More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0585 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0585  integrase family protein  100 
 
 		 251 aa  504  9.999999999999999e-143  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0569  integrase family protein  89.64 
 
 		 251 aa  452  1.0000000000000001e-126  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0286562 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5294  integrase family protein  40.89 
 
 		 268 aa  132  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  35.52 
 
 		 270 aa  105  7e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  34.2 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  33.87 
 
 		 295 aa  96.7  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1891  phage integrase family protein  32.98 
 
 		 278 aa  96.3  4e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1355  hypothetical protein  53.33 
 
 		 114 aa  94.7  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.620859  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  34.34 
 
 		 297 aa  94  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  34 
 
 		 299 aa  93.2  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1780  phage integrase family protein  30.88 
 
 		 256 aa  91.3  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000232909  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  34.03 
 
 		 295 aa  90.9  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  31.34 
 
 		 302 aa  89.7  4e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  33.95 
 
 		 307 aa  89.4  6e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1823  integrase family protein  29.56 
 
 		 253 aa  88.6  8e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.987007  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0861  integrase/recombinase XerC  34.9 
 
 		 304 aa  88.6  9e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  35.32 
 
 		 298 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0023  integrase family protein  31.47 
 
 		 291 aa  87.4  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  28.92 
 
 		 302 aa  87  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  28.43 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  32.12 
 
 		 304 aa  86.7  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  31.16 
 
 		 308 aa  85.9  5e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  32.66 
 
 		 311 aa  85.5  7e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0772  phage integrase  33.83 
 
 		 304 aa  85.5  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0927  tyrosine recombinase XerD  35.63 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  36.55 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.8 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  35.36 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  31 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.5 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  34.18 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  34.18 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0978  phage integrase family protein  34.08 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0358  integrase family protein  27.84 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  30.85 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  34.03 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  32.48 
 
 		 307 aa  82.4  0.000000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.88 
 
 		 296 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.88 
 
 		 296 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  34.18 
 
 		 309 aa  82.4  0.000000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0350  phage integrase family protein  35.22 
 
 		 341 aa  82.4  0.000000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000105216  hitchhiker  0.0000498769 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.66 
 
 		 296 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.66 
 
 		 296 aa  82  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.66 
 
 		 296 aa  82  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.65 
 
 		 296 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47730  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.2 
 
 		 299 aa  82  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0435757  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  28 
 
 		 294 aa  82  0.000000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.66 
 
 		 296 aa  82  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.65 
 
 		 296 aa  82  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  32.07 
 
 		 310 aa  82  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.65 
 
 		 296 aa  82  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  30.81 
 
 		 346 aa  82  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  35.42 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  34.18 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  34 
 
 		 314 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  31.63 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4524  Phage integrase  29.85 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2992  tyrosine recombinase XerD  30.96 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  35.48 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  31.12 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4785  integrase family protein  35.03 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000301446  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  31.12 
 
 		 307 aa  80.1  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3139  phage integrase family protein  35.71 
 
 		 344 aa  80.1  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424721  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  33.12 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  32.63 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  28.64 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2528  tyrosine recombinase XerC  34.02 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.237042 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5643  tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.776137 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.39 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0264  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.81 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  32.64 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  29.15 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  30.27 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1023  integrase family protein  34.3 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0854512  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3153  tyrosine recombinase XerD  38.22 
 
 		 443 aa  79.3  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  37.21 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.59 
 
 		 311 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1026  integrase family protein  27.47 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319361  normal  0.791294 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0279  phage integrase family protein  33.71 
 
 		 282 aa  79  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.033075  hitchhiker  0.000013626 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  31.98 
 
 		 311 aa  79  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.77 
 
 		 299 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1687  tyrosine recombinase XerD subunit  35.03 
 
 		 314 aa  79  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  35.29 
 
 		 295 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  31.84 
 
 		 306 aa  79  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10100  site-specific recombinase XerD  39.49 
 
 		 332 aa  79  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  29.3 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  33.5 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  31.12 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  31.34 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  31.16 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1560  tyrosine recombinase XerD  33.17 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.736869  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  29.56 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3124  integrase family protein  31.44 
 
 		 323 aa  77.8  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0787  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E-like protein  32.28 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00453269  unclonable  0.000000000000100471 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0577  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.64 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0855221  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  32.28 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.5 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1412  integrase family protein  33.55 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.5 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>