More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1349 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  100 
 
 		 291 aa  580  1.0000000000000001e-165  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  54.98 
 
 		 286 aa  323  3e-87  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  33.57 
 
 		 295 aa  150  3e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  27.51 
 
 		 311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  29.89 
 
 		 290 aa  109  5e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  30.65 
 
 		 282 aa  107  3e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  28.15 
 
 		 284 aa  107  3e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  29.1 
 
 		 320 aa  105  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1297  phage integrase family protein  29.5 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0750  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.32 
 
 		 311 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0574  integrase family protein  29.79 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2147  phage integrase family protein  27.44 
 
 		 367 aa  104  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.87 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1023  integrase family protein  37.91 
 
 		 297 aa  103  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0854512  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  31.36 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4540  transposase A  28.17 
 
 		 361 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0279  phage integrase family protein  29.43 
 
 		 282 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.033075  hitchhiker  0.000013626 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.32 
 
 		 311 aa  102  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3569  phage integrase family protein  29.27 
 
 		 300 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121799  normal  0.0892176 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.52 
 
 		 296 aa  102  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.52 
 
 		 296 aa  102  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.52 
 
 		 296 aa  102  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.52 
 
 		 296 aa  102  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0523  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.22 
 
 		 315 aa  102  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221654  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.52 
 
 		 296 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  28.94 
 
 		 313 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.87 
 
 		 296 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  30.24 
 
 		 295 aa  101  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  31.08 
 
 		 304 aa  101  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  29.67 
 
 		 314 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2544  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.94 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.18 
 
 		 296 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.18 
 
 		 296 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3275  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.39 
 
 		 298 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0663  tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 305 aa  100  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3012  tyrosine recombinase XerD subunit  29.08 
 
 		 295 aa  99.4  6e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146868  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0653  integrase family protein  28.52 
 
 		 282 aa  99.4  6e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.319783  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2241  integrase family protein  28.1 
 
 		 296 aa  99.4  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000667129 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1821  integrase family protein  29.9 
 
 		 307 aa  99.4  7e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0364742  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  28.43 
 
 		 296 aa  99.4  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  28.57 
 
 		 308 aa  99  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  28.62 
 
 		 303 aa  99  9e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646575 
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  30.69 
 
 		 307 aa  98.6  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  30.69 
 
 		 307 aa  98.6  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0722  phage integrase family protein  32.16 
 
 		 306 aa  98.6  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0599364 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4851  integrase family protein  24.64 
 
 		 294 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02726  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.92 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0798  tyrosine recombinase XerD  31.92 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.966972  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3053  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.92 
 
 		 298 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3847  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.85 
 
 		 299 aa  97.8  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.349121 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0920  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.85 
 
 		 299 aa  97.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0879  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.85 
 
 		 299 aa  97.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.201006  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.92 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0118  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.94 
 
 		 333 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.412982  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0914  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.94 
 
 		 333 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1246  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0815  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.92 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.624778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3380  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.92 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_63  site-specific recombinase, phage integrase family  27.89 
 
 		 332 aa  97.8  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0911  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.94 
 
 		 333 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4185  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.92 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0747  tyrosine recombinase XerD  30.41 
 
 		 303 aa  97.8  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000635712  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3200  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.92 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02689  hypothetical protein  31.92 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.364794  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1695  phage integrase family protein  27.74 
 
 		 296 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.363626  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3220  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.92 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0893  tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 304 aa  97.4  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0105661 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3304  tyrosine recombinase XerD  30.2 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133185  normal  0.394454 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3278  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.92 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2504  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.4 
 
 		 329 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3314  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.92 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3027  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.92 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0369  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.4 
 
 		 305 aa  97.1  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1067  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.4 
 
 		 305 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2583  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.94 
 
 		 318 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6131  integrase family protein  29.41 
 
 		 305 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0466  Fis family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 362 aa  97.1  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0431  phage integrase  30.9 
 
 		 291 aa  97.1  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.173073 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0737  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.51 
 
 		 316 aa  97.4  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.088128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1948  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.94 
 
 		 318 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2559  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.94 
 
 		 318 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1995  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.64 
 
 		 302 aa  97.1  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0669  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.4 
 
 		 305 aa  97.1  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0726  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.08 
 
 		 333 aa  97.1  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218987  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  28.67 
 
 		 302 aa  96.7  4e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.05 
 
 		 298 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  27.52 
 
 		 302 aa  96.3  5e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0577  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.3 
 
 		 305 aa  96.3  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0855221  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  29.6 
 
 		 307 aa  95.9  6e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2821  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.04 
 
 		 314 aa  95.9  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.626713 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0890  tyrosine recombinase XerD  26.97 
 
 		 300 aa  95.9  7e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.267893  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0562  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.5 
 
 		 300 aa  95.5  8e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0967  phage integrase family protein  28.04 
 
 		 324 aa  95.5  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2415  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.55 
 
 		 298 aa  95.5  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0319  tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 307 aa  95.5  9e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.944891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2127  tyrosine recombinase XerD  26.74 
 
 		 308 aa  94.7  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  28.38 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2607  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.49 
 
 		 322 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3892  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.16 
 
 		 299 aa  95.5  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413643  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>