156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0235 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0235  integrase domain protein SAM domain protein  100 
 
 		 370 aa  764    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  22.32 
 
 		 307 aa  65.9  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  22.83 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.73 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0110  integrase family protein  22.44 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126491  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0633  phage integrase family protein  21.38 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.191689  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  21.43 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.94 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1484  phage integrase family protein  22.32 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.269781  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3665  integrase family protein  21.9 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211751 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3700  integrase family protein  22.86 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  22.56 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0251  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.73 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00631913  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0021  phage integrase family protein  22.12 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.135699  hitchhiker  0.00129232 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0036  integrase family protein  22.44 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.95657  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  23.2 
 
 		 320 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1225  phage integrase family protein  21.82 
 
 		 324 aa  55.1  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3458  tyrosine recombinase XerD  23.59 
 
 		 303 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3558  phage integrase family protein  26.29 
 
 		 311 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  21.5 
 
 		 295 aa  53.9  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2210  integrase family protein  27.04 
 
 		 295 aa  53.5  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241024 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0418  integrase family protein  22.53 
 
 		 328 aa  53.5  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0307048  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  21.45 
 
 		 295 aa  53.5  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2815  integrase/recombinase XerD  23.08 
 
 		 311 aa  53.1  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  22.93 
 
 		 296 aa  53.1  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  23.66 
 
 		 291 aa  52.4  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5914  integrase family protein  27.22 
 
 		 325 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000658468  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  24.08 
 
 		 313 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  23.56 
 
 		 303 aa  52  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2471  tyrosine recombinase XerC subunit  26.15 
 
 		 308 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  21.32 
 
 		 294 aa  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1481  phage integrase family protein  23.08 
 
 		 311 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0281722  normal  0.205606 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0634  phage integrase family protein  20.22 
 
 		 321 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.650036  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0060  phage integrase family protein  23.68 
 
 		 340 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.106477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1842  integrase family protein  23.68 
 
 		 340 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00549349  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2194  integrase family protein  24 
 
 		 317 aa  50.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  26.4 
 
 		 295 aa  51.2  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3629  integrase family protein  22.12 
 
 		 290 aa  51.2  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3661  integrase family protein  22.12 
 
 		 290 aa  51.2  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.311976  decreased coverage  0.00000149049 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0858  phage integrase  25.31 
 
 		 289 aa  50.8  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  22.49 
 
 		 311 aa  50.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  22.29 
 
 		 299 aa  50.1  0.00006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3450  tyrosine recombinase XerD  25.12 
 
 		 322 aa  50.1  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  20.91 
 
 		 296 aa  49.3  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3928  integrase family protein  22.3 
 
 		 290 aa  49.7  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2654  tyrosine recombinase XerD  25.35 
 
 		 306 aa  49.7  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0436  integrase family protein  24.07 
 
 		 323 aa  49.7  0.00009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.788545  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09860  tyrosine recombinase XerC subunit  23.89 
 
 		 329 aa  49.3  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  22.08 
 
 		 296 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1934  phage integrase family protein  20.2 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2440  tyrosine recombinase XerD  23.75 
 
 		 332 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  21.15 
 
 		 310 aa  48.5  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  23.08 
 
 		 307 aa  48.5  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  22.54 
 
 		 304 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2022  tyrosine recombinase XerD subunit  25 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  25.26 
 
 		 314 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.78 
 
 		 300 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  22.53 
 
 		 302 aa  47.8  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  22.53 
 
 		 296 aa  47.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  20.37 
 
 		 313 aa  47.8  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1215  integrase family protein  23.08 
 
 		 432 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2984  integrase family protein  23.08 
 
 		 432 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.443483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4357  integrase family protein  23.08 
 
 		 432 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.196214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4387  integrase family protein  23.08 
 
 		 432 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.864459  normal  0.927899 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0023  integrase family protein  18.91 
 
 		 291 aa  47.8  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3696  integrase domain protein SAM domain protein  23.44 
 
 		 337 aa  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.851802  normal  0.785312 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1174  tyrosine recombinase XerD  22.81 
 
 		 300 aa  47.4  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.784052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  22.53 
 
 		 302 aa  47.4  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2567  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.92 
 
 		 313 aa  47.4  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2512  tyrosine recombinase XerD  23.41 
 
 		 328 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234856 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5541  integrase family protein  20.65 
 
 		 329 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0614894 
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0066  DNA integration/recombination/invertion protein  26.79 
 
 		 326 aa  47  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1659  tyrosine recombinase XerD subunit  21.62 
 
 		 296 aa  47  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3445  integrase family protein  24.67 
 
 		 304 aa  47.4  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0577  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.5 
 
 		 305 aa  46.6  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0855221  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0989  integrase family protein  23.76 
 
 		 292 aa  47  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.12 
 
 		 299 aa  46.6  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  20.5 
 
 		 305 aa  47  0.0006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2484  phage integrase  24.15 
 
 		 304 aa  46.6  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.72317  normal  0.0269236 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0431  phage integrase  27.55 
 
 		 291 aa  46.6  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.173073 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0262  phage integrase family protein  21.48 
 
 		 326 aa  46.6  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0319  tyrosine recombinase XerD  20.94 
 
 		 307 aa  46.6  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.944891  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  22.66 
 
 		 302 aa  46.6  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0235  integrase family protein  24.38 
 
 		 289 aa  46.2  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0292  tyrosine recombinase XerD  22.19 
 
 		 305 aa  46.2  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  22.04 
 
 		 311 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10100  site-specific recombinase XerD  24.69 
 
 		 332 aa  46.2  0.0009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.08 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.08 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  21.9 
 
 		 301 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0067  integrase/recombinase  21.47 
 
 		 337 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.325485 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2172  phage integrase  23.4 
 
 		 464 aa  45.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.39744 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2860  tyrosine recombinase XerC subunit  22.49 
 
 		 300 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1366  site-specific tyrosine recombinase XerC  19.93 
 
 		 450 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000415693  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0988  tyrosine recombinase XerD  23.96 
 
 		 303 aa  45.8  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.08 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2735  tyrosine recombinase XerD  23.08 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.206607 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0903  tyrosine recombinase XerD  23.96 
 
 		 303 aa  45.8  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0120  integrase/recombinase  21.47 
 
 		 337 aa  45.8  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.400978 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  18.86 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>