298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1436 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1436  integrase family protein  100 
 
 		 641 aa  1339    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2243  integrase family protein  39.22 
 
 		 634 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00308356 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3692  integrase family protein  32.29 
 
 		 412 aa  128  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8262  integrase/recombinase  30.33 
 
 		 325 aa  122  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19921  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4899  integrase family protein  29.91 
 
 		 419 aa  106  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2214  integrase domain protein SAM domain protein  27.54 
 
 		 417 aa  105  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000184093 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1333  Integrase  26.81 
 
 		 400 aa  100  7e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.455073  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0312  Integrase  26.81 
 
 		 400 aa  99.8  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0150741  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0032  Integrase  26.81 
 
 		 400 aa  99.8  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.857579  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1804  Integrase  26.81 
 
 		 400 aa  99.8  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.222465  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8253  phage integrase family protein  25.78 
 
 		 409 aa  97.4  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.564196  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7460  integrase family protein  29.55 
 
 		 418 aa  91.3  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8114  integrase/recombinase  30.89 
 
 		 408 aa  87  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200175  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0770  integrase family protein  28.27 
 
 		 417 aa  84.7  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000130395 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5939  phage integrase family protein  26.02 
 
 		 395 aa  84  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9020  integrase/recombinase  28.37 
 
 		 255 aa  82.4  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2230  integrase family protein  28.51 
 
 		 403 aa  81.6  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5350  integrase family protein  28.51 
 
 		 403 aa  81.6  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.467969 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2006  integrase family protein  28.51 
 
 		 403 aa  81.6  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0372  integrase family protein  29.14 
 
 		 411 aa  81.6  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3507  phage integrase family protein  28.51 
 
 		 403 aa  81.3  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.646395  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6461  phage integrase family protein  24.83 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624578 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3698  integrase family protein  29.67 
 
 		 508 aa  79  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4004  integrase family protein  29.67 
 
 		 508 aa  79  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5406  phage integrase family protein  25.82 
 
 		 381 aa  77.8  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.197458 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3264  phage integrase family protein  24.29 
 
 		 403 aa  77.8  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.860131  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2984  integrase family protein  26.74 
 
 		 432 aa  77.4  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.443483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1215  integrase family protein  26.74 
 
 		 432 aa  77.4  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4357  integrase family protein  26.74 
 
 		 432 aa  77.4  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.196214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4387  integrase family protein  26.74 
 
 		 432 aa  77.4  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.864459  normal  0.927899 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0423  integrase family protein  23.48 
 
 		 304 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0438  phage integrase  30.81 
 
 		 515 aa  76.3  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0777  integrase family protein  25.94 
 
 		 425 aa  76.6  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000241017 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0243  integrase family protein  26.96 
 
 		 408 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2279  integrase family protein  33.7 
 
 		 394 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0687446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0326  integrase family protein  27.44 
 
 		 414 aa  73.6  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.061717 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0669  integrase family protein  27.44 
 
 		 414 aa  73.6  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0507  site-specific recombinase, phage integrase family  27.44 
 
 		 414 aa  73.6  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0835  site-specific recombinase, phage integrase family  27.44 
 
 		 414 aa  73.6  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.916453  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2397  site-specific recombinase, phage integrase family  27.44 
 
 		 414 aa  73.6  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4018  phage integrase family protein  29.09 
 
 		 409 aa  71.6  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  25.76 
 
 		 311 aa  70.5  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0602  phage integrase family protein  28.3 
 
 		 412 aa  70.1  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  26.09 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7595  integrase family protein  24.23 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  26.09 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  25.69 
 
 		 342 aa  67  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.53 
 
 		 299 aa  66.6  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.72 
 
 		 300 aa  66.6  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.53 
 
 		 299 aa  66.6  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0711  phage integrase  27.87 
 
 		 414 aa  66.6  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.209263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.53 
 
 		 299 aa  67  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.53 
 
 		 299 aa  66.2  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.91 
 
 		 299 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1239  phage integrase  27.49 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.183742 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0740  putative integrase  23.75 
 
 		 171 aa  65.9  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.650968  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.53 
 
 		 299 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2544  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.55 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.53 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.53 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.4 
 
 		 301 aa  62.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.15 
 
 		 299 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.48 
 
 		 300 aa  63.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  23.53 
 
 		 297 aa  62  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6953  integrase family protein  29.7 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7622  integrase family protein  29.7 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.530017 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0431  phage integrase  24.79 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.173073 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  26.61 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1283  phage integrase family protein  22.68 
 
 		 304 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000135681  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  24.48 
 
 		 324 aa  60.5  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.92 
 
 		 317 aa  60.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0537  tyrosine recombinase XerD subunit  24.2 
 
 		 302 aa  59.7  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.09 
 
 		 311 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1271  phage integrase  26.52 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.896321  normal  0.0119714 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3762  phage integrase  20.86 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.288729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  23.7 
 
 		 294 aa  59.3  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  21.55 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  23.81 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.96 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  24.24 
 
 		 310 aa  57  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1906  integrase family protein  25 
 
 		 295 aa  56.6  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.713326  normal  0.217947 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2654  tyrosine recombinase XerD  21.6 
 
 		 306 aa  56.2  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.97 
 
 		 321 aa  55.5  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  24.5 
 
 		 304 aa  55.5  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  24.34 
 
 		 317 aa  55.1  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3847  site-specific tyrosine recombinase XerD  25 
 
 		 299 aa  55.1  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.349121 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0879  site-specific tyrosine recombinase XerD  25 
 
 		 299 aa  55.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.201006  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0920  site-specific tyrosine recombinase XerD  25 
 
 		 299 aa  55.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.77 
 
 		 299 aa  54.7  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  23.08 
 
 		 295 aa  54.3  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  21.68 
 
 		 318 aa  54.3  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004441  site-specific recombinase XerD  23.43 
 
 		 305 aa  54.3  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0645  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.6 
 
 		 299 aa  54.3  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.241995  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2992  tyrosine recombinase XerD  26.78 
 
 		 308 aa  53.9  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3108  integrase family protein  23.85 
 
 		 292 aa  53.9  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512092  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  22.83 
 
 		 304 aa  53.9  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  23.96 
 
 		 306 aa  53.9  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0519  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.5 
 
 		 302 aa  53.5  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0998774  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  23.86 
 
 		 299 aa  53.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3960  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.3 
 
 		 311 aa  53.5  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011638  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>