More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0255 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0255  site-specific tyrosine recombinase XerD  100 
 
 
301 aa  622  1e-177  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0225677  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  40.13 
 
 
296 aa  208  7e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  36.81 
 
 
295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  37.25 
 
 
295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  38.01 
 
 
310 aa  194  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  37.84 
 
 
302 aa  193  3e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  38.21 
 
 
296 aa  193  4e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  35.22 
 
 
302 aa  190  2e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  37.79 
 
 
296 aa  190  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  37.67 
 
 
296 aa  190  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  35.55 
 
 
302 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  37.75 
 
 
308 aa  189  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  37.42 
 
 
308 aa  188  1e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  37.97 
 
 
294 aa  187  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  35.12 
 
 
297 aa  187  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  34.88 
 
 
302 aa  187  2e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  36.99 
 
 
290 aa  187  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0645  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.79 
 
 
299 aa  187  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.241995  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0920  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.38 
 
 
299 aa  186  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  35.15 
 
 
309 aa  186  4e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3847  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.38 
 
 
299 aa  186  4e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.349121 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0879  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.38 
 
 
299 aa  186  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.201006  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  37.42 
 
 
317 aa  184  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0562  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.54 
 
 
300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  37.25 
 
 
295 aa  183  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  37.84 
 
 
303 aa  183  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0646575 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  35.97 
 
 
294 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  37.67 
 
 
300 aa  181  9.000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  37 
 
 
295 aa  181  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.36 
 
 
296 aa  181  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  37.92 
 
 
299 aa  181  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2276  tyrosine recombinase XerD  34.97 
 
 
301 aa  181  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235275  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.91 
 
 
299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0651  tyrosine recombinase XerD  37.29 
 
 
297 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0950079  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  35.62 
 
 
297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0222  integrase/recombinase XerC  32.89 
 
 
299 aa  179  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0815  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.71 
 
 
298 aa  179  4e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.624778  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3426  tyrosine recombinase XerD  37.12 
 
 
299 aa  179  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3892  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.04 
 
 
299 aa  179  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413643  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00956  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.16 
 
 
305 aa  179  5.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  37.29 
 
 
294 aa  179  5.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  36.67 
 
 
292 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  38.31 
 
 
304 aa  179  5.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4696  integrase family protein  36.68 
 
 
306 aa  179  7e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0590  tyrosine recombinase XerD  37.62 
 
 
306 aa  178  9e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  39.34 
 
 
306 aa  178  1e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004441  site-specific recombinase XerD  35.81 
 
 
305 aa  178  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3714  tyrosine recombinase XerD  36.54 
 
 
301 aa  178  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  37 
 
 
298 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3304  tyrosine recombinase XerD  37.42 
 
 
298 aa  178  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133185  normal  0.394454 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  34.77 
 
 
305 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0861  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.12 
 
 
299 aa  177  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.02 
 
 
296 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.02 
 
 
296 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.02 
 
 
296 aa  177  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.02 
 
 
296 aa  176  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  36.88 
 
 
296 aa  176  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.02 
 
 
296 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0747  tyrosine recombinase XerD  36.15 
 
 
303 aa  176  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000635712  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3312  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.58 
 
 
298 aa  176  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1450  integrase family protein  36.84 
 
 
299 aa  176  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  normal  0.734684 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.35 
 
 
296 aa  176  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.32 
 
 
299 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.35 
 
 
296 aa  176  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  34.98 
 
 
320 aa  176  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  33.99 
 
 
313 aa  176  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  33.89 
 
 
297 aa  176  6e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4151  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.38 
 
 
298 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  35.35 
 
 
295 aa  175  7e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.02 
 
 
296 aa  175  7e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0805  tyrosine recombinase XerD  36.49 
 
 
300 aa  175  7e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.02 
 
 
296 aa  175  7e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.35 
 
 
296 aa  175  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  37.46 
 
 
295 aa  175  8e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02726  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.37 
 
 
298 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0798  tyrosine recombinase XerD  37.37 
 
 
298 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.966972  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  33.56 
 
 
293 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0950  integrase/recombinase XerD  38.05 
 
 
300 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4185  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.37 
 
 
298 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3300  tyrosine recombinase XerD  36.67 
 
 
299 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1432  tyrosine recombinase XerD  36.03 
 
 
321 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0895087  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3314  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.37 
 
 
298 aa  174  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  37.87 
 
 
302 aa  175  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3053  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.37 
 
 
298 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  42.67 
 
 
277 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3275  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.67 
 
 
298 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1283  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.33 
 
 
297 aa  174  9.999999999999999e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0663  tyrosine recombinase XerD  35.64 
 
 
305 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3220  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.37 
 
 
298 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02689  hypothetical protein  37.37 
 
 
298 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.364794  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  34.12 
 
 
296 aa  175  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3027  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.37 
 
 
298 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0893  tyrosine recombinase XerD  38.05 
 
 
304 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0105661 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3524  tyrosine recombinase XerD  37.16 
 
 
309 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  37.24 
 
 
303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3200  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.67 
 
 
298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  37.04 
 
 
309 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3278  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.67 
 
 
298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1995  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.16 
 
 
302 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.67 
 
 
298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.476349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>