More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0711 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0711  phage integrase  100 
 
 		 414 aa  837    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.209263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0326  integrase family protein  47.36 
 
 		 414 aa  363  2e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.061717 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0835  site-specific recombinase, phage integrase family  47.36 
 
 		 414 aa  363  2e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.916453  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0507  site-specific recombinase, phage integrase family  47.36 
 
 		 414 aa  363  2e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2397  site-specific recombinase, phage integrase family  47.36 
 
 		 414 aa  363  2e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0669  integrase family protein  47.36 
 
 		 414 aa  363  2e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7595  integrase family protein  40.68 
 
 		 413 aa  300  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2026  integrase domain protein SAM domain protein  43.39 
 
 		 297 aa  222  8e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8253  phage integrase family protein  32.16 
 
 		 409 aa  154  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.564196  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1239  phage integrase  32.32 
 
 		 419 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.183742 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4018  phage integrase family protein  33.22 
 
 		 409 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6461  phage integrase family protein  29.7 
 
 		 412 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624578 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0423  integrase family protein  33.68 
 
 		 304 aa  136  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5350  integrase family protein  33.63 
 
 		 403 aa  132  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.467969 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2230  integrase family protein  33.63 
 
 		 403 aa  132  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2006  integrase family protein  33.63 
 
 		 403 aa  132  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3264  phage integrase family protein  31.73 
 
 		 403 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.860131  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8114  integrase/recombinase  32.04 
 
 		 408 aa  127  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200175  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0243  integrase family protein  31.43 
 
 		 408 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3507  phage integrase family protein  34.14 
 
 		 403 aa  123  6e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.646395  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1215  integrase family protein  27.81 
 
 		 432 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2984  integrase family protein  27.81 
 
 		 432 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.443483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4357  integrase family protein  27.81 
 
 		 432 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.196214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4387  integrase family protein  27.81 
 
 		 432 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.864459  normal  0.927899 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0372  integrase family protein  32.39 
 
 		 411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6953  integrase family protein  31.08 
 
 		 405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7622  integrase family protein  30.07 
 
 		 405 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.530017 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5939  phage integrase family protein  34.4 
 
 		 395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0438  phage integrase  32.23 
 
 		 515 aa  109  8.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4004  integrase family protein  31.89 
 
 		 508 aa  106  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3698  integrase family protein  31.89 
 
 		 508 aa  106  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8262  integrase/recombinase  30.51 
 
 		 325 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19921  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4899  integrase family protein  28.37 
 
 		 419 aa  103  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5406  phage integrase family protein  30.91 
 
 		 381 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.197458 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  27.34 
 
 		 291 aa  101  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  31.08 
 
 		 332 aa  100  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7460  integrase family protein  28.19 
 
 		 418 aa  100  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  29.9 
 
 		 317 aa  99.8  7e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0602  phage integrase family protein  29.93 
 
 		 412 aa  99.8  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0770  integrase family protein  27.97 
 
 		 417 aa  99  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000130395 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1271  phage integrase  37.9 
 
 		 410 aa  99.4  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.896321  normal  0.0119714 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1023  integrase family protein  29.93 
 
 		 297 aa  98.6  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0854512  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  26.76 
 
 		 302 aa  97.8  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  29.39 
 
 		 302 aa  97.1  6e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  29.08 
 
 		 296 aa  96.7  7e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  28.2 
 
 		 320 aa  95.5  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  26.44 
 
 		 296 aa  96.3  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0740  putative integrase  30.07 
 
 		 171 aa  95.9  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.650968  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0010  tyrosine recombinase XerC  29.05 
 
 		 299 aa  95.1  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.37 
 
 		 299 aa  94.7  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  25.52 
 
 		 295 aa  94.7  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  30.1 
 
 		 294 aa  94.7  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0777  integrase family protein  29.43 
 
 		 425 aa  94  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000241017 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  30.56 
 
 		 311 aa  94  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1488  tyrosine recombinase XerD  31.07 
 
 		 304 aa  93.6  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.37 
 
 		 301 aa  93.6  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  30 
 
 		 306 aa  93.6  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.78 
 
 		 300 aa  93.2  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2279  integrase family protein  32.31 
 
 		 394 aa  93.2  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0687446  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.03 
 
 		 299 aa  92  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  27.68 
 
 		 303 aa  92.8  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.03 
 
 		 299 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  28.37 
 
 		 308 aa  92.4  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.03 
 
 		 299 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.03 
 
 		 299 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0747  tyrosine recombinase XerD  28.62 
 
 		 303 aa  92  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000635712  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3245  phage integrase family protein  29.33 
 
 		 312 aa  91.7  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676462  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.03 
 
 		 299 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.03 
 
 		 299 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.68 
 
 		 299 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2127  tyrosine recombinase XerD  30.1 
 
 		 308 aa  91.3  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0950  integrase/recombinase XerD  28.62 
 
 		 300 aa  90.9  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.03 
 
 		 299 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0540  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.07 
 
 		 325 aa  90.9  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0147694  normal  0.75101 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  25 
 
 		 299 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0795  tyrosine recombinase XerD  29.12 
 
 		 300 aa  90.1  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0674  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.2 
 
 		 303 aa  90.1  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3331  tyrosine recombinase XerD  29.12 
 
 		 300 aa  90.1  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3304  tyrosine recombinase XerD  27.66 
 
 		 298 aa  90.1  7e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133185  normal  0.394454 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3228  tyrosine recombinase XerD  28.77 
 
 		 300 aa  89.7  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.302685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  27.7 
 
 		 304 aa  89.7  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  28.77 
 
 		 306 aa  89.4  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  29.76 
 
 		 294 aa  89  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1299  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.1 
 
 		 291 aa  89.4  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  28.14 
 
 		 295 aa  89.4  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  26.51 
 
 		 296 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  29.53 
 
 		 309 aa  89  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.98 
 
 		 298 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  26.35 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3300  tyrosine recombinase XerD  27.18 
 
 		 299 aa  88.2  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0663  tyrosine recombinase XerD  28.52 
 
 		 305 aa  89  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16040  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.83 
 
 		 298 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1659  tyrosine recombinase XerD  31.95 
 
 		 254 aa  89  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  26.35 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  24.21 
 
 		 300 aa  87.8  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  29.54 
 
 		 295 aa  88.2  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  26.35 
 
 		 307 aa  87.8  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2739  integrase/recombinase XerD  28.04 
 
 		 321 aa  87.8  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1073  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.15 
 
 		 298 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  27.49 
 
 		 303 aa  87.8  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>