More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7595 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010627  Bphy_7595  integrase family protein  100 
 
 		 413 aa  840    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0711  phage integrase  40.68 
 
 		 414 aa  298  9e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.209263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0669  integrase family protein  38.42 
 
 		 414 aa  297  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0507  site-specific recombinase, phage integrase family  38.42 
 
 		 414 aa  297  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0326  integrase family protein  38.42 
 
 		 414 aa  297  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.061717 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2397  site-specific recombinase, phage integrase family  38.42 
 
 		 414 aa  297  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0835  site-specific recombinase, phage integrase family  38.42 
 
 		 414 aa  297  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.916453  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2026  integrase domain protein SAM domain protein  31.65 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1239  phage integrase  29.45 
 
 		 419 aa  149  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.183742 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0243  integrase family protein  35.11 
 
 		 408 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4357  integrase family protein  33.78 
 
 		 432 aa  139  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.196214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1215  integrase family protein  33.78 
 
 		 432 aa  139  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2984  integrase family protein  33.78 
 
 		 432 aa  139  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.443483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4387  integrase family protein  33.78 
 
 		 432 aa  139  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.864459  normal  0.927899 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8114  integrase/recombinase  31.27 
 
 		 408 aa  136  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200175  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8253  phage integrase family protein  31.49 
 
 		 409 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.564196  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7622  integrase family protein  31.65 
 
 		 405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.530017 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0423  integrase family protein  31.31 
 
 		 304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4018  phage integrase family protein  34.27 
 
 		 409 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6953  integrase family protein  31.73 
 
 		 405 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8262  integrase/recombinase  30.61 
 
 		 325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19921  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6461  phage integrase family protein  31.85 
 
 		 412 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5939  phage integrase family protein  31.75 
 
 		 395 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7460  integrase family protein  31.47 
 
 		 418 aa  121  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0602  phage integrase family protein  32.42 
 
 		 412 aa  117  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0372  integrase family protein  33.33 
 
 		 411 aa  116  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3698  integrase family protein  32.87 
 
 		 508 aa  116  7.999999999999999e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4004  integrase family protein  32.87 
 
 		 508 aa  116  7.999999999999999e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0777  integrase family protein  28.67 
 
 		 425 aa  112  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000241017 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  27.4 
 
 		 296 aa  110  7.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0770  integrase family protein  29.64 
 
 		 417 aa  109  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000130395 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4899  integrase family protein  31.33 
 
 		 419 aa  108  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2692  tyrosine recombinase XerD  27.93 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.457784  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0438  phage integrase  28.71 
 
 		 515 aa  107  5e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  28.62 
 
 		 295 aa  107  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  29.79 
 
 		 302 aa  105  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  27.3 
 
 		 305 aa  103  6e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0740  putative integrase  33.56 
 
 		 171 aa  103  6e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.650968  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2214  integrase domain protein SAM domain protein  25.09 
 
 		 417 aa  103  8e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000184093 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  29.93 
 
 		 301 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  25.17 
 
 		 310 aa  101  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1023  integrase family protein  26.94 
 
 		 297 aa  100  7e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0854512  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  25.61 
 
 		 295 aa  99.8  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  27.92 
 
 		 295 aa  99  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  28.42 
 
 		 309 aa  99  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  27.96 
 
 		 292 aa  98.2  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3264  phage integrase family protein  36.93 
 
 		 403 aa  98.2  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.860131  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3507  phage integrase family protein  37.5 
 
 		 403 aa  98.2  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.646395  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  28.62 
 
 		 295 aa  97.1  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2230  integrase family protein  37.5 
 
 		 403 aa  96.3  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2006  integrase family protein  37.5 
 
 		 403 aa  96.3  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5350  integrase family protein  37.5 
 
 		 403 aa  96.3  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.467969 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  27.7 
 
 		 315 aa  96.3  9e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  28.27 
 
 		 295 aa  96.3  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  26.03 
 
 		 296 aa  96.3  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  26.48 
 
 		 295 aa  95.1  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  27.96 
 
 		 292 aa  95.5  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  27.8 
 
 		 295 aa  95.5  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0476  tyrosine recombinase XerD  27.37 
 
 		 302 aa  94.4  3e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  26.44 
 
 		 313 aa  94.4  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  28.29 
 
 		 306 aa  94  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  29.89 
 
 		 294 aa  93.2  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  28.62 
 
 		 306 aa  93.2  8e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  26.76 
 
 		 295 aa  93.2  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  24.58 
 
 		 295 aa  92.8  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  31.4 
 
 		 294 aa  92.4  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  28.41 
 
 		 295 aa  92.4  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  24.58 
 
 		 295 aa  92.8  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  24.66 
 
 		 296 aa  92.8  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  22.74 
 
 		 299 aa  91.7  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  26.55 
 
 		 303 aa  92  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646575 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2797  tyrosine recombinase XerD  23.89 
 
 		 298 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1560  tyrosine recombinase XerD  30.5 
 
 		 331 aa  90.9  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.736869  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  24.92 
 
 		 304 aa  91.3  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  28.11 
 
 		 296 aa  90.5  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1906  integrase family protein  25.68 
 
 		 295 aa  90.9  4e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.713326  normal  0.217947 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  25.52 
 
 		 291 aa  90.5  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  25.77 
 
 		 309 aa  89.7  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  25.25 
 
 		 320 aa  88.2  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  28.52 
 
 		 313 aa  88.2  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1687  tyrosine recombinase XerD subunit  28.77 
 
 		 314 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  24.32 
 
 		 302 aa  88.6  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  23.1 
 
 		 295 aa  87.8  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1283  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.82 
 
 		 297 aa  87.8  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2169  tyrosine recombinase XerD  28.27 
 
 		 298 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  22.48 
 
 		 294 aa  87.8  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2159  tyrosine recombinase XerD  33 
 
 		 311 aa  87.8  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  26.57 
 
 		 308 aa  87.4  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0358  integrase family protein  23.79 
 
 		 287 aa  87.4  4e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  25.71 
 
 		 298 aa  87.4  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  25.71 
 
 		 298 aa  87.4  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.52 
 
 		 299 aa  87.4  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  25.68 
 
 		 302 aa  86.7  6e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.68 
 
 		 296 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  27.96 
 
 		 292 aa  86.7  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.68 
 
 		 296 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  22.54 
 
 		 296 aa  86.7  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0540  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.03 
 
 		 325 aa  86.3  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0147694  normal  0.75101 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.34 
 
 		 296 aa  86.7  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  25.09 
 
 		 296 aa  86.3  9e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>