More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3550 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3550  integrase family protein  100 
 
 		 324 aa  660    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0273  tyrosine recombinase XerC  42.09 
 
 		 300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.007038  normal  0.809464 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  40.53 
 
 		 293 aa  216  4e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  39.87 
 
 		 293 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  40.86 
 
 		 302 aa  210  3e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  37.33 
 
 		 294 aa  209  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  36.91 
 
 		 300 aa  209  7e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0582  integrase family protein  37.61 
 
 		 330 aa  206  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.132855 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  41.69 
 
 		 311 aa  205  8e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  40.2 
 
 		 332 aa  205  9e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  39.26 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  39.81 
 
 		 313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.87 
 
 		 300 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0222  integrase/recombinase XerC  39.8 
 
 		 299 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  40.13 
 
 		 299 aa  199  7e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  41.58 
 
 		 307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  37.46 
 
 		 298 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.46 
 
 		 300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.18 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.18 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.18 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  36.49 
 
 		 296 aa  197  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.18 
 
 		 299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.18 
 
 		 299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.18 
 
 		 299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.18 
 
 		 299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.18 
 
 		 299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.93 
 
 		 299 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  40.4 
 
 		 298 aa  196  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  39.68 
 
 		 309 aa  196  6e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  38.06 
 
 		 295 aa  195  7e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6023  site-specific tyrosine recombinase XerC  40.4 
 
 		 303 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.21 
 
 		 298 aa  195  9e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  39.39 
 
 		 304 aa  195  9e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.5 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3247  integrase/recombinase XerC  38.54 
 
 		 296 aa  195  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.44 
 
 		 298 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.86 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0242  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.37 
 
 		 299 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.322874  normal  0.826572 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.7 
 
 		 296 aa  194  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.61 
 
 		 302 aa  193  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.182372  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3971  tyrosine recombinase XerC  38.51 
 
 		 306 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.5 
 
 		 296 aa  193  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.38 
 
 		 296 aa  193  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.5 
 
 		 296 aa  193  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.5 
 
 		 296 aa  193  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0489  tyrosine recombinase XerC  35.28 
 
 		 299 aa  193  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.5 
 
 		 296 aa  193  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3993  tyrosine recombinase XerC  38.51 
 
 		 306 aa  192  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  35.23 
 
 		 295 aa  193  4e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.38 
 
 		 296 aa  193  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  36.84 
 
 		 307 aa  192  5e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3894  tyrosine recombinase XerC  38.51 
 
 		 306 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533729 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.17 
 
 		 296 aa  192  5e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  40.13 
 
 		 342 aa  192  5e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69710  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.73 
 
 		 303 aa  192  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.737312  normal  0.478185 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  40.51 
 
 		 343 aa  192  6e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1762  phage/XerD family site-specific recombinase  36.36 
 
 		 338 aa  192  7e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  36.84 
 
 		 307 aa  192  7e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03687  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.59 
 
 		 298 aa  192  8e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.446663  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5230  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.38 
 
 		 299 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.38 
 
 		 296 aa  192  8e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03636  hypothetical protein  39.59 
 
 		 298 aa  192  8e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.487194  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47730  site-specific tyrosine recombinase XerC  40.4 
 
 		 299 aa  192  8e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0435757  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.38 
 
 		 296 aa  192  8e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4168  tyrosine recombinase XerC  39.18 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4271  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.18 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4196  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.18 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0689633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  38.54 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0688  integrase family protein  36.94 
 
 		 336 aa  191  1e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4330  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.18 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  37.71 
 
 		 291 aa  191  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1299  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.41 
 
 		 291 aa  191  1e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.18 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0208532 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4036  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.18 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  35.53 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0234  site-specific tyrosine recombinase XerC  40.47 
 
 		 302 aa  191  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  38.59 
 
 		 294 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  40.19 
 
 		 343 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5291  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.05 
 
 		 299 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5501  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.05 
 
 		 299 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  38.39 
 
 		 303 aa  190  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5139  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.38 
 
 		 299 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  38.34 
 
 		 335 aa  190  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  37.38 
 
 		 305 aa  190  2e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2528  tyrosine recombinase XerC  37.25 
 
 		 294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.237042 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0264  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.93 
 
 		 315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.3 
 
 		 299 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4336  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.06 
 
 		 300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  36.93 
 
 		 296 aa  190  4e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.59 
 
 		 298 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4164  site-specific tyrosine recombinase XerC  40.13 
 
 		 311 aa  189  4e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.154418  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  37 
 
 		 298 aa  189  5e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  35.84 
 
 		 290 aa  189  5e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  38.71 
 
 		 295 aa  189  5.999999999999999e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4087  tyrosine recombinase XerC  38.19 
 
 		 306 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0169707 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  33 
 
 		 307 aa  189  5.999999999999999e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4159  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.72 
 
 		 300 aa  188  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.937296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  37.25 
 
 		 302 aa  189  8e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4277  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.72 
 
 		 300 aa  188  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>