More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_4018 on replicon NC_008739
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008739  Maqu_4018  phage integrase family protein  100 
 
 		 409 aa  832    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0711  phage integrase  33.22 
 
 		 414 aa  157  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.209263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8253  phage integrase family protein  34.15 
 
 		 409 aa  150  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.564196  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0243  integrase family protein  34.73 
 
 		 408 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7595  integrase family protein  34.27 
 
 		 413 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6953  integrase family protein  35.76 
 
 		 405 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0507  site-specific recombinase, phage integrase family  32.51 
 
 		 414 aa  145  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0835  site-specific recombinase, phage integrase family  32.51 
 
 		 414 aa  145  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.916453  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0326  integrase family protein  32.51 
 
 		 414 aa  145  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.061717 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0669  integrase family protein  32.51 
 
 		 414 aa  145  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2397  site-specific recombinase, phage integrase family  32.51 
 
 		 414 aa  145  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1215  integrase family protein  32.43 
 
 		 432 aa  139  7e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4357  integrase family protein  32.43 
 
 		 432 aa  139  7e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.196214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4387  integrase family protein  32.43 
 
 		 432 aa  139  7e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.864459  normal  0.927899 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2984  integrase family protein  32.43 
 
 		 432 aa  139  7e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.443483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7622  integrase family protein  34.38 
 
 		 405 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.530017 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6461  phage integrase family protein  33.02 
 
 		 412 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624578 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8262  integrase/recombinase  35.98 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19921  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1239  phage integrase  28.94 
 
 		 419 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.183742 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0372  integrase family protein  34.5 
 
 		 411 aa  124  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4899  integrase family protein  29.85 
 
 		 419 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7460  integrase family protein  30.73 
 
 		 418 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5350  integrase family protein  32.66 
 
 		 403 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.467969 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2230  integrase family protein  32.66 
 
 		 403 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2006  integrase family protein  32.66 
 
 		 403 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3264  phage integrase family protein  32.77 
 
 		 403 aa  116  6.9999999999999995e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.860131  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0423  integrase family protein  30.82 
 
 		 304 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3507  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 403 aa  114  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.646395  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  29.79 
 
 		 294 aa  107  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5939  phage integrase family protein  33.47 
 
 		 395 aa  106  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0602  phage integrase family protein  29.9 
 
 		 412 aa  106  8e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3698  integrase family protein  28 
 
 		 508 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4004  integrase family protein  28 
 
 		 508 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0777  integrase family protein  28.43 
 
 		 425 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000241017 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1271  phage integrase  33.45 
 
 		 410 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.896321  normal  0.0119714 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8114  integrase/recombinase  28.93 
 
 		 408 aa  99.4  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200175  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5406  phage integrase family protein  29.79 
 
 		 381 aa  99  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.197458 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2214  integrase domain protein SAM domain protein  22.02 
 
 		 417 aa  97.8  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000184093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  29.84 
 
 		 306 aa  97.4  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  29.37 
 
 		 295 aa  96.7  7e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9020  integrase/recombinase  36.53 
 
 		 255 aa  95.5  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2279  integrase family protein  29.89 
 
 		 394 aa  91.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0687446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0740  putative integrase  30.43 
 
 		 171 aa  91.7  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.650968  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2026  integrase domain protein SAM domain protein  31.52 
 
 		 297 aa  89.7  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0438  phage integrase  28.95 
 
 		 515 aa  89  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  29.73 
 
 		 301 aa  89.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  27.89 
 
 		 302 aa  85.9  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0950  integrase/recombinase XerD  25.84 
 
 		 300 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.62 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.8 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.62 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.62 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.62 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.62 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.12 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.62 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.62 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  28.28 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0861  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.96 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1023  integrase family protein  27.72 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0854512  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.28 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1436  integrase family protein  29.09 
 
 		 641 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3643  tyrosine recombinase XerD  25.48 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.23 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.23 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3524  tyrosine recombinase XerD  25.48 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.94 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3300  tyrosine recombinase XerD  26 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3892  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.28 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3245  phage integrase family protein  29.73 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676462  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0890  tyrosine recombinase XerD  26.51 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.267893  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  27.24 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0770  integrase family protein  29.2 
 
 		 417 aa  80.5  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000130395 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  28.48 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.21 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3278  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.21 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3380  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.21 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3200  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.21 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1906  integrase family protein  28.24 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.713326  normal  0.217947 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3331  tyrosine recombinase XerD  25.93 
 
 		 300 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3275  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.21 
 
 		 298 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  28.24 
 
 		 302 aa  79  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  26.1 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.03 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0795  tyrosine recombinase XerD  25.93 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  29.1 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3449  tyrosine recombinase XerD  25.17 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0312  Integrase  32.65 
 
 		 400 aa  77.8  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0150741  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3228  tyrosine recombinase XerD  25.59 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.302685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1804  Integrase  32.65 
 
 		 400 aa  77.8  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.222465  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0032  Integrase  32.65 
 
 		 400 aa  77.8  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.857579  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  29.39 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0843  tyrosine recombinase XerD  25.16 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0645  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.62 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.241995  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.5 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004441  site-specific recombinase XerD  26.44 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4151  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.21 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1333  Integrase  32.65 
 
 		 400 aa  77.4  0.0000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.455073  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  29.08 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  25.42 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>