More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5914 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5914  integrase family protein  100 
 
 		 325 aa  624  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000658468  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1990  site-specific tyrosine recombinase XerC  62.79 
 
 		 300 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  62.79 
 
 		 300 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2036  site-specific tyrosine recombinase XerC  62.79 
 
 		 300 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0541579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09860  tyrosine recombinase XerC subunit  60.06 
 
 		 329 aa  364  1e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2207  site-specific tyrosine recombinase XerC  61.13 
 
 		 319 aa  348  1e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787262  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4135  site-specific tyrosine recombinase XerC  61.2 
 
 		 300 aa  342  5e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3245  phage integrase family protein  59.42 
 
 		 312 aa  332  7.000000000000001e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676462  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12908  site-specific tyrosine recombinase XerC  61.07 
 
 		 298 aa  325  6e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000436053  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0989  integrase family protein  57.24 
 
 		 292 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1654  integrase family protein  61.13 
 
 		 298 aa  319  3e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2102  integrase family protein  58.61 
 
 		 304 aa  298  7e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167189  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2471  tyrosine recombinase XerC subunit  52.94 
 
 		 308 aa  296  5e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2210  integrase family protein  52.19 
 
 		 295 aa  292  6e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241024 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3115  integrase family protein  54.03 
 
 		 336 aa  291  8e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0082342  normal  0.151412 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3995  integrase family protein  61.97 
 
 		 311 aa  291  1e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0674  site-specific tyrosine recombinase XerC  57.43 
 
 		 303 aa  289  4e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2194  integrase family protein  52.13 
 
 		 317 aa  284  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2509  integrase family protein  52.38 
 
 		 380 aa  280  2e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.593152  normal  0.73908 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1317  phage integrase family protein  51.89 
 
 		 325 aa  276  3e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11170  site-specific recombinase XerD  49.24 
 
 		 336 aa  269  5e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0225756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  49.83 
 
 		 310 aa  260  3e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0235  integrase family protein  54.55 
 
 		 289 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1547  phage integrase family protein  49.55 
 
 		 336 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.268843 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1481  integrase family protein  53.4 
 
 		 308 aa  251  9.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.141471  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09270  tyrosine recombinase XerC subunit  49.09 
 
 		 346 aa  250  2e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.111586  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10100  site-specific recombinase XerD  49.07 
 
 		 332 aa  248  9e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1159  integrase family protein  50.99 
 
 		 344 aa  246  4e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.226555 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1208  integrase family protein  48.89 
 
 		 363 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0251  site-specific tyrosine recombinase XerC  40 
 
 		 355 aa  231  1e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00631913  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1525  integrase family protein  48.33 
 
 		 327 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206219  hitchhiker  0.00883097 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3583  phage integrase  49.85 
 
 		 385 aa  225  7e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.1 
 
 		 322 aa  221  9.999999999999999e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1001  integrase family protein  40.95 
 
 		 333 aa  219  7e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  38.36 
 
 		 294 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  42.53 
 
 		 332 aa  218  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  41.14 
 
 		 294 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  39.06 
 
 		 290 aa  211  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  39.87 
 
 		 293 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  37.63 
 
 		 307 aa  209  4e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1178  integrase family protein  50.49 
 
 		 329 aa  208  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.801835  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  36.75 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  44.55 
 
 		 311 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  40.13 
 
 		 293 aa  206  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  37.29 
 
 		 307 aa  206  5e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  42.81 
 
 		 317 aa  206  5e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  39.66 
 
 		 302 aa  205  8e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  37.46 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  36.61 
 
 		 307 aa  204  2e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.31 
 
 		 299 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1283  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.72 
 
 		 297 aa  199  5e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.31 
 
 		 299 aa  199  5e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.31 
 
 		 299 aa  199  6e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.31 
 
 		 299 aa  199  6e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  39.26 
 
 		 294 aa  199  7e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.85 
 
 		 299 aa  198  9e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.31 
 
 		 299 aa  198  9e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.31 
 
 		 299 aa  198  9e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.99 
 
 		 301 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.31 
 
 		 299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.31 
 
 		 299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0727  tyrosine recombinase XerD  37.16 
 
 		 304 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.67 
 
 		 300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0222  integrase/recombinase XerC  38.72 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  38.21 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5501  site-specific tyrosine recombinase XerC  41.08 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.69 
 
 		 296 aa  197  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.39 
 
 		 299 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.99 
 
 		 299 aa  196  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.69 
 
 		 296 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  37.67 
 
 		 295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.69 
 
 		 296 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  35.74 
 
 		 295 aa  196  6e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.12 
 
 		 299 aa  196  6e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  31.37 
 
 		 307 aa  195  7e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  40.07 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.58 
 
 		 314 aa  194  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  41.37 
 
 		 342 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  40.07 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  38.64 
 
 		 304 aa  194  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  38.02 
 
 		 317 aa  193  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.35 
 
 		 296 aa  192  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  35.33 
 
 		 306 aa  192  4e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.35 
 
 		 296 aa  192  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.69 
 
 		 296 aa  192  5e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  40.4 
 
 		 294 aa  192  5e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.69 
 
 		 296 aa  192  7e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.69 
 
 		 296 aa  192  7e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.69 
 
 		 296 aa  192  7e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.69 
 
 		 296 aa  192  7e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  40.2 
 
 		 313 aa  192  7e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  41.5 
 
 		 343 aa  192  7e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  31.79 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  37.71 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.02 
 
 		 296 aa  191  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  41.16 
 
 		 304 aa  191  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  33.45 
 
 		 300 aa  191  2e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  41.04 
 
 		 324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.87 
 
 		 298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  35.12 
 
 		 302 aa  190  2.9999999999999997e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>