More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2844 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2844  integrase family protein  100 
 
 
329 aa  682    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2825  integrase domain protein SAM domain protein  52.36 
 
 
269 aa  208  9e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0562  integrase/recombinase  37.97 
 
 
308 aa  203  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0843058  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2420  integrase family protein  34.56 
 
 
335 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0132691 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2421  integrase family protein  32.57 
 
 
323 aa  170  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0129159 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2124  phage integrase family protein  30.74 
 
 
301 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.308322  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0370  phage integrase family protein  31.37 
 
 
304 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1439  integrase family protein  31.63 
 
 
317 aa  151  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.110569  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0078  phage integrase family protein  31.76 
 
 
319 aa  145  1e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0272  phage integrase family site specific recombinase  30.64 
 
 
319 aa  143  4e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0295  phage integrase family site specific recombinase  30.64 
 
 
319 aa  143  4e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0905  phage integrase family site specific recombinase  30.64 
 
 
319 aa  143  4e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.22 
 
 
300 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_63  site-specific recombinase, phage integrase family  30.35 
 
 
332 aa  129  9.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.03 
 
 
300 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1360  integrase/recombinase  28.34 
 
 
306 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6099899999999998e-31 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0542  integrase domain protein SAM domain protein  55.08 
 
 
120 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1227  integrase family protein  29.64 
 
 
305 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.842173  decreased coverage  0.000216705 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  29.86 
 
 
310 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3924  integrase family protein  26.06 
 
 
321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.733894 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1316  integrase/recombinase  27.81 
 
 
306 aa  117  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.718184  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  28.43 
 
 
302 aa  115  8.999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  30.28 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0669  integrase-recombinase  26.81 
 
 
311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  30.36 
 
 
294 aa  114  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.18 
 
 
299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.82 
 
 
299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  30.36 
 
 
296 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.45 
 
 
299 aa  113  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  26.07 
 
 
332 aa  113  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.82 
 
 
299 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.82 
 
 
299 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.45 
 
 
299 aa  112  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.82 
 
 
299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.82 
 
 
299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.82 
 
 
299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  26.81 
 
 
305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  29.75 
 
 
317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  28.42 
 
 
295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  28.15 
 
 
295 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2981  integrase family protein  25.65 
 
 
307 aa  107  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0010  tyrosine recombinase XerC  31.02 
 
 
299 aa  107  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.36 
 
 
299 aa  107  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0023  integrase family protein  27.97 
 
 
291 aa  107  4e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2179  integrase family protein  26.1 
 
 
288 aa  107  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.353401  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  28.87 
 
 
307 aa  106  5e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.36 
 
 
301 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  26.55 
 
 
300 aa  105  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  27.27 
 
 
292 aa  104  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  25.9 
 
 
297 aa  104  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  24.82 
 
 
300 aa  104  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1283  phage integrase family protein  24.75 
 
 
304 aa  104  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000135681  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  27.15 
 
 
296 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  26.91 
 
 
302 aa  101  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0872  phage integrase family protein  30.41 
 
 
324 aa  101  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  26.78 
 
 
293 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2063  tyrosine recombinase XerD  27.51 
 
 
290 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1777  tyrosine recombinase XerD  27.31 
 
 
290 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  27.92 
 
 
290 aa  101  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0273  tyrosine recombinase XerC  28.43 
 
 
300 aa  101  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.007038  normal  0.809464 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  24.73 
 
 
283 aa  101  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  25.89 
 
 
303 aa  100  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0646575 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0319  tyrosine recombinase XerD  24.76 
 
 
307 aa  100  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.944891  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  26.42 
 
 
309 aa  100  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  30.04 
 
 
296 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  27.21 
 
 
296 aa  99.8  6e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  27.21 
 
 
294 aa  99.8  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3706  integrase family protein  26.13 
 
 
334 aa  99  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000354013  normal  0.710204 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1237  integrase family protein  26.13 
 
 
334 aa  99  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.212345 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2522  integrase family protein  26.13 
 
 
334 aa  99  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000359584  hitchhiker  0.00166754 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  27.21 
 
 
298 aa  99  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2593  integrase family protein  26.33 
 
 
291 aa  99  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2544  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.37 
 
 
308 aa  98.6  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  26.71 
 
 
293 aa  98.6  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0292  tyrosine recombinase XerD  24.75 
 
 
305 aa  99  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1434  phage integrase family protein  29.55 
 
 
322 aa  98.2  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  26.28 
 
 
301 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  27.03 
 
 
307 aa  98.2  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  27.59 
 
 
298 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  27.42 
 
 
296 aa  98.2  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0056  phage integrase family protein  27.48 
 
 
332 aa  97.8  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0775  phage integrase family protein  24.71 
 
 
286 aa  97.4  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0341069  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  25.62 
 
 
285 aa  97.4  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4984  prophage LambdaBa03, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25 
 
 
301 aa  97.4  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  27.3 
 
 
298 aa  97.4  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5363  prophage lambdaba03, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25 
 
 
301 aa  97.4  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.256716  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2169  tyrosine recombinase XerD  26.06 
 
 
298 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  27.3 
 
 
298 aa  97.4  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2276  tyrosine recombinase XerD  26.72 
 
 
301 aa  97.4  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235275  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0519  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.51 
 
 
302 aa  97.1  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0998774  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  23.65 
 
 
301 aa  96.7  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  25.4 
 
 
317 aa  96.7  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.68 
 
 
298 aa  96.7  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0900  integrase  29.55 
 
 
322 aa  96.7  5e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000819417  hitchhiker  0.000000626468 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  25.5 
 
 
307 aa  96.7  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  25.65 
 
 
317 aa  96.3  6e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  27.36 
 
 
294 aa  96.3  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1185  integrase family protein  28.12 
 
 
311 aa  96.3  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0318  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.44 
 
 
300 aa  95.9  8e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0543  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.46 
 
 
303 aa  95.9  8e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>