More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3558 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_3558  phage integrase family protein  100 
 
 		 311 aa  644    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3884  phage integrase family site specific recombinase  64.31 
 
 		 310 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3218  phage integrase family protein  64.63 
 
 		 310 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000104017 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00295  site-specific recombinase, phage integrase family protein  52.86 
 
 		 297 aa  308  1.0000000000000001e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0730  phage integrase  48.15 
 
 		 305 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4243  phage integrase  36.45 
 
 		 309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000426285 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5582  integrase family protein  33.33 
 
 		 313 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4591  integrase family protein  30.98 
 
 		 316 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000000427706  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0012  Phage integrase  30.33 
 
 		 320 aa  142  8e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0026  Phage integrase  30.64 
 
 		 309 aa  136  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4618  integrase family protein  30.23 
 
 		 311 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4462  integrase family protein  29.9 
 
 		 311 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0645  integrase family protein  30.49 
 
 		 328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000112195  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1730  integrase family protein  30.36 
 
 		 317 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3221  integrase family protein  27.88 
 
 		 337 aa  125  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  hitchhiker  0.000000474252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4067  integrase/recombinase  28.72 
 
 		 324 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.130649  normal  0.280594 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0180  phage integrase  27.57 
 
 		 336 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0996549 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0027  integrase/recombinase  29.18 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000824478  normal  0.490771 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4229  phage integrase family protein  29.57 
 
 		 329 aa  102  8e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  27.7 
 
 		 313 aa  100  4e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2389  integrase family protein  27.03 
 
 		 345 aa  94.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000168042  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2794  integrase family protein  25.33 
 
 		 304 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.160655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  26.57 
 
 		 307 aa  92.4  9e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2840  Phage integrase  29.9 
 
 		 296 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2848  phage integrase family protein  25 
 
 		 304 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2966  site-specific recombinase, phage integrase family  26.57 
 
 		 321 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121059  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2840  integrase family protein  27.36 
 
 		 322 aa  84.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0238888  normal  0.278729 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2841  phage integrase family site specific recombinase  30.41 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.424466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0262  integrase family protein  35.62 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2751  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  26.57 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.74292  normal  0.0246266 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2939  integrase family protein  30.41 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  35.26 
 
 		 284 aa  82.8  0.000000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5230  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.92 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1900  phage integrase family protein  25.17 
 
 		 331 aa  82.4  0.000000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.125862  hitchhiker  0.00365877 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1412  integrase family protein  28.34 
 
 		 323 aa  82.4  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5139  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.92 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1611  tyrosine recombinase  35.06 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3470  phage integrase family protein  34.03 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.229271  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4806  phage integrase  33.33 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5291  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.15 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  37.5 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1934  phage integrase family protein  24.2 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0068  phage integrase  31.96 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0242  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.15 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.322874  normal  0.826572 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3115  phage integrase  27.3 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  27.51 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3580  tyrosine recombinase XerC  32.79 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  24.29 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4502  integrase family protein  35.92 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  28.88 
 
 		 310 aa  79  0.00000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1902  phage integrase  37.58 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.8 
 
 		 299 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0861  integrase/recombinase XerC  27.54 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  28.85 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0394  tyrosine recombinase XerC  31.15 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3631  tyrosine recombinase XerC  31.15 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0393  tyrosine recombinase XerC  31.15 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3102  integrase family protein  24.31 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000184896  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0222  integrase/recombinase XerC  30.31 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0015  Phage integrase  34.93 
 
 		 310 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.230922  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0687  Phage integrase  34.25 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.004827  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1821  integrase family protein  26.67 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0364742  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5643  tyrosine recombinase XerD  33.51 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.776137 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0318  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.81 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0858  phage integrase  33.51 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  29.44 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4114  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.45 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  34.29 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1196  phage integrase  33.33 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47730  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.42 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0435757  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0822  putative phage integrase  32.3 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.341397 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0039  tyrosine recombinase XerD  27.48 
 
 		 312 aa  75.9  0.0000000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.92 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.92 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.92 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  33.11 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.92 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  36.14 
 
 		 319 aa  75.5  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6657  integrase family protein  32.1 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.358251 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1077  integrase family protein  32.1 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  31.36 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69710  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.17 
 
 		 303 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.737312  normal  0.478185 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3749  phage integrase family protein  29.5 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00852374  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0626  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.58 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.92 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.92 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.74 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0949  phage integrase family protein  24.9 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.427827  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.92 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0140  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  74.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00070  putative site-specific recombinase  28.38 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0942  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.14 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  32.39 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00203  tyrosine recombinase  35.26 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  32.07 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  29.85 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6023  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.17 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.92 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.92 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  24.82 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>