79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene pBT9727_0066 on replicon NC_006578
Organism: Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006578  pBT9727_0066  DNA integration/recombination/invertion protein  100 
 
 
326 aa  665    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0101  phage integrase family site specific recombinase  76.72 
 
 
272 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2388  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  61.94 
 
 
319 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00713056  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3810  site-specific recombinase, phage integrase family  62.42 
 
 
321 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3738  phage integrase family site specific recombinase  61.76 
 
 
321 aa  402  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.213349  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3556  phage integrase family site specific recombinase  61.76 
 
 
321 aa  403  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3455  phage integrase family protein  61.76 
 
 
321 aa  402  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3761  site-specific recombinase, phage integrase family  61.76 
 
 
321 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000305739  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3468  phage integrase family protein  61.76 
 
 
321 aa  403  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3840  phage integrase family site specific recombinase  61.76 
 
 
321 aa  403  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.297576  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3720  site-specific recombinase, phage integrase family  61.76 
 
 
321 aa  403  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98037e-26 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1495  site-specific recombinase, phage integrase family  61.76 
 
 
321 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1238  normal  0.0236312 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3476  integrase domain-containing protein  60.13 
 
 
320 aa  394  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0808383  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0033  phage integrase family protein  48.52 
 
 
318 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00155571 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0026  hypothetical protein  48.04 
 
 
315 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.455463  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0108  phage integrase family protein  47.21 
 
 
321 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0056  phage integrase family protein  47.21 
 
 
318 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0027  phage integrase domain protein SAM domain protein  34.97 
 
 
308 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.032761  normal  0.165851 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0162  DNA integration/recombination/invertion protein  33.33 
 
 
293 aa  144  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2797  tyrosine recombinase XerD  22.74 
 
 
298 aa  59.7  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  24.76 
 
 
304 aa  56.2  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1335  Integrase  20.39 
 
 
351 aa  55.5  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.128026  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0030  Integrase  20.39 
 
 
351 aa  55.5  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0264646  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0310  Integrase  20.39 
 
 
351 aa  55.5  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.004878  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1806  Integrase  20.39 
 
 
351 aa  55.5  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0548075  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2063  tyrosine recombinase XerD  19.28 
 
 
290 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1777  tyrosine recombinase XerD  19.29 
 
 
290 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  22.11 
 
 
316 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  23.29 
 
 
305 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  19.35 
 
 
295 aa  53.9  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  20 
 
 
306 aa  53.1  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3569  phage integrase family protein  21.52 
 
 
300 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121799  normal  0.0892176 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.22 
 
 
330 aa  52.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  23.89 
 
 
282 aa  52  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1820  phage integrase family protein  27.75 
 
 
283 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.111306  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0775  phage integrase family protein  25.45 
 
 
286 aa  50.1  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0341069  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.79 
 
 
328 aa  49.7  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.51 
 
 
299 aa  49.7  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1617  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.22 
 
 
330 aa  49.7  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000155402  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  21.48 
 
 
298 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  22.19 
 
 
310 aa  47.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0235  integrase domain protein SAM domain protein  26.79 
 
 
370 aa  47  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0018  site-specific tyrosine recombinase XerS  27.09 
 
 
358 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000485096  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3102  integrase family protein  21.74 
 
 
301 aa  47  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000184896  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1689  integrase family protein  22.22 
 
 
292 aa  47  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0836065  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  20 
 
 
296 aa  46.6  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0542  integrase  21.09 
 
 
330 aa  46.6  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  21.31 
 
 
332 aa  46.2  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  20.47 
 
 
308 aa  46.2  0.0008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5530  site-specific tyrosine recombinase XerS  26.11 
 
 
357 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.267916  hitchhiker  0.00142122 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  20.89 
 
 
296 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  20.89 
 
 
296 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  20.57 
 
 
296 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  20.57 
 
 
296 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  20.57 
 
 
296 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  20.57 
 
 
296 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  20.57 
 
 
296 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  22.15 
 
 
310 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  19.68 
 
 
296 aa  44.3  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2195  integrase family protein  21.49 
 
 
350 aa  44.3  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  18.98 
 
 
303 aa  43.9  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0295  phage integrase family site specific recombinase  21.52 
 
 
319 aa  43.9  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0272  phage integrase family site specific recombinase  21.52 
 
 
319 aa  43.9  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0905  phage integrase family site specific recombinase  21.52 
 
 
319 aa  43.9  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  21.07 
 
 
309 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  19.34 
 
 
299 aa  43.5  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0872  integrase family protein  22.89 
 
 
316 aa  43.5  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  21 
 
 
296 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  21 
 
 
296 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.78 
 
 
301 aa  43.5  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  21.97 
 
 
298 aa  43.1  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0196  integrase family protein  23.35 
 
 
328 aa  43.1  0.006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000565414 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  21.02 
 
 
285 aa  43.1  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  20.95 
 
 
309 aa  43.1  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  21.33 
 
 
306 aa  42.7  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  28.74 
 
 
384 aa  42.7  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6605  integrase family protein  21.97 
 
 
292 aa  42.4  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7462  integrase family protein  21.97 
 
 
292 aa  42.4  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105755  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7619  integrase family protein  21.97 
 
 
292 aa  42.4  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.192826  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>