More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1807 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1807  integrase family protein  100 
 
 		 278 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.73649  hitchhiker  0.0000891918 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  32.88 
 
 		 222 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3921  phage integrase family protein  26.87 
 
 		 327 aa  105  7e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470105  hitchhiker  0.00183347 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  28.63 
 
 		 330 aa  105  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  30.04 
 
 		 338 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3654  Phage integrase  29.03 
 
 		 340 aa  102  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000207497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  29.89 
 
 		 334 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01212  site-specific recombinase, resolvase family protein  29.96 
 
 		 336 aa  100  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1722  hypothetical protein  28.32 
 
 		 339 aa  99.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1522  phage integrase family site specific recombinase  28.67 
 
 		 339 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  28.47 
 
 		 347 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  28.47 
 
 		 347 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3949  site-specific recombinase, phage integrase family  28.68 
 
 		 347 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0244166  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0401  phage integrase family protein  30 
 
 		 332 aa  92.8  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  29.96 
 
 		 380 aa  92.4  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0495  integrase family protein  29.27 
 
 		 328 aa  92.4  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1679  phage integrase family site specific recombinase  28.46 
 
 		 356 aa  91.7  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229259  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0807  phage integrase family protein  26.92 
 
 		 323 aa  89.4  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1655  integrase/recombinase protein  30.64 
 
 		 334 aa  89  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3971  integrase family protein  27.57 
 
 		 340 aa  89  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164476  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  30.68 
 
 		 354 aa  88.2  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  28.73 
 
 		 375 aa  86.7  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3178  phage integrase family protein  28.74 
 
 		 339 aa  86.3  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0368902  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  25.68 
 
 		 351 aa  85.9  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04371  hypothetical protein  26.72 
 
 		 321 aa  85.5  9e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0639  integrase family protein  27.96 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  25.68 
 
 		 351 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  34.59 
 
 		 337 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0108  shufflon-specific DNA recombinase  27.9 
 
 		 395 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0242  integrase family protein  27.13 
 
 		 373 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2659  integrase family protein  35 
 
 		 531 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0969  integrase family protein  34.81 
 
 		 348 aa  79.7  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.23183  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2847  phage integrase  26.41 
 
 		 366 aa  79.7  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  25.98 
 
 		 367 aa  79.3  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  26.55 
 
 		 413 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  35.34 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  26.45 
 
 		 402 aa  75.9  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1465  integrase family protein  32.87 
 
 		 334 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.890522 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1808  phage integrase family site specific recombinase  28.74 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.595703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  29.09 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0382  putative site-specific integrase/recombinase  28.57 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  26.71 
 
 		 353 aa  72.8  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  27.36 
 
 		 286 aa  72  0.000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0847  integrase family protein  26.88 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  29.28 
 
 		 397 aa  72  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0397  shufflon-specific DNA recombinase  34.73 
 
 		 353 aa  70.1  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.759416  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03811  site-specific recombinase XerD  27 
 
 		 327 aa  69.7  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  26.16 
 
 		 374 aa  68.9  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3493  integrase  30.06 
 
 		 571 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  23.62 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  23.91 
 
 		 354 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  23.91 
 
 		 354 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1667  phage integrase family protein  26.07 
 
 		 372 aa  67  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0996  phage integrase family protein  25.76 
 
 		 387 aa  67  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294682 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  24.39 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1049  integrase family protein  25.62 
 
 		 380 aa  65.9  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1271  integrase family protein  34.62 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.828065  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3980  phage integrase family protein  24.7 
 
 		 365 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1556  site-specific recombinase, phage integrase family  34.62 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1111  phage integrase family protein  25.48 
 
 		 329 aa  63.9  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0633  phage integrase family protein  30.82 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.191689  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  27.03 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7113  integrase family protein  30.6 
 
 		 347 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00596865 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.14 
 
 		 318 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  27.24 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1484  phage integrase family protein  31.16 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.269781  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3426  tyrosine recombinase XerD  26.1 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  31.21 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.48 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.48 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2038  tyrosine recombinase XerD  23.67 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.487981  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3300  tyrosine recombinase XerD  25.7 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1220  integrase  32.35 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0770  phage integrase family protein  24.31 
 
 		 387 aa  59.3  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17567  normal  0.038003 
 
 
-
 
NC_002936  DET0323  phage integrase family site specific recombinase  26.95 
 
 		 336 aa  58.9  0.00000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.158931  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0710  Integrase protein  25.62 
 
 		 343 aa  58.9  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0290  integrase  24.73 
 
 		 324 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0955438  normal  0.658855 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  24.54 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  24.54 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3098  integrase family protein  24.17 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0209  phage integrase family protein  23.97 
 
 		 379 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7637  integrase family protein  26.77 
 
 		 425 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.38 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3952  integrase family protein  29.38 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  25.21 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  23.97 
 
 		 341 aa  57.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  25.73 
 
 		 386 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  27.42 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.1 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  26.32 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3847  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.52 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.349121 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  26.22 
 
 		 482 aa  57  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0879  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.52 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.201006  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0920  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.52 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1133  integrase family protein  24.26 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  26.37 
 
 		 381 aa  57  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  26.37 
 
 		 415 aa  57  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1794  integrase family protein  27.78 
 
 		 343 aa  57  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0543031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1634  phage integrase family protein  32.39 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00686439  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  26.32 
 
 		 290 aa  57  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>