More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3445 on replicon NC_012794
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012794  GWCH70_3445  integrase family protein  100 
 
 		 304 aa  632  1e-180  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3587  integrase family protein  84.87 
 
 		 304 aa  544  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  decreased coverage  0.00000000515843  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0775  phage integrase family protein  31.49 
 
 		 286 aa  132  6e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0341069  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  32.75 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  30.92 
 
 		 285 aa  126  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3102  integrase family protein  31.25 
 
 		 301 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000184896  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  31.07 
 
 		 283 aa  123  4e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  28.24 
 
 		 317 aa  123  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  30.95 
 
 		 304 aa  122  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  27.81 
 
 		 293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  29.07 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0805  tyrosine recombinase XerD  32.07 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  29.39 
 
 		 310 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2179  integrase family protein  30.65 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.353401  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  30.87 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  27.81 
 
 		 293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  31.45 
 
 		 310 aa  116  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  27.93 
 
 		 307 aa  115  6.9999999999999995e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  28.05 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2528  tyrosine recombinase XerC  27.87 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.237042 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  29.35 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  31.15 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  28.96 
 
 		 298 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  29.05 
 
 		 307 aa  112  9e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  29.51 
 
 		 302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002113  tyrosine recombinase XerC  28.33 
 
 		 310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0924  phage integrase family protein  29.81 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.852644  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  28.81 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3981  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.7 
 
 		 300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.105897  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1934  phage integrase family protein  29.68 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  28.72 
 
 		 314 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  29.67 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  30.39 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  28.39 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  29.1 
 
 		 307 aa  110  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4696  integrase family protein  29.66 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  29.64 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  28.81 
 
 		 302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  28.07 
 
 		 302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0497  tyrosine recombinase XerC  28.42 
 
 		 324 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.237269  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3108  integrase family protein  28.34 
 
 		 292 aa  109  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512092  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  29.37 
 
 		 297 aa  109  7.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0273  tyrosine recombinase XerC  29.9 
 
 		 300 aa  109  7.000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.007038  normal  0.809464 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  28.86 
 
 		 302 aa  108  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  27.93 
 
 		 294 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  29.18 
 
 		 320 aa  108  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  29.21 
 
 		 300 aa  108  8.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  29.89 
 
 		 295 aa  108  9.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  29.9 
 
 		 296 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0989  integrase family protein  29.8 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  29.45 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1762  phage/XerD family site-specific recombinase  27.8 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  27.02 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00307  site-specific tyrosine recombinase XerC  28 
 
 		 313 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  31.23 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2391  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.14 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0688  integrase family protein  28.06 
 
 		 336 aa  108  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0927  tyrosine recombinase XerD  28.76 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.67 
 
 		 299 aa  106  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.56 
 
 		 299 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4168  tyrosine recombinase XerC  26.38 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.38 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0208532 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4196  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.38 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0689633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  27.85 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4036  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.38 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00203  tyrosine recombinase  29.58 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4271  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.38 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2471  tyrosine recombinase XerC subunit  29.29 
 
 		 308 aa  104  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4330  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.38 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.27 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03687  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.39 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.446663  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  27.48 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.33 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0318  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.84 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0590  tyrosine recombinase XerD  29.89 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.33 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03636  hypothetical protein  27.39 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.487194  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.9 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5250  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.39 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4127  tyrosine recombinase XerC  28 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.442069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3697  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.18 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3971  tyrosine recombinase XerC  27.52 
 
 		 306 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.23 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.15 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.23 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0117  tyrosine recombinase XerC  28.43 
 
 		 316 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3835  tyrosine recombinase XerC  27.95 
 
 		 304 aa  103  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.955587  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2210  integrase family protein  28.57 
 
 		 295 aa  103  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241024 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2509  integrase family protein  28.71 
 
 		 380 aa  103  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.593152  normal  0.73908 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  28.33 
 
 		 313 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  28.29 
 
 		 290 aa  103  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3247  integrase/recombinase XerC  35.33 
 
 		 296 aa  103  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  27.46 
 
 		 305 aa  103  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  29.61 
 
 		 342 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.3 
 
 		 299 aa  103  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3928  integrase family protein  29.37 
 
 		 290 aa  102  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0736  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.9 
 
 		 294 aa  103  5e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  27.96 
 
 		 311 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.39 
 
 		 296 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  28.48 
 
 		 290 aa  102  6e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>