More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0775 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0775  phage integrase family protein  100 
 
 
286 aa  573  1.0000000000000001e-163  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0341069  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  74.56 
 
 
283 aa  411  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  69.12 
 
 
285 aa  385  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2179  integrase family protein  61.4 
 
 
288 aa  331  8e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.353401  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1846  integrase family protein  40.82 
 
 
370 aa  188  9e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000018136  normal  0.604263 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0924  phage integrase family protein  37.67 
 
 
294 aa  186  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.852644  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  36.24 
 
 
293 aa  176  6e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3916  integrase family protein  36.52 
 
 
295 aa  165  9e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0254607  normal  0.244131 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2439  integrase family protein  33.22 
 
 
283 aa  158  8e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000285613  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3102  integrase family protein  29.63 
 
 
301 aa  142  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000184896  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1820  phage integrase family protein  30.8 
 
 
283 aa  139  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.111306  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3587  integrase family protein  30.84 
 
 
304 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  decreased coverage  0.00000000515843  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2344  phage integrase  38.49 
 
 
322 aa  137  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0456613  normal  0.219342 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0037  integrase-recombinase protein  31.43 
 
 
285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.491877  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3445  integrase family protein  31.49 
 
 
304 aa  132  6e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  33.09 
 
 
294 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1127  phage integrase  29.07 
 
 
301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3619  phage integrase family protein  36.82 
 
 
309 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.215155  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  35.59 
 
 
294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  28.72 
 
 
310 aa  119  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2593  integrase family protein  34.11 
 
 
291 aa  116  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  34.64 
 
 
295 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  34.64 
 
 
295 aa  114  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1026  integrase family protein  27.92 
 
 
283 aa  113  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319361  normal  0.791294 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0116  Phage integrase, N-terminal SAM- like  29.08 
 
 
309 aa  112  7.000000000000001e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  33 
 
 
304 aa  112  7.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  28.18 
 
 
295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  34.51 
 
 
332 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1189  integrase family protein  28.77 
 
 
297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203109  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  28.14 
 
 
304 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1519  integrase family protein  29.3 
 
 
279 aa  108  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959361  decreased coverage  3.1361700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0863  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  32.28 
 
 
210 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5218  integrase family protein  30.9 
 
 
326 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  32.49 
 
 
294 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1797  phage integrase  35.71 
 
 
303 aa  107  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.742134 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  30 
 
 
296 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  32.83 
 
 
295 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  28.62 
 
 
298 aa  106  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  33.68 
 
 
295 aa  106  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.24 
 
 
296 aa  106  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  28.62 
 
 
298 aa  106  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  32.08 
 
 
301 aa  105  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  30.22 
 
 
295 aa  105  7e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0173  tyrosine recombinase XerD  29.92 
 
 
309 aa  105  8e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.861385  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.24 
 
 
296 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0358  integrase family protein  26.09 
 
 
287 aa  104  1e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  25.17 
 
 
290 aa  104  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.24 
 
 
296 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.24 
 
 
296 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3738  tyrosine recombinase XerD subunit  36.94 
 
 
328 aa  104  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  27.8 
 
 
305 aa  103  2e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1885  phage integrase-like SAM-like  33.15 
 
 
190 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.618174  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.52 
 
 
296 aa  103  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4760  integrase family protein  32.22 
 
 
354 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0645  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.63 
 
 
299 aa  103  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.241995  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  32.13 
 
 
292 aa  103  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.88 
 
 
296 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  26.52 
 
 
296 aa  103  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.88 
 
 
296 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.88 
 
 
296 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  26.32 
 
 
282 aa  103  4e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  29.62 
 
 
293 aa  103  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  34.56 
 
 
304 aa  103  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.88 
 
 
296 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  32.45 
 
 
301 aa  102  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0562  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.42 
 
 
300 aa  102  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.88 
 
 
296 aa  102  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.88 
 
 
296 aa  102  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 
304 aa  102  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0023  integrase family protein  28.47 
 
 
291 aa  102  8e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  29.37 
 
 
293 aa  102  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  36 
 
 
311 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  31.41 
 
 
294 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0861  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.99 
 
 
299 aa  101  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0015  Phage integrase  28.43 
 
 
310 aa  102  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.230922  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0687  Phage integrase  29.33 
 
 
310 aa  101  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.004827  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.82 
 
 
299 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  30.4 
 
 
313 aa  102  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3062  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.08 
 
 
308 aa  101  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  32.74 
 
 
295 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  30.18 
 
 
302 aa  101  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  30.53 
 
 
310 aa  101  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  29.8 
 
 
302 aa  101  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1205  integrase/recombinase XerD  32.72 
 
 
274 aa  101  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.27 
 
 
328 aa  100  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0825  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.99 
 
 
277 aa  101  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104756  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0292  tyrosine recombinase XerD  34.46 
 
 
305 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  32.37 
 
 
307 aa  100  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3304  tyrosine recombinase XerD  30.53 
 
 
298 aa  100  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133185  normal  0.394454 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  30.39 
 
 
294 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1585  site-specific recombinase XerD-like  32.17 
 
 
332 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.264485  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002113  tyrosine recombinase XerC  31.11 
 
 
310 aa  100  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  32.37 
 
 
307 aa  100  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2815  integrase/recombinase XerD  35.43 
 
 
311 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  32.37 
 
 
307 aa  100  4e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  27.17 
 
 
296 aa  99.8  5e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3474  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.27 
 
 
296 aa  99.8  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4009  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.99 
 
 
303 aa  99.8  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.99 
 
 
303 aa  99.8  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.279091  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0543  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.99 
 
 
303 aa  99.8  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>