More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BAS4984 on replicon NC_005945
Organism: Bacillus anthracis str. Sterne



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS4984  prophage LambdaBa03, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  100 
 
 
301 aa  621  1e-177  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5363  prophage lambdaba03, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  100 
 
 
301 aa  621  1e-177  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.256716  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0669  integrase-recombinase  40.52 
 
 
311 aa  227  2e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3738  prophage LambdaBa03, site-specific recombinase, phage integrase family  36.12 
 
 
304 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000543556  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0370  phage integrase family protein  32.9 
 
 
304 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2124  phage integrase family protein  30.59 
 
 
301 aa  136  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.308322  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0272  phage integrase family site specific recombinase  27.48 
 
 
319 aa  120  3e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0295  phage integrase family site specific recombinase  27.48 
 
 
319 aa  120  3e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0905  phage integrase family site specific recombinase  27.48 
 
 
319 aa  120  3e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_63  site-specific recombinase, phage integrase family  26.25 
 
 
332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0078  phage integrase family protein  27.96 
 
 
319 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  31.06 
 
 
308 aa  112  7.000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  28.09 
 
 
302 aa  112  7.000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  27.76 
 
 
295 aa  112  8.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  27.76 
 
 
295 aa  112  8.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  30.71 
 
 
303 aa  109  6e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.72 
 
 
299 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  27.17 
 
 
299 aa  108  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.57 
 
 
299 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  29.78 
 
 
298 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  28.47 
 
 
295 aa  107  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0727  tyrosine recombinase XerD  29.74 
 
 
304 aa  106  6e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  30.18 
 
 
305 aa  106  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.87 
 
 
299 aa  105  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.87 
 
 
299 aa  105  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.87 
 
 
299 aa  105  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.87 
 
 
299 aa  105  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.71 
 
 
298 aa  105  9e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.33 
 
 
296 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.33 
 
 
296 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.87 
 
 
299 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.33 
 
 
296 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.33 
 
 
296 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  29.18 
 
 
298 aa  105  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.33 
 
 
296 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0056  phage integrase family protein  26.3 
 
 
332 aa  104  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.22 
 
 
301 aa  104  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.87 
 
 
299 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.33 
 
 
296 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.69 
 
 
296 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  25.5 
 
 
332 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  29.85 
 
 
297 aa  104  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.33 
 
 
296 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.87 
 
 
299 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.87 
 
 
299 aa  103  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  26.42 
 
 
295 aa  102  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  25.37 
 
 
295 aa  101  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  27 
 
 
277 aa  101  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  26.16 
 
 
299 aa  101  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  30.6 
 
 
302 aa  101  1e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0318  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.56 
 
 
300 aa  100  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.62 
 
 
299 aa  101  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.98 
 
 
296 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.33 
 
 
296 aa  100  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.98 
 
 
296 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  30.16 
 
 
296 aa  100  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  25.44 
 
 
290 aa  100  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  26.78 
 
 
298 aa  100  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2022  tyrosine recombinase XerD subunit  28.11 
 
 
309 aa  100  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0927  tyrosine recombinase XerD  27.53 
 
 
304 aa  100  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  27.21 
 
 
316 aa  99.8  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1360  integrase/recombinase  28.48 
 
 
306 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6099899999999998e-31 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  26.43 
 
 
299 aa  99.4  7e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  26.39 
 
 
295 aa  99  9e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2421  integrase family protein  24.83 
 
 
323 aa  99  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0129159 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2797  tyrosine recombinase XerD  27.3 
 
 
298 aa  99  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1821  integrase family protein  27.21 
 
 
307 aa  97.8  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0364742  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.54 
 
 
300 aa  98.2  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  28.72 
 
 
301 aa  97.4  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  24.32 
 
 
301 aa  97.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0409  Phage integrase  23.51 
 
 
317 aa  97.1  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.383536  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2844  integrase family protein  25 
 
 
329 aa  97.4  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  27.24 
 
 
303 aa  96.7  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0646575 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  26.2 
 
 
292 aa  97.1  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2420  integrase family protein  29.57 
 
 
335 aa  96.7  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0132691 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1844  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.25 
 
 
315 aa  96.3  6e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.104424  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1916  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.25 
 
 
315 aa  95.9  7e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.391518  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.53 
 
 
299 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1118  tyrosine recombinase XerD  26.39 
 
 
304 aa  95.9  8e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0562  integrase/recombinase  30.94 
 
 
308 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0843058  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.41 
 
 
300 aa  95.5  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0805  tyrosine recombinase XerD  25.45 
 
 
300 aa  95.5  9e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69710  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.89 
 
 
303 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.737312  normal  0.478185 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6023  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.54 
 
 
303 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  24.81 
 
 
305 aa  94.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  27.87 
 
 
295 aa  94.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1716  tyrosine recombinase XerD  24.01 
 
 
303 aa  94.7  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.500655  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  27.14 
 
 
306 aa  94.4  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  27.51 
 
 
294 aa  94.7  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1227  integrase family protein  26.62 
 
 
305 aa  94  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.842173  decreased coverage  0.000216705 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  24.34 
 
 
308 aa  94  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  26.49 
 
 
300 aa  93.6  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0142  integrase family protein  26.04 
 
 
292 aa  93.6  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  24.91 
 
 
294 aa  93.6  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  26.04 
 
 
295 aa  93.2  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1313  tyrosine recombinase XerD  23.84 
 
 
309 aa  92.8  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  26.33 
 
 
301 aa  92.8  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  26.09 
 
 
297 aa  92.4  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1067  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.72 
 
 
305 aa  92.4  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0590  tyrosine recombinase XerD  25.83 
 
 
306 aa  92.4  8e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>