More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0110 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0110  integrase family protein  100 
 
 		 324 aa  653    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126491  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0021  phage integrase family protein  75.31 
 
 		 324 aa  522  1e-147  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.135699  hitchhiker  0.00129232 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0036  integrase family protein  75 
 
 		 324 aa  521  1e-147  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.95657  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1634  phage integrase family protein  55.08 
 
 		 322 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00686439  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0135  integrase family protein  53.54 
 
 		 322 aa  348  6e-95  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0689406  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1508  phage integrase family protein  55.08 
 
 		 322 aa  345  6e-94  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000321752 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1647  phage integrase family protein  52.62 
 
 		 322 aa  330  2e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0765801  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0418  integrase family protein  51.83 
 
 		 328 aa  328  6e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0307048  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0436  integrase family protein  51.6 
 
 		 323 aa  317  1e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.788545  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0060  phage integrase family protein  49.68 
 
 		 340 aa  300  2e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.106477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1842  integrase family protein  49.68 
 
 		 340 aa  300  2e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00549349  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0633  phage integrase family protein  47.6 
 
 		 333 aa  294  1e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.191689  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0262  phage integrase family protein  49.19 
 
 		 326 aa  290  2e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0634  phage integrase family protein  47.04 
 
 		 321 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.650036  n/a   
 
 
-
 
NC_009136  MmarC5_1846  putative integrase/recombinase  44.74 
 
 		 304 aa  265  7e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1225  phage integrase family protein  45.32 
 
 		 324 aa  264  2e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1484  phage integrase family protein  34.5 
 
 		 341 aa  194  1e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.269781  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0630  phage integrase family protein  38.8 
 
 		 347 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.7962  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1179  phage integrase family protein  36.12 
 
 		 398 aa  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0294292  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2132  integron integrase  25 
 
 		 319 aa  92.8  8e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290373 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2037  phage integrase family site specific recombinase  25 
 
 		 319 aa  90.9  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3360  integron integrase  25.36 
 
 		 319 aa  89.7  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1682  integron integrase  26.09 
 
 		 319 aa  89.4  7e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1720  integron integrase  25.72 
 
 		 319 aa  85.9  9e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.945826  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  27.71 
 
 		 305 aa  85.9  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  24.23 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0779  integron integrase  25.77 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000312296  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  25.61 
 
 		 286 aa  80.9  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  28.94 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2249  putative transcriptional regulator, TetR family  24.45 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  24 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  30.12 
 
 		 295 aa  79  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  31.02 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5408  phage integrase family protein  27.56 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.123433 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7458  integrase family protein  24.41 
 
 		 335 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1799  integron integrase  25.34 
 
 		 462 aa  77  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.174616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0083  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.46 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0738  integrase/recombinase  25.1 
 
 		 340 aa  75.9  0.0000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  26.77 
 
 		 291 aa  75.5  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  27.18 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  28.51 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  23.75 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  24.62 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2147  phage integrase family protein  25.95 
 
 		 367 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  24.37 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0927  tyrosine recombinase XerD  34.59 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6461  phage integrase family protein  30.86 
 
 		 412 aa  73.2  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624578 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  33.73 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  25.26 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03687  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.88 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.446663  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  30.86 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003169  integron integrase IntI4  25.89 
 
 		 320 aa  72  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05531  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.55 
 
 		 347 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2797  tyrosine recombinase XerD  23.13 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03636  hypothetical protein  23.88 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.487194  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  26.21 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  24.05 
 
 		 299 aa  72.4  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  24.84 
 
 		 310 aa  72  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  26.84 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5250  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.57 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4168  tyrosine recombinase XerC  23.88 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.31 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.31 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.88 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0208532 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4196  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.88 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0689633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.31 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4036  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.88 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.31 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1145  putative transcriptional regulator, TetR family  24.66 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.239655 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4271  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.88 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  34.48 
 
 		 367 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  30.86 
 
 		 403 aa  71.2  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  28.4 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  32.35 
 
 		 435 aa  70.5  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.31 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.31 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2844  integrase family protein  26.06 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  27.08 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  33.55 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4330  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.88 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  26.56 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2194  integrase family protein  25.56 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  25.19 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3928  integrase family protein  27.51 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.41 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  24.83 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0787  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E-like protein  27.35 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00453269  unclonable  0.000000000000100471 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.31 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.83 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  26.41 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  28.83 
 
 		 389 aa  69.7  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4307  integron integrase  25.36 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.38 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  21.8 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  23.08 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  26.96 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2241  integrase family protein  28.33 
 
 		 345 aa  69.7  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.640527  hitchhiker  0.000757999 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1201  phage integrase  25.93 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0529826  normal  0.150621 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0537  tyrosine recombinase XerD subunit  25.17 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>