More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7622 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6953  integrase family protein  94.81 
 
 		 405 aa  774    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7622  integrase family protein  100 
 
 		 405 aa  822    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.530017 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3480  integrase/recombinase  92.04 
 
 		 130 aa  216  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.092761 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0669  integrase family protein  34.34 
 
 		 414 aa  140  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0507  site-specific recombinase, phage integrase family  34.34 
 
 		 414 aa  140  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0835  site-specific recombinase, phage integrase family  34.34 
 
 		 414 aa  140  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.916453  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0326  integrase family protein  34.34 
 
 		 414 aa  140  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.061717 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2397  site-specific recombinase, phage integrase family  34.34 
 
 		 414 aa  140  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1239  phage integrase  30.72 
 
 		 419 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.183742 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8253  phage integrase family protein  34.56 
 
 		 409 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.564196  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7595  integrase family protein  31.65 
 
 		 413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4018  phage integrase family protein  34.38 
 
 		 409 aa  127  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7460  integrase family protein  32.28 
 
 		 418 aa  124  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8262  integrase/recombinase  30.58 
 
 		 325 aa  124  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19921  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0243  integrase family protein  32.07 
 
 		 408 aa  121  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0711  phage integrase  30.07 
 
 		 414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.209263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6461  phage integrase family protein  28.71 
 
 		 412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624578 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1215  integrase family protein  26.35 
 
 		 432 aa  110  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2984  integrase family protein  26.35 
 
 		 432 aa  110  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.443483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4357  integrase family protein  26.35 
 
 		 432 aa  110  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.196214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4387  integrase family protein  26.35 
 
 		 432 aa  110  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.864459  normal  0.927899 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0777  integrase family protein  30.33 
 
 		 425 aa  109  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000241017 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3507  phage integrase family protein  36.21 
 
 		 403 aa  108  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.646395  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5350  integrase family protein  35.93 
 
 		 403 aa  106  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.467969 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8114  integrase/recombinase  27.97 
 
 		 408 aa  106  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200175  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2230  integrase family protein  35.93 
 
 		 403 aa  106  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2006  integrase family protein  35.93 
 
 		 403 aa  106  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5939  phage integrase family protein  30.35 
 
 		 395 aa  104  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3264  phage integrase family protein  34.76 
 
 		 403 aa  104  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.860131  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0770  integrase family protein  34.08 
 
 		 417 aa  100  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000130395 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0423  integrase family protein  30.84 
 
 		 304 aa  96.3  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1271  phage integrase  29.49 
 
 		 410 aa  95.1  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.896321  normal  0.0119714 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0372  integrase family protein  29.28 
 
 		 411 aa  93.2  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0740  putative integrase  27.54 
 
 		 171 aa  92  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.650968  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  25.85 
 
 		 305 aa  87.8  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2026  integrase domain protein SAM domain protein  32.6 
 
 		 297 aa  87.4  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1906  integrase family protein  26.53 
 
 		 295 aa  87.4  4e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.713326  normal  0.217947 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1915  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.74 
 
 		 345 aa  87.4  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279776  hitchhiker  0.00138491 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  25.78 
 
 		 298 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  30.42 
 
 		 304 aa  85.9  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  30.28 
 
 		 298 aa  82.4  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  27.89 
 
 		 294 aa  82.8  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3692  integrase family protein  32.18 
 
 		 412 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1450  integrase family protein  27.18 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  normal  0.734684 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4899  integrase family protein  27.87 
 
 		 419 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  27.62 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  27.51 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  26.24 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0083  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.94 
 
 		 322 aa  80.5  0.00000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0540  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.63 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0147694  normal  0.75101 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0602  phage integrase family protein  25.26 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  26.09 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  26.52 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  28.87 
 
 		 314 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  26.71 
 
 		 298 aa  79.3  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  25.17 
 
 		 296 aa  79.3  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  26.09 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  26.03 
 
 		 277 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2243  integrase family protein  24.01 
 
 		 634 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00308356 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  28.04 
 
 		 309 aa  79  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  23.67 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  26.71 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2567  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.76 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  26.21 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  25.4 
 
 		 303 aa  77.4  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0177  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.77 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0401  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.48 
 
 		 324 aa  77.4  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.145415 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  24.41 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1924  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.48 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0242507  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1918  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.48 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.250204  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02665  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.22 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0438  phage integrase  27.99 
 
 		 515 aa  77.4  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  26.16 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0180  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.1 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0306  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.48 
 
 		 366 aa  76.6  0.0000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5406  phage integrase family protein  31 
 
 		 381 aa  76.6  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.197458 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.48 
 
 		 366 aa  76.6  0.0000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  24.81 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  28.52 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6437  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.01 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.798094 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0753  tyrosine recombinase XerD subunit  25.65 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000038176  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  27.71 
 
 		 301 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2809  phage integrase family protein  29.87 
 
 		 311 aa  75.9  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  29.81 
 
 		 311 aa  75.9  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1555  tyrosine recombinase XerD  25.79 
 
 		 290 aa  75.9  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  25.44 
 
 		 295 aa  76.3  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  29.46 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  24.83 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  29.45 
 
 		 324 aa  75.1  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0163  integrase family protein  32.95 
 
 		 342 aa  75.1  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.70922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  25.8 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  26.77 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.57 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.62 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3124  integrase family protein  28.84 
 
 		 323 aa  74.3  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  25.49 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0553  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.29 
 
 		 329 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172687  normal  0.167276 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1659  tyrosine recombinase XerD subunit  27.63 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  28.28 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0476  tyrosine recombinase XerD  24.75 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>