More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1634 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_1634  phage integrase family protein  100 
 
 
322 aa  651    Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00686439  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1508  phage integrase family protein  66.77 
 
 
322 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000321752 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1647  phage integrase family protein  65.22 
 
 
322 aa  437  9.999999999999999e-123  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0765801  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0135  integrase family protein  57.14 
 
 
322 aa  404  1e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0689406  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0436  integrase family protein  56.19 
 
 
323 aa  372  1e-102  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.788545  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0418  integrase family protein  55.66 
 
 
328 aa  368  1e-101  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0307048  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0110  integrase family protein  55.08 
 
 
324 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126491  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0036  integrase family protein  53.85 
 
 
324 aa  345  5e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.95657  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0060  phage integrase family protein  51.07 
 
 
340 aa  344  1e-93  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.106477  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1842  integrase family protein  51.07 
 
 
340 aa  344  1e-93  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00549349  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0021  phage integrase family protein  53.23 
 
 
324 aa  342  7e-93  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.135699  hitchhiker  0.00129232 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0262  phage integrase family protein  51.23 
 
 
326 aa  340  2e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0634  phage integrase family protein  50.31 
 
 
321 aa  317  2e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.650036  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1225  phage integrase family protein  46.93 
 
 
324 aa  298  1e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0633  phage integrase family protein  41.54 
 
 
333 aa  241  1e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.191689  n/a   
 
 
-
 
NC_009136  MmarC5_1846  putative integrase/recombinase  37.91 
 
 
304 aa  196  3e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0630  phage integrase family protein  40.07 
 
 
347 aa  183  3e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.7962  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1179  phage integrase family protein  37.04 
 
 
398 aa  181  1e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0294292  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1484  phage integrase family protein  32.14 
 
 
341 aa  169  7e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.269781  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  29.49 
 
 
299 aa  98.6  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  29.67 
 
 
298 aa  95.9  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0775  integrase family protein  24.13 
 
 
339 aa  93.6  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000364623 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.47 
 
 
299 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7593  integrase family protein  26.53 
 
 
331 aa  89  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  27.18 
 
 
296 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0768  integrase family protein  24.46 
 
 
337 aa  88.2  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000101801 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  27.5 
 
 
284 aa  87  3e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2132  integron integrase  25.08 
 
 
319 aa  87  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000290373 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2797  tyrosine recombinase XerD  25.95 
 
 
298 aa  86.7  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  26.89 
 
 
305 aa  85.1  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  26.62 
 
 
316 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5408  phage integrase family protein  25.62 
 
 
330 aa  84.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.123433 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  24.72 
 
 
335 aa  83.2  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  26.09 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0667  integrase family protein  28.9 
 
 
332 aa  82.8  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.580243  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3124  integrase family protein  25.68 
 
 
323 aa  82.8  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2031  integrase family protein  28.9 
 
 
332 aa  82.8  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2399  site-specific recombinase, phage integrase family  28.9 
 
 
332 aa  82.8  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0509  site-specific recombinase, phage integrase family  28.9 
 
 
332 aa  82.8  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0833  site-specific recombinase, phage integrase family  28.9 
 
 
332 aa  82.8  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0328  integrase family protein  28.9 
 
 
332 aa  82.8  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.133269 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  25.57 
 
 
295 aa  82.8  0.000000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2037  phage integrase family site specific recombinase  24.22 
 
 
319 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  26.53 
 
 
298 aa  82  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.12 
 
 
298 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6955  integrase family protein  26.52 
 
 
343 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.67 
 
 
296 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1906  integrase family protein  31.52 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.713326  normal  0.217947 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  27.74 
 
 
302 aa  80.5  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1924  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.68 
 
 
325 aa  80.5  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.239497 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2692  tyrosine recombinase XerD  26.6 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.457784  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7620  integrase family protein  26.52 
 
 
343 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3505  phage integrase family protein  26.52 
 
 
330 aa  80.1  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.431904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.17 
 
 
296 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.17 
 
 
296 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.17 
 
 
296 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.17 
 
 
296 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  27.73 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  24.67 
 
 
299 aa  80.1  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.91 
 
 
296 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.94 
 
 
296 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.91 
 
 
296 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  27.74 
 
 
302 aa  79.7  0.00000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.17 
 
 
296 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0177  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.26 
 
 
323 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  24.72 
 
 
299 aa  79.3  0.00000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5348  integrase family protein  24.91 
 
 
330 aa  79.3  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.464558 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2228  integrase family protein  24.91 
 
 
330 aa  79.3  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.763924 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2008  integrase family protein  24.91 
 
 
330 aa  79.3  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461761  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  26.96 
 
 
293 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3066  integrase family protein  29.39 
 
 
390 aa  79.3  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0221886  normal  0.652565 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  28.99 
 
 
293 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  31.58 
 
 
295 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  32.47 
 
 
307 aa  78.6  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.91 
 
 
296 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  25.86 
 
 
295 aa  78.6  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  26.71 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  26.01 
 
 
312 aa  79  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  31.58 
 
 
295 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  25.54 
 
 
295 aa  79  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.76 
 
 
299 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  24.83 
 
 
295 aa  79  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.91 
 
 
296 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3360  integron integrase  24 
 
 
319 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1762  phage/XerD family site-specific recombinase  25.67 
 
 
338 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  25.79 
 
 
296 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  24.66 
 
 
313 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1682  integron integrase  23.6 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2501  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.65 
 
 
312 aa  77.4  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  0.936606 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  23.97 
 
 
310 aa  77  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  25 
 
 
295 aa  77  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  32.93 
 
 
295 aa  76.6  0.0000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  26.21 
 
 
305 aa  76.6  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.42 
 
 
299 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1026  integrase family protein  36.54 
 
 
283 aa  76.3  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319361  normal  0.791294 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.67 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  34.5 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  25.93 
 
 
286 aa  76.3  0.0000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.67 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.67 
 
 
299 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>