More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3403 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3403  site-specific tyrosine recombinase XerC  100 
 
 		 313 aa  617  1e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1916  site-specific tyrosine recombinase XerC  71.38 
 
 		 315 aa  436  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.391518  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0942  site-specific tyrosine recombinase XerC  69.77 
 
 		 315 aa  436  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1844  site-specific tyrosine recombinase XerC  71.06 
 
 		 315 aa  435  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.104424  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4114  site-specific tyrosine recombinase XerC  69.58 
 
 		 322 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2933  site-specific tyrosine recombinase XerC  69.87 
 
 		 313 aa  408  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.83049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3661  site-specific tyrosine recombinase XerC  67.95 
 
 		 311 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3960  site-specific tyrosine recombinase XerC  67.42 
 
 		 311 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0536  site-specific tyrosine recombinase XerC  60.47 
 
 		 300 aa  335  9e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.538013  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0401  site-specific tyrosine recombinase XerC  57.42 
 
 		 324 aa  333  3e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.145415 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0083  site-specific tyrosine recombinase XerC  54.4 
 
 		 322 aa  332  5e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0177  site-specific tyrosine recombinase XerC  58.06 
 
 		 323 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0426  site-specific tyrosine recombinase XerC  59.12 
 
 		 321 aa  328  5.0000000000000004e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0271  site-specific tyrosine recombinase XerC  58.78 
 
 		 351 aa  322  6e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28022  normal  0.462537 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0180  site-specific tyrosine recombinase XerC  55.7 
 
 		 324 aa  322  8e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0553  site-specific tyrosine recombinase XerC  56.77 
 
 		 329 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172687  normal  0.167276 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1177  integrase family protein  58.5 
 
 		 329 aa  318  1e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.151473 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3124  integrase family protein  56.61 
 
 		 323 aa  309  4e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4655  tyrosine recombinase XerC  55.59 
 
 		 365 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.223284 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4288  tyrosine recombinase XerC  55.59 
 
 		 365 aa  308  8e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.710874 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4805  tyrosine recombinase XerC  55.59 
 
 		 367 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104736  normal  0.146847 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0163  integrase family protein  53.87 
 
 		 342 aa  306  4.0000000000000004e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.70922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0247  integrase family protein  52.1 
 
 		 322 aa  298  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121071  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1457  integrase family protein  53.56 
 
 		 326 aa  289  5.0000000000000004e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3189  integrase family protein  51.42 
 
 		 320 aa  288  9e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303256 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2809  phage integrase family protein  49.17 
 
 		 311 aa  286  2.9999999999999996e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1220  site-specific tyrosine recombinase XerC  48.87 
 
 		 330 aa  277  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1030  site-specific tyrosine recombinase XerC  51.53 
 
 		 307 aa  277  2e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2501  site-specific tyrosine recombinase XerC  51.14 
 
 		 312 aa  275  7e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  0.936606 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0928  integrase family protein  51.28 
 
 		 326 aa  275  8e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.669409 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5002  hypothtical protein  50.85 
 
 		 308 aa  269  5e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0748381  hitchhiker  0.0000000255834 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1222  site-specific tyrosine recombinase XerC  51.88 
 
 		 306 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.120622 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2381  site-specific tyrosine recombinase XerC  51.19 
 
 		 311 aa  265  8.999999999999999e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0563  site-specific tyrosine recombinase XerC  52.9 
 
 		 306 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.792208  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2215  site-specific tyrosine recombinase XerC  52.9 
 
 		 306 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  51.52 
 
 		 313 aa  258  8e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2064  phage integrase  47.87 
 
 		 297 aa  247  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0259  phage integrase  49.83 
 
 		 297 aa  246  3e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.389161 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0238  site-specific tyrosine recombinase XerC  48.01 
 
 		 306 aa  245  8e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0625179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0602  site-specific tyrosine recombinase XerC  46.96 
 
 		 324 aa  240  2.9999999999999997e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926796 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0341  phage integrase family site specific recombinase  40.27 
 
 		 311 aa  238  1e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0666  Phage integrase, N-terminal SAM- like  39.6 
 
 		 310 aa  237  2e-61  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.555034  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0222  phage integrase family protein  48.46 
 
 		 308 aa  231  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0752  phage integrase family site specific recombinase  38.98 
 
 		 309 aa  219  3.9999999999999997e-56  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.232674  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0447  phage integrase family site specific recombinase  38.59 
 
 		 307 aa  199  3.9999999999999996e-50  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  41.12 
 
 		 332 aa  188  8e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  43.71 
 
 		 311 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0688  integrase family protein  34.78 
 
 		 336 aa  179  7e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  41.47 
 
 		 304 aa  177  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0194  tyrosine recombinase XerC subunit  36.72 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  39.66 
 
 		 304 aa  176  5e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0564  tyrosine recombinase XerC subunit  34.1 
 
 		 328 aa  176  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  39.39 
 
 		 298 aa  176  6e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  41.03 
 
 		 342 aa  175  9e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1624  phage/XerD family site-specific recombinase  34.55 
 
 		 341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.389199 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0222  integrase/recombinase XerC  36.86 
 
 		 299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.2 
 
 		 299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  38.16 
 
 		 294 aa  172  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  36.42 
 
 		 308 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0582  integrase family protein  32.5 
 
 		 330 aa  172  6.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.132855 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  36.77 
 
 		 335 aa  172  7.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6023  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.2 
 
 		 303 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0840  integrase family protein  33.56 
 
 		 294 aa  171  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.774041 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  40.07 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  38.93 
 
 		 294 aa  171  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  36.39 
 
 		 291 aa  170  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00203  tyrosine recombinase  34 
 
 		 306 aa  171  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3450  tyrosine recombinase XerD  35.62 
 
 		 322 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0801  phage integrase family protein  37.27 
 
 		 326 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1299  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.23 
 
 		 291 aa  170  3e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.78 
 
 		 299 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  39.74 
 
 		 343 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0736  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.16 
 
 		 294 aa  169  5e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69710  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.2 
 
 		 303 aa  168  9e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.737312  normal  0.478185 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3258  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.76 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.706598  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  31.89 
 
 		 295 aa  167  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0195  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.76 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3428  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.76 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2920  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.76 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.510567  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2169  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.76 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.126979  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0611  integrase family protein  32.08 
 
 		 337 aa  167  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2528  tyrosine recombinase XerC  40.6 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.237042 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0392  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.45 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0347  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.92 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.45 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3697  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.18 
 
 		 328 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3082  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.83 
 
 		 306 aa  166  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.633641  normal  0.120316 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0409  Phage integrase  40.54 
 
 		 317 aa  166  5e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.383536  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4330  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.81 
 
 		 298 aa  166  5e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4271  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.81 
 
 		 298 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4168  tyrosine recombinase XerC  34.81 
 
 		 298 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4196  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.81 
 
 		 298 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0689633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1762  phage/XerD family site-specific recombinase  31.56 
 
 		 338 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.81 
 
 		 298 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0208532 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4036  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.81 
 
 		 298 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0264  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.86 
 
 		 315 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0242  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.27 
 
 		 299 aa  165  8e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.322874  normal  0.826572 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0645  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.39 
 
 		 299 aa  165  9e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.241995  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3550  integrase family protein  37.1 
 
 		 324 aa  164  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0497  tyrosine recombinase XerC  37.25 
 
 		 324 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.237269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>