More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0574 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0574  integrase family protein  100 
 
 		 295 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1297  phage integrase family protein  98.64 
 
 		 295 aa  596  1e-169  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0762  phage integrase family protein  53.42 
 
 		 287 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0653  integrase family protein  44.25 
 
 		 282 aa  240  2e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.319783  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0240  tyrosine recombinase XerC subunit  43.45 
 
 		 291 aa  238  1e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.295303  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0949  phage integrase family protein  42.49 
 
 		 275 aa  236  3e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.427827  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0279  phage integrase family protein  41.61 
 
 		 282 aa  227  2e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.033075  hitchhiker  0.000013626 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0880  phage integrase family protein  34.71 
 
 		 291 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0027577 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  29.45 
 
 		 295 aa  105  9e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  29.79 
 
 		 291 aa  105  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  27.24 
 
 		 310 aa  103  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  28.47 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  30.48 
 
 		 284 aa  99.4  6e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  25.8 
 
 		 286 aa  98.6  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  30.18 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1821  integrase family protein  27.8 
 
 		 307 aa  97.1  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0364742  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  27.46 
 
 		 309 aa  96.3  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  26.53 
 
 		 299 aa  95.1  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0519  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.68 
 
 		 302 aa  95.1  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0998774  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  25.09 
 
 		 294 aa  94.7  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0577  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.78 
 
 		 305 aa  94  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0855221  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  25.33 
 
 		 300 aa  93.2  4e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  26.14 
 
 		 307 aa  92.8  6e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1689  integrase family protein  26.87 
 
 		 292 aa  91.7  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0836065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  24.5 
 
 		 296 aa  91.3  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4009  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.61 
 
 		 303 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.61 
 
 		 303 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.279091  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  23.84 
 
 		 307 aa  90.9  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0543  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.61 
 
 		 303 aa  90.9  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5117  tyrosine recombinase XerD  25.69 
 
 		 327 aa  89.7  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  28.47 
 
 		 296 aa  89.7  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3108  integrase family protein  35.33 
 
 		 292 aa  89.7  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512092  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0722  phage integrase family protein  26.54 
 
 		 306 aa  89.7  6e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0599364 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  23.65 
 
 		 310 aa  89  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3458  tyrosine recombinase XerD  24.48 
 
 		 303 aa  88.6  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05531  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.53 
 
 		 347 aa  88.6  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1687  tyrosine recombinase XerD subunit  24.04 
 
 		 314 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  24.61 
 
 		 307 aa  89  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  28.85 
 
 		 294 aa  87.8  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2544  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.57 
 
 		 308 aa  87.4  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2241  integrase family protein  26.42 
 
 		 345 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.640527  hitchhiker  0.000757999 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0772  phage integrase  23.78 
 
 		 304 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3445  integrase family protein  27.66 
 
 		 304 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3589  phage integrase family protein  29.71 
 
 		 349 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127182 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  26.97 
 
 		 293 aa  87.4  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0455  phage integrase family protein  29.71 
 
 		 349 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5497  phage integrase family protein  29.71 
 
 		 349 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052501 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2169  tyrosine recombinase XerD  24.39 
 
 		 298 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  27.11 
 
 		 294 aa  87  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  25.75 
 
 		 314 aa  86.7  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  25.25 
 
 		 303 aa  86.7  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  25.61 
 
 		 320 aa  86.7  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3228  tyrosine recombinase XerD  25.17 
 
 		 300 aa  86.7  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.302685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  29.43 
 
 		 282 aa  86.3  5e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.34 
 
 		 299 aa  86.3  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5250  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.54 
 
 		 298 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  26.67 
 
 		 290 aa  85.9  7e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  23.21 
 
 		 309 aa  85.9  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2705  integrase family protein  26.69 
 
 		 304 aa  85.9  7e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.800791  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  23.65 
 
 		 304 aa  85.9  8e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2739  integrase/recombinase XerD  26.18 
 
 		 321 aa  85.9  8e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0234  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.54 
 
 		 302 aa  85.5  9e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4168  tyrosine recombinase XerC  25.18 
 
 		 298 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4271  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.18 
 
 		 298 aa  85.5  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4036  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.18 
 
 		 298 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  26.12 
 
 		 285 aa  85.1  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4330  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.18 
 
 		 298 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  27.03 
 
 		 295 aa  85.5  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4196  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.18 
 
 		 298 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0689633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.18 
 
 		 298 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0208532 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0738  integrase/recombinase  25 
 
 		 340 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3331  tyrosine recombinase XerD  25.17 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03687  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.18 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.446663  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0626  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.88 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  25.89 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03636  hypothetical protein  25.18 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.487194  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  25.66 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  26.01 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  25.93 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0795  tyrosine recombinase XerD  24.56 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  25.25 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0184  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.81 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.72736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  25.93 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0023  integrase family protein  25.09 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.4 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  25.56 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  25.86 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0222  integrase/recombinase XerC  21.89 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.44 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  24.19 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  24.65 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3449  tyrosine recombinase XerD  25.56 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2421  integrase family protein  25.64 
 
 		 323 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0129159 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  22.93 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0843  tyrosine recombinase XerD  25.56 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  25.42 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2860  tyrosine recombinase XerC subunit  25.44 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0787  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E-like protein  26.48 
 
 		 320 aa  82.8  0.000000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00453269  unclonable  0.000000000000100471 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4127  tyrosine recombinase XerC  23.9 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.442069 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1201  phage integrase  26.54 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0529826  normal  0.150621 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>