More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_2279 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_2279  integrase family protein  100 
 
 		 394 aa  810    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0687446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3698  integrase family protein  40.63 
 
 		 508 aa  239  4e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4004  integrase family protein  40.63 
 
 		 508 aa  239  4e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8114  integrase/recombinase  36.71 
 
 		 408 aa  216  5e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200175  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0438  phage integrase  38.87 
 
 		 515 aa  206  8e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0372  integrase family protein  35.6 
 
 		 411 aa  162  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0423  integrase family protein  36.84 
 
 		 304 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5939  phage integrase family protein  28.73 
 
 		 395 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2230  integrase family protein  34.95 
 
 		 403 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2006  integrase family protein  34.95 
 
 		 403 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5350  integrase family protein  34.95 
 
 		 403 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.467969 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1271  phage integrase  30.87 
 
 		 410 aa  137  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.896321  normal  0.0119714 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5406  phage integrase family protein  31.79 
 
 		 381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.197458 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3264  phage integrase family protein  34.87 
 
 		 403 aa  130  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.860131  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7460  integrase family protein  28.61 
 
 		 418 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3507  phage integrase family protein  34.59 
 
 		 403 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.646395  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6461  phage integrase family protein  35.57 
 
 		 412 aa  127  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624578 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0602  phage integrase family protein  29.1 
 
 		 412 aa  123  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4899  integrase family protein  27.27 
 
 		 419 aa  111  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8253  phage integrase family protein  27.81 
 
 		 409 aa  109  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.564196  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0507  site-specific recombinase, phage integrase family  27.86 
 
 		 414 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2397  site-specific recombinase, phage integrase family  27.86 
 
 		 414 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0326  integrase family protein  27.86 
 
 		 414 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.061717 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0835  site-specific recombinase, phage integrase family  27.86 
 
 		 414 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.916453  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0669  integrase family protein  27.86 
 
 		 414 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0711  phage integrase  32.31 
 
 		 414 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.209263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0770  integrase family protein  26.32 
 
 		 417 aa  107  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000130395 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8262  integrase/recombinase  27.48 
 
 		 325 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19921  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1215  integrase family protein  26.88 
 
 		 432 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2984  integrase family protein  26.88 
 
 		 432 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.443483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4357  integrase family protein  26.88 
 
 		 432 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.196214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4387  integrase family protein  26.88 
 
 		 432 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.864459  normal  0.927899 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0243  integrase family protein  30.35 
 
 		 408 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0777  integrase family protein  26.77 
 
 		 425 aa  99.8  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000241017 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7595  integrase family protein  27.27 
 
 		 413 aa  96.7  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4018  phage integrase family protein  29.89 
 
 		 409 aa  95.9  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  26.62 
 
 		 303 aa  93.6  5e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1436  integrase family protein  33.7 
 
 		 641 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.27 
 
 		 299 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  25.38 
 
 		 298 aa  87.8  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  29.07 
 
 		 294 aa  86.3  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.29 
 
 		 299 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.8 
 
 		 301 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.78 
 
 		 299 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  29.59 
 
 		 309 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.8 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1239  phage integrase  30.88 
 
 		 419 aa  82.8  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.183742 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.32 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  26.42 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9020  integrase/recombinase  28.45 
 
 		 255 aa  82.4  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.8 
 
 		 299 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.8 
 
 		 299 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.8 
 
 		 299 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.8 
 
 		 299 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  28.27 
 
 		 295 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.8 
 
 		 299 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.36 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  26.3 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0684  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.7 
 
 		 324 aa  80.5  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.631001  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0537  tyrosine recombinase XerD subunit  28.12 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.25 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2022  tyrosine recombinase XerD subunit  28.03 
 
 		 309 aa  79  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  28.32 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  33.14 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  28.32 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.19 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  26.59 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0139  tyrosine recombinase XerD  27.52 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  27 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  28.51 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  25.17 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  27.66 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1659  tyrosine recombinase XerD  32.06 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  27.31 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  30.92 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0772  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.9 
 
 		 324 aa  77  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  29.33 
 
 		 303 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.1 
 
 		 299 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  25.52 
 
 		 295 aa  75.9  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  25.27 
 
 		 296 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02726  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.72 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0798  tyrosine recombinase XerD  27.72 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.966972  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3027  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.72 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  25.95 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3220  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.72 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  29.86 
 
 		 277 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  25.69 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4185  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.72 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02689  hypothetical protein  27.72 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.364794  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004441  site-specific recombinase XerD  28.87 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3314  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.72 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02665  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.76 
 
 		 336 aa  75.5  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3053  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.72 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  25.35 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0815  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.72 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.624778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  27.14 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3245  phage integrase family protein  30.55 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676462  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  29.95 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  26.01 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>