More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3692 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3692  integrase family protein  100 
 
 		 412 aa  850    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1436  integrase family protein  32.29 
 
 		 641 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2243  integrase family protein  27.74 
 
 		 634 aa  124  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00308356 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0740  putative integrase  38.04 
 
 		 171 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.650968  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8262  integrase/recombinase  33.33 
 
 		 325 aa  100  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19921  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8253  phage integrase family protein  37.93 
 
 		 409 aa  98.6  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.564196  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0423  integrase family protein  29.21 
 
 		 304 aa  92  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0243  integrase family protein  33.16 
 
 		 408 aa  92  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4357  integrase family protein  32.92 
 
 		 432 aa  90.1  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.196214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4387  integrase family protein  32.92 
 
 		 432 aa  90.1  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.864459  normal  0.927899 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2984  integrase family protein  32.92 
 
 		 432 aa  90.1  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.443483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1215  integrase family protein  32.92 
 
 		 432 aa  90.1  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1333  Integrase  24.92 
 
 		 400 aa  88.2  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.455073  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2214  integrase domain protein SAM domain protein  30.39 
 
 		 417 aa  87.8  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000184093 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0032  Integrase  24.92 
 
 		 400 aa  86.7  7e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.857579  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0312  Integrase  24.92 
 
 		 400 aa  86.7  7e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0150741  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1804  Integrase  24.92 
 
 		 400 aa  86.7  7e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.222465  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0326  integrase family protein  32.34 
 
 		 414 aa  85.1  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.061717 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0507  site-specific recombinase, phage integrase family  32.34 
 
 		 414 aa  85.1  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2397  site-specific recombinase, phage integrase family  32.34 
 
 		 414 aa  85.1  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0835  site-specific recombinase, phage integrase family  32.34 
 
 		 414 aa  85.1  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.916453  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0669  integrase family protein  32.34 
 
 		 414 aa  85.1  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6953  integrase family protein  33.14 
 
 		 405 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0711  phage integrase  30.41 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.209263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7622  integrase family protein  32.18 
 
 		 405 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.530017 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7595  integrase family protein  30.41 
 
 		 413 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1239  phage integrase  30.12 
 
 		 419 aa  78.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.183742 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0777  integrase family protein  27.5 
 
 		 425 aa  77.8  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000241017 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6461  phage integrase family protein  26.67 
 
 		 412 aa  77  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624578 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4899  integrase family protein  28.16 
 
 		 419 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0438  phage integrase  31.35 
 
 		 515 aa  75.1  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2147  phage integrase family protein  30.54 
 
 		 367 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2230  integrase family protein  28.65 
 
 		 403 aa  72  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5350  integrase family protein  28.65 
 
 		 403 aa  72  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.467969 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2006  integrase family protein  28.65 
 
 		 403 aa  72  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3507  phage integrase family protein  29.81 
 
 		 403 aa  70.5  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.646395  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8114  integrase/recombinase  31.71 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200175  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05531  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.78 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5939  phage integrase family protein  29.34 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7460  integrase family protein  24.78 
 
 		 418 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3108  integrase family protein  26.9 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512092  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3264  phage integrase family protein  29.01 
 
 		 403 aa  68.9  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.860131  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1113  phage integrase family protein  29.29 
 
 		 364 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0671879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  27.78 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0770  integrase family protein  31.82 
 
 		 417 aa  66.6  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000130395 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1519  integrase family protein  22.82 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959361  decreased coverage  3.1361700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0372  integrase family protein  30.34 
 
 		 411 aa  66.6  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4004  integrase family protein  27.99 
 
 		 508 aa  65.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  28.42 
 
 		 294 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3698  integrase family protein  27.99 
 
 		 508 aa  65.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0600  phage integrase family protein  29.52 
 
 		 329 aa  65.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0489  tyrosine recombinase XerC  29.12 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  26.2 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2992  tyrosine recombinase XerD  29.76 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3619  phage integrase family protein  29.31 
 
 		 309 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.215155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4018  phage integrase family protein  28.44 
 
 		 409 aa  62.8  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4127  tyrosine recombinase XerC  28.74 
 
 		 301 aa  62  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.442069 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0306  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.86 
 
 		 366 aa  62  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.9 
 
 		 317 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.86 
 
 		 366 aa  62  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1918  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.14 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.250204  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1924  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.14 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0242507  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  29.23 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  25.29 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2670  integrase family protein  32.89 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2585  integrase family protein  32.89 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  28.43 
 
 		 381 aa  61.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4728  integrase family protein  32.89 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1271  phage integrase  27.86 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.896321  normal  0.0119714 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4645  phage integrase family protein  27.54 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  26.2 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  26.12 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  28.06 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1439  integrase family protein  24.71 
 
 		 317 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.110569  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  26.63 
 
 		 295 aa  58.9  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  24.43 
 
 		 300 aa  59.3  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.34 
 
 		 314 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2194  integrase family protein  26.98 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1846  integrase family protein  30.61 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000018136  normal  0.604263 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  29.07 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  27.32 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  25.14 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  25.24 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0738  integrase/recombinase  29.41 
 
 		 340 aa  58.9  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5406  phage integrase family protein  30.52 
 
 		 381 aa  58.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.197458 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  25.91 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3247  integrase/recombinase XerC  28.8 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  29.65 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.9 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  30.86 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  28.74 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  25.32 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.34 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0325  tyrosine recombinase XerC  26.63 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3098  integrase family protein  25.3 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9020  integrase/recombinase  35.96 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  26.6 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  29.52 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0602  phage integrase family protein  25.84 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0978  phage integrase family protein  29.8 
 
 		 283 aa  57  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>