 aa  85.5  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  25.94 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0861  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.34 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3505  phage integrase family protein  27.3 
 
 		 330 aa  82.4  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.431904  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0775  integrase family protein  24.48 
 
 		 339 aa  82  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000364623 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.98 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0370  integrase family protein  25.18 
 
 		 332 aa  81.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  24.74 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 282 aa  81.6  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3266  phage integrase family protein  25.4 
 
 		 330 aa  81.6  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.119927  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  27.5 
 
 		 313 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0319  tyrosine recombinase XerD  27.67 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.944891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5408  phage integrase family protein  25.52 
 
 		 330 aa  80.1  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.123433 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0645  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.34 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.241995  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7458  integrase family protein  25.33 
 
 		 335 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1762  phage/XerD family site-specific recombinase  26.1 
 
 		 338 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  31.18 
 
 		 307 aa  79  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  26.34 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02726  site-specific tyrosine recombinase XerD  30 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0798  tyrosine recombinase XerD  30 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.966972  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0920  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.14 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3847  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.14 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.349121 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3053  site-specific tyrosine recombinase XerD  30 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3220  site-specific tyrosine recombinase XerD  30 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4185  site-specific tyrosine recombinase XerD  30 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  30 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3314  site-specific tyrosine recombinase XerD  30 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3200  site-specific tyrosine recombinase XerD  30 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3278  site-specific tyrosine recombinase XerD  30 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0879  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.14 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.201006  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0292  tyrosine recombinase XerD  28.12 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0815  site-specific tyrosine recombinase XerD  30 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.624778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3027  site-specific tyrosine recombinase XerD  30 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3380  site-specific tyrosine recombinase XerD  30 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02689  hypothetical protein  30 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.364794  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3300  tyrosine recombinase XerD  30 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3892  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.74 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3426  tyrosine recombinase XerD  32.34 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  31.93 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1283  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.99 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4897  integrase family protein  25.5 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2872  phage integrase family protein  28.35 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000984905  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.29 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.97 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3275  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.47 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3550  integrase family protein  24.75 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16040  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.1 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2501  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.67 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  0.936606 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2739  integrase/recombinase XerD  27.53 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  24.45 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0750  site-specific tyrosine recombinase XerD  25 
 
 		 311 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  25.6 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2194  integrase family protein  30.05 
 
 		 317 aa  75.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1995  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.18 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0537  tyrosine recombinase XerD subunit  27.1 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0478  tyrosine recombinase XerD  29.78 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  24.58 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004441  site-specific recombinase XerD  27.89 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  25 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2797  tyrosine recombinase XerD  24.64 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  30.04 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3066  integrase family protein  27.59 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0221886  normal  0.652565 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  24.56 
 
 		 286 aa  73.9  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3312  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.77 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  27.24 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0255  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.76 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0225677  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2746  tyrosine recombinase XerC  25 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2366  integrase family protein  25 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.18523  hitchhiker  0.000000198716 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  25.63 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  26.2 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  26.98 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2692  tyrosine recombinase XerD  26.14 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.457784  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1286  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.97 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0511461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1585  site-specific recombinase XerD-like  23.88 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.264485  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  27.05 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00956  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.37 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>