More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4387 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2984  integrase family protein  100 
 
 		 432 aa  887    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.443483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4387  integrase family protein  100 
 
 		 432 aa  887    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.864459  normal  0.927899 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4357  integrase family protein  100 
 
 		 432 aa  887    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.196214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1215  integrase family protein  100 
 
 		 432 aa  887    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1239  phage integrase  30.83 
 
 		 419 aa  170  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.183742 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4899  integrase family protein  31.74 
 
 		 419 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0372  integrase family protein  32 
 
 		 411 aa  155  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6461  phage integrase family protein  29.93 
 
 		 412 aa  155  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624578 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8262  integrase/recombinase  36.43 
 
 		 325 aa  154  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19921  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7595  integrase family protein  33.78 
 
 		 413 aa  154  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0423  integrase family protein  31.67 
 
 		 304 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5939  phage integrase family protein  32.09 
 
 		 395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0777  integrase family protein  28.71 
 
 		 425 aa  147  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000241017 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7460  integrase family protein  29.59 
 
 		 418 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8253  phage integrase family protein  33.16 
 
 		 409 aa  145  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.564196  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0326  integrase family protein  34.52 
 
 		 414 aa  144  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.061717 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0835  site-specific recombinase, phage integrase family  34.52 
 
 		 414 aa  144  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.916453  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0507  site-specific recombinase, phage integrase family  34.52 
 
 		 414 aa  144  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2397  site-specific recombinase, phage integrase family  34.52 
 
 		 414 aa  144  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8114  integrase/recombinase  30.89 
 
 		 408 aa  144  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200175  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0669  integrase family protein  34.52 
 
 		 414 aa  144  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4018  phage integrase family protein  33.63 
 
 		 409 aa  138  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0770  integrase family protein  29.95 
 
 		 417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000130395 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3698  integrase family protein  30 
 
 		 508 aa  130  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4004  integrase family protein  30 
 
 		 508 aa  130  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0711  phage integrase  29.86 
 
 		 414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.209263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2230  integrase family protein  27.1 
 
 		 403 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3507  phage integrase family protein  32.46 
 
 		 403 aa  125  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.646395  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5350  integrase family protein  27.1 
 
 		 403 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.467969 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2006  integrase family protein  27.1 
 
 		 403 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3264  phage integrase family protein  29.26 
 
 		 403 aa  124  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.860131  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6953  integrase family protein  26.69 
 
 		 405 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7622  integrase family protein  26.35 
 
 		 405 aa  122  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.530017 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0602  phage integrase family protein  34.86 
 
 		 412 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1271  phage integrase  30.58 
 
 		 410 aa  113  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.896321  normal  0.0119714 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0243  integrase family protein  28.57 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5406  phage integrase family protein  30.33 
 
 		 381 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.197458 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0438  phage integrase  27.78 
 
 		 515 aa  105  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9020  integrase/recombinase  36.75 
 
 		 255 aa  104  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2279  integrase family protein  26.88 
 
 		 394 aa  104  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0687446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  30.58 
 
 		 332 aa  99.8  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  28.99 
 
 		 298 aa  97.8  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  28.37 
 
 		 309 aa  95.1  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  30.24 
 
 		 295 aa  95.1  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2214  integrase domain protein SAM domain protein  25.6 
 
 		 417 aa  93.6  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000184093 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  30.57 
 
 		 311 aa  93.2  8e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  27.21 
 
 		 295 aa  92.4  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0740  putative integrase  32.9 
 
 		 171 aa  91.3  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.650968  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  29 
 
 		 294 aa  90.5  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  30.21 
 
 		 304 aa  90.1  7e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3692  integrase family protein  32.92 
 
 		 412 aa  89.7  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  25.53 
 
 		 296 aa  89.4  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  29.35 
 
 		 294 aa  87.8  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  24.12 
 
 		 299 aa  87.4  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1299  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.09 
 
 		 291 aa  87  6e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1488  tyrosine recombinase XerD  32.44 
 
 		 304 aa  87  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2809  phage integrase family protein  29.28 
 
 		 311 aa  86.3  9e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  27.15 
 
 		 293 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2797  tyrosine recombinase XerD  27.46 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  26.01 
 
 		 313 aa  85.1  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1436  integrase family protein  24.75 
 
 		 641 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  26.33 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  27.59 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  27.52 
 
 		 309 aa  82.4  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  23.65 
 
 		 301 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  27.15 
 
 		 301 aa  82.8  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  26.5 
 
 		 300 aa  82.4  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0222  integrase/recombinase XerC  28.81 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2243  integrase family protein  22.95 
 
 		 634 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00308356 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0139  tyrosine recombinase XerD  27.98 
 
 		 312 aa  82  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  26.8 
 
 		 296 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1995  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.83 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  26.12 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  29.55 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0772  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.43 
 
 		 324 aa  80.9  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1659  tyrosine recombinase XerD subunit  30 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02665  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.84 
 
 		 336 aa  80.9  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0684  site-specific tyrosine recombinase XerD  30 
 
 		 324 aa  80.5  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.631001  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0890  tyrosine recombinase XerD  30.4 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.267893  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.11 
 
 		 313 aa  79.7  0.00000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3643  tyrosine recombinase XerD  27.65 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4009  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.45 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.45 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.279091  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0543  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.45 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.91 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.182372  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  30.26 
 
 		 301 aa  79.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  27.61 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.47 
 
 		 299 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  26.91 
 
 		 295 aa  79  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  25.61 
 
 		 300 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0927  tyrosine recombinase XerD  26.32 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0950  integrase/recombinase XerD  26.35 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0590  tyrosine recombinase XerD  28.06 
 
 		 306 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3524  tyrosine recombinase XerD  28.53 
 
 		 309 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  25.68 
 
 		 309 aa  79  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1906  integrase family protein  27.57 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.713326  normal  0.217947 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  25.83 
 
 		 305 aa  79  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0242  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.81 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.322874  normal  0.826572 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2544  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.69 
 
 		 308 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0843  tyrosine recombinase XerD  30.3 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>