More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3762 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3762  phage integrase  100 
 
 		 379 aa  785    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.288729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5219  integrase family protein  29.65 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.759008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0684  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.68 
 
 		 324 aa  65.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.631001  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0772  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.43 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1611  tyrosine recombinase  23.86 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  26.33 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  26.67 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11843  putative transposase  26.64 
 
 		 416 aa  62.4  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.383494  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  26.29 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_013223  Dret_0891  integrase family protein  25.52 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.180709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  28.49 
 
 		 354 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  28.49 
 
 		 354 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  25.99 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1436  integrase family protein  20.86 
 
 		 641 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2484  phage integrase  24.34 
 
 		 304 aa  59.3  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.72317  normal  0.0269236 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1026  integrase family protein  31.51 
 
 		 283 aa  58.9  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319361  normal  0.791294 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  27.83 
 
 		 317 aa  58.9  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0952  integrase family protein  28.5 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571908  normal  0.0199815 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2366  integrase family protein  28.64 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  24.45 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1659  tyrosine recombinase XerD subunit  26.26 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5431  tyrosine recombinase XerD  25.86 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.060431  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.83 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2815  integrase/recombinase XerD  24.49 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  25.19 
 
 		 308 aa  57  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4231  integrase/recombinase  29.18 
 
 		 322 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000145909  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.61 
 
 		 299 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1481  phage integrase family protein  23.67 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0281722  normal  0.205606 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.26 
 
 		 299 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0585  integrase family protein  29.24 
 
 		 251 aa  55.8  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2739  integrase/recombinase XerD  26.18 
 
 		 321 aa  55.8  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0974  integrase family protein  28.25 
 
 		 430 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0711773  normal  0.0223597 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2147  phage integrase family protein  29.45 
 
 		 367 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5291  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.77 
 
 		 299 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.23 
 
 		 299 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.96 
 
 		 299 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1585  site-specific recombinase XerD-like  25.71 
 
 		 332 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.264485  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.23 
 
 		 299 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  23.51 
 
 		 295 aa  55.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3062  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.22 
 
 		 308 aa  55.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0924  phage integrase family protein  26.6 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.852644  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2383  integrase family protein  25.96 
 
 		 338 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000443336  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0569  integrase family protein  30.81 
 
 		 251 aa  55.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0286562 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4202  integrase family protein  24.02 
 
 		 406 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1023  integrase family protein  27.43 
 
 		 297 aa  54.7  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0854512  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  24.65 
 
 		 295 aa  54.7  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  23.35 
 
 		 311 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  24.54 
 
 		 298 aa  54.3  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  27.11 
 
 		 349 aa  54.7  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1137  phage integrase  26.34 
 
 		 296 aa  54.3  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  26.18 
 
 		 305 aa  54.3  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2367  phage integrase family protein  31.58 
 
 		 211 aa  54.3  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.683007  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.23 
 
 		 299 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.23 
 
 		 299 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06590  site-specific recombinase, integrase family  27.94 
 
 		 312 aa  54.3  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0527476  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.55 
 
 		 301 aa  53.9  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.23 
 
 		 299 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20700  site-specific recombinase, integrase family  27.94 
 
 		 395 aa  53.9  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  21.69 
 
 		 307 aa  53.5  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.61 
 
 		 299 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2593  integrase family protein  22.46 
 
 		 291 aa  53.5  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  22.22 
 
 		 308 aa  53.5  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  23.59 
 
 		 295 aa  53.5  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  24.05 
 
 		 312 aa  53.1  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0753  tyrosine recombinase XerD subunit  22.34 
 
 		 297 aa  53.1  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000038176  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  24.68 
 
 		 311 aa  53.1  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0401  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.96 
 
 		 324 aa  53.1  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.145415 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  25.86 
 
 		 295 aa  52.8  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  20.51 
 
 		 295 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1466  Tn554-related, transposase A  23.71 
 
 		 370 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000354684  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  26.45 
 
 		 301 aa  52.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0145  integrase family protein  29.93 
 
 		 411 aa  52.8  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.468231  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  25.84 
 
 		 310 aa  52.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47730  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.11 
 
 		 299 aa  52.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0435757  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  26.67 
 
 		 304 aa  52.8  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  29.67 
 
 		 310 aa  52.4  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0222  integrase/recombinase XerC  27.74 
 
 		 299 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  27.23 
 
 		 300 aa  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0177  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.38 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0539  integrase family protein  31.08 
 
 		 436 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.19804 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2512  tyrosine recombinase XerD  24.03 
 
 		 328 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234856 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3407  integrase family protein  27.85 
 
 		 325 aa  51.6  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2440  tyrosine recombinase XerD  24.48 
 
 		 332 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5117  tyrosine recombinase XerD  29.07 
 
 		 327 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  25.91 
 
 		 318 aa  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  26.7 
 
 		 365 aa  51.2  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0404  integrase family protein  24.77 
 
 		 320 aa  51.2  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000863146  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5501  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.2 
 
 		 299 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0893  tyrosine recombinase XerD  23.67 
 
 		 304 aa  51.2  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0105661 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1839  phage integrase family protein  27.12 
 
 		 193 aa  50.8  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.637517  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  28.65 
 
 		 284 aa  51.2  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3403  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.31 
 
 		 313 aa  51.2  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  27.18 
 
 		 423 aa  51.2  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2735  tyrosine recombinase XerD  24.03 
 
 		 328 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.206607 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2544  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.08 
 
 		 308 aa  50.8  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  22.22 
 
 		 295 aa  50.8  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  26.12 
 
 		 294 aa  50.8  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1434  phage integrase family protein  21.19 
 
 		 322 aa  50.4  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0776  phage integrase  22.75 
 
 		 334 aa  50.8  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228831  normal  0.0322595 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1283  phage integrase family protein  23.03 
 
 		 304 aa  50.4  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000135681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>