More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1508 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1508  phage integrase family protein  100 
 
 		 322 aa  652    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000321752 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1647  phage integrase family protein  78.57 
 
 		 322 aa  537  9.999999999999999e-153  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0765801  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1634  phage integrase family protein  66.77 
 
 		 322 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00686439  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0135  integrase family protein  58.07 
 
 		 322 aa  401  1e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0689406  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0418  integrase family protein  56.1 
 
 		 328 aa  376  1e-103  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0307048  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0436  integrase family protein  56.73 
 
 		 323 aa  358  6e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.788545  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0110  integrase family protein  55.08 
 
 		 324 aa  345  6e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126491  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0060  phage integrase family protein  51.38 
 
 		 340 aa  338  9e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.106477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1842  integrase family protein  51.38 
 
 		 340 aa  338  9e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00549349  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0262  phage integrase family protein  51.22 
 
 		 326 aa  332  5e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0021  phage integrase family protein  49.54 
 
 		 324 aa  318  6e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.135699  hitchhiker  0.00129232 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0036  integrase family protein  49.54 
 
 		 324 aa  318  9e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.95657  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0634  phage integrase family protein  49.22 
 
 		 321 aa  310  2e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.650036  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1225  phage integrase family protein  45.09 
 
 		 324 aa  285  8e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0633  phage integrase family protein  43.95 
 
 		 333 aa  246  3e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.191689  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0630  phage integrase family protein  39.35 
 
 		 347 aa  192  8e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.7962  n/a   
 
 
-
 
NC_009136  MmarC5_1846  putative integrase/recombinase  37.42 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1179  phage integrase family protein  36.69 
 
 		 398 aa  169  5e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0294292  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1484  phage integrase family protein  31.63 
 
 		 341 aa  151  1e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.269781  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  26.86 
 
 		 335 aa  92  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0768  integrase family protein  25.27 
 
 		 337 aa  90.5  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000101801 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2132  integron integrase  27.24 
 
 		 319 aa  88.6  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290373 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2249  putative transcriptional regulator, TetR family  25.61 
 
 		 325 aa  87.4  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4020  phage integrase family protein  35.57 
 
 		 327 aa  87  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2037  phage integrase family site specific recombinase  26.19 
 
 		 319 aa  86.3  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0775  integrase family protein  24.91 
 
 		 339 aa  85.5  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000364623 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3360  integron integrase  26.53 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1682  integron integrase  26.87 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1924  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 325 aa  82.8  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.239497 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  27.82 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5408  phage integrase family protein  25.52 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.123433 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  23.83 
 
 		 311 aa  82  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  24.74 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1720  integron integrase  26.53 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.945826  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.82 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3066  integrase family protein  28.63 
 
 		 390 aa  80.9  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0221886  normal  0.652565 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7458  integrase family protein  24.22 
 
 		 335 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  27.37 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1915  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.12 
 
 		 345 aa  80.5  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279776  hitchhiker  0.00138491 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  25.68 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  25.54 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  26.18 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  33.77 
 
 		 301 aa  79  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1247  Phage integrase  36.13 
 
 		 278 aa  79  0.00000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  29.48 
 
 		 305 aa  79  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0478  tyrosine recombinase XerD  25.34 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3505  phage integrase family protein  24.66 
 
 		 330 aa  79  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.431904  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  26.27 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  28.15 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5348  integrase family protein  24.74 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464558 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  23.81 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2008  integrase family protein  24.74 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2228  integrase family protein  24.74 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.763924 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.64 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  25.79 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  25.35 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  33.75 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.25 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  23.9 
 
 		 310 aa  75.5  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  25 
 
 		 300 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  33.7 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  30.38 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  29.01 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  27 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  27 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.99 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  25.6 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  25.34 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.99 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  27 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2501  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.2 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  0.936606 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1355  phage integrase family site specific recombinase  25.93 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0978  phage integrase family protein  25.51 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.85 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  27 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  27 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3153  tyrosine recombinase XerD  33.76 
 
 		 443 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2616  integron integrase  23.17 
 
 		 468 aa  74.3  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  27 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2467  bifunctional hypothetical protein/integrase  22.8 
 
 		 457 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3661  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.31 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.85 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0238  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.85 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0625179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0245  integrase family protein  25.63 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1762  phage/XerD family site-specific recombinase  24.85 
 
 		 338 aa  73.6  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4897  integrase family protein  24.72 
 
 		 336 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0787  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E-like protein  24.33 
 
 		 320 aa  73.2  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00453269  unclonable  0.000000000000100471 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.33 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.33 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.67 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  24.16 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  24.13 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  30.38 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3124  integrase family protein  22.71 
 
 		 323 aa  72.4  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.83 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.25 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.25 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  31.82 
 
 		 300 aa  72.4  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1137  phage integrase  25.1 
 
 		 296 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  34.62 
 
 		 295 aa  72  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>