More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2243 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2243  integrase family protein  100 
 
 		 634 aa  1316    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00308356 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1436  integrase family protein  39.22 
 
 		 641 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3692  integrase family protein  27.74 
 
 		 412 aa  124  6e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8262  integrase/recombinase  28.08 
 
 		 325 aa  117  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19921  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2214  integrase domain protein SAM domain protein  29.35 
 
 		 417 aa  101  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000184093 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8253  phage integrase family protein  30.94 
 
 		 409 aa  99.4  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.564196  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7460  integrase family protein  30.73 
 
 		 418 aa  94  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0770  integrase family protein  27.02 
 
 		 417 aa  88.2  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000130395 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8114  integrase/recombinase  25.28 
 
 		 408 aa  87.4  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200175  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4899  integrase family protein  29.45 
 
 		 419 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0312  Integrase  30.36 
 
 		 400 aa  86.3  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0150741  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1333  Integrase  30.36 
 
 		 400 aa  86.3  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.455073  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0243  integrase family protein  26.91 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1804  Integrase  30.36 
 
 		 400 aa  86.3  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.222465  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0032  Integrase  30.36 
 
 		 400 aa  86.3  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.857579  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0423  integrase family protein  25.11 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3264  phage integrase family protein  24.49 
 
 		 403 aa  84.7  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.860131  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3507  phage integrase family protein  27.8 
 
 		 403 aa  84  0.000000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.646395  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5939  phage integrase family protein  27.76 
 
 		 395 aa  83.6  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6461  phage integrase family protein  25.71 
 
 		 412 aa  83.2  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624578 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2006  integrase family protein  24.84 
 
 		 403 aa  81.6  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2230  integrase family protein  24.84 
 
 		 403 aa  81.6  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5350  integrase family protein  24.84 
 
 		 403 aa  81.6  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.467969 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0740  putative integrase  28.1 
 
 		 171 aa  81.3  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.650968  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0777  integrase family protein  24.9 
 
 		 425 aa  80.9  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000241017 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0372  integrase family protein  32.19 
 
 		 411 aa  80.9  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4357  integrase family protein  27.61 
 
 		 432 aa  79  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.196214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7622  integrase family protein  24.01 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.530017 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2984  integrase family protein  27.61 
 
 		 432 aa  79  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.443483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4387  integrase family protein  27.61 
 
 		 432 aa  79  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.864459  normal  0.927899 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1215  integrase family protein  27.61 
 
 		 432 aa  79  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6953  integrase family protein  24.47 
 
 		 405 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0711  phage integrase  27.17 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.209263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0438  phage integrase  23.59 
 
 		 515 aa  72  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0326  integrase family protein  26.51 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.061717 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2397  site-specific recombinase, phage integrase family  26.51 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0669  integrase family protein  26.51 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0835  site-specific recombinase, phage integrase family  26.51 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.916453  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0507  site-specific recombinase, phage integrase family  26.51 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7595  integrase family protein  24.24 
 
 		 413 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9020  integrase/recombinase  24.69 
 
 		 255 aa  70.1  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.44 
 
 		 299 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  24.91 
 
 		 295 aa  70.1  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.44 
 
 		 299 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3698  integrase family protein  29.17 
 
 		 508 aa  70.1  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4004  integrase family protein  29.17 
 
 		 508 aa  70.1  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  27.44 
 
 		 343 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  24.63 
 
 		 307 aa  69.3  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.78 
 
 		 311 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.08 
 
 		 299 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.08 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.08 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  27.44 
 
 		 343 aa  68.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0562  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.29 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  23.43 
 
 		 295 aa  67  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  26.98 
 
 		 342 aa  67  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.71 
 
 		 299 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.71 
 
 		 299 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  24.91 
 
 		 297 aa  66.2  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5406  phage integrase family protein  24.71 
 
 		 381 aa  66.2  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.197458 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.71 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  22.22 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.25 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  26.23 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.19 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0861  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.11 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1299  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.69 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.19 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02726  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.44 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0798  tyrosine recombinase XerD  27.44 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.966972  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  24.82 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0815  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.44 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.624778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4185  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.44 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3314  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.44 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3027  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.44 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02689  hypothetical protein  27.44 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.364794  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3220  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.44 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.44 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0674  site-specific tyrosine recombinase XerC  25 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3380  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.44 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3278  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.44 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3053  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.44 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3200  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.44 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1906  integrase family protein  24.72 
 
 		 295 aa  63.2  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.713326  normal  0.217947 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0431  phage integrase  23.6 
 
 		 291 aa  63.2  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.173073 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3275  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.44 
 
 		 298 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0645  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.11 
 
 		 299 aa  62.8  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.241995  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4018  phage integrase family protein  27.71 
 
 		 409 aa  62.4  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0688  integrase family protein  22.64 
 
 		 336 aa  62  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1239  phage integrase  25.95 
 
 		 419 aa  62  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.183742 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  23.13 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646575 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2544  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.18 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0920  site-specific tyrosine recombinase XerD  25 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3847  site-specific tyrosine recombinase XerD  25 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.349121 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0879  site-specific tyrosine recombinase XerD  25 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.201006  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  22.71 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  24.73 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  28.05 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0519  site-specific tyrosine recombinase XerD  21.55 
 
 		 302 aa  60.1  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0998774  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  21.53 
 
 		 318 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>